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号。 类型 数据。 标签 设置发布数据的标签。 最多支持设置5个标签。 短描述 为发布的数据设置的简要描述。 图片 展示在资产市场的图片。要求如下： 格式：svg,png,jpg,jpeg 尺寸：16 * 9 大小：不超过20KB 描述 针对此数据的相关描述。 单击“立即发布”。
尾。 类型 应用。 标签 设置发布应用的标签。 最多支持设置5个标签。 短描述 为发布的应用设置的简要描述。 图片 展示在资产市场的图片。要求如下： 格式：svg,png,jpg,jpeg 尺寸：16 * 9 大小：不超过20KB 描述 针对此应用的相关描述。 单击“立即发布”。
号。 类型 镜像。 标签 设置发布镜像的标签。 最多支持设置5个标签。 短描述 为发布的镜像设置的简要描述。 图片 展示在资产市场的图片。要求如下： 格式：svg,png,jpg,jpeg 尺寸：16 * 9 大小：不超过20KB 描述 针对此镜像的相关描述。 单击“立即发布”。
docker pull bbimber/discvrseq:release-1.17 制作bwa-mem镜像 在本地搭建Docker环境。 要求安装的容器引擎版本必须为1.11.2及以上。 下载bwa和samtools软件。 wget http://downloads.sourceforge
{Endpoint} / {resource-path} ? {query-string} 尽管请求URI包含在请求消息头中，但大多数语言或框架都要求您从请求消息中单独传递它，所以在此单独强调。 表1 请求URI 参数 说明 URI-scheme 传输请求的协议，当前所有API均采用HTTPS协议。
M账号）。 在账号中心左侧导航栏中有“我的主账号”页签，则说明是子账号；没有“我的主账号”页签，则说明是主账号。 图1 查看账号信息 联系技术支持开通白名单。 需要提供账号名，账号ID，项目ID等信息。相关信息获取方式如下： 使用华为云账号登录后，在右上角账号下选择“我的凭证”。
执行分析作业 创建分析作业 登录医疗智能体平台，进入项目并选择“工具 > 流程”页签，单击NGS流程行的“启动作业”。 请参考配置输入和依赖数据章节，设置NGS流程数输入数据。 在新建作业页面，填写作业信息。 基本信息：包含作业名称、标签、描述。 输出路径：存放输出结果的路径，格
订阅的流程将显示在“项目管理 > 工具”页面的流程列表中。 步骤2：上传待分析数据 您在使用NGS流程前，请先上传待分析的数据，上传数据方法请参见数据管理。数据要求是成对的双端测序样本，即您需要上传两个样本数据文件，例如：xxx.R1.fastq.gz和xxx.R2.fastq.gz。 步骤3：创建分析作业
k启动用户为health-user，流程作业默认启动用户为root。 平台提供了必要的加固措施以保证容器安全、隔离性及数据安全，但由于容器技术本身的限制，仍可能存在容器逃逸等问题，进而导致越权访问。 为避免此类问题发生，请您确保上传镜像来源的合法性、有效性，禁止上传未知来源、恶意程序等非法镜像。
用户组B里有50个用，两者之间有10个用户重复，那么同时选择用户组A和B，统计时显示已选择90个用户。 如果导入后用户状态显示异常，需联系技术支持处理。 单击“下一步”，设置角色。设置是否为“系统管理员”。 配置完成后，单击“确定”。 等待导入成功后，单击“关闭”。可以在用户管理页面查看导入成功的用户信息。
用户组B里有50个用，两者之间有10个用户重复，那么同时选择用户组A和B，统计时显示已选择90个用户。 如果导入后用户状态显示异常，需联系技术支持处理。 单击“下一步”，设置角色。 角色：支持管理员和操作员两种角色，默认为操作员。权限描述可以参考表2。 用户资源配额：设置用户的个人资源配额。详细请参考个人资源配额。
Calling，输出变异检测结果。 基因组变异检测质控 通过VariantQC对vcf进行质量控制，输出变异数目，变异类型统计等指标。 流程优势 使用Unix管道技术连接比对和排序步骤，以缩短bwa和samtools的存放、读取、删除中间文件的时间。 流程针对GATK4中的限速步骤，进行了系统的优化加速
name is too long. 检查文件名长度是否符合要求。 400 eihealth.01090021 Invalid nextflow params file name. 检查nextflow流程参数文件名称是否符合要求，后缀只能是.yaml、.json、.yml、.txt 400
分子搜索 可自定义数据库，以用户输入的参考化合物结构为起点，可以按照相似度或者骨架从小分子数据库中搜索到相似结构和排序，可实现百亿级小分子的秒级搜索。 单击“分子搜索”功能卡片，进入分子搜索页面。 在配置页面，进行分子搜索配置，包括输入小分子、选择搜索算法、选择输出个数。 图1 分子搜索页面
# 必选 # 命令列表 - xxx resources: # 必选 # 运行环境要求 cpu_type: X86 # 必选 # 'CPU架构，如X86、ARM' cpu:
flow-id。获取到的作业信息如图1所示。 图1 NGS作业信息 health get job -s命令获取启动分析作业的模板。依据模板要求，将步骤3中获取到的NGS作业信息和workflow-id填充至模板中，修改好的配置文件示例请参见NGS配置文件示例。 请将该模板保存为.
查询结果中，引用的对象使用*标识。如果使用<project-name>:<path>方式列举，project-name必须是已经引用了的，要求path格式是绝对路径。如果path是文件夹，则后面要加/标识。当cd到其他项目路径时，如果要查看本项目内容，使用绝对路径即可，如：health
节省20%的时间，助力脑科学研究的效率提升。 AutoGenome AutoGenome为Notebook镜像，是一个利用AutoML等技术帮助科研工作者在基因组学数据上端到端实现深度学习网络搜索，训练，评估，预测和解释的工具包。 数据 人基因组数据 GRch38-refere
切换路径 使用cd命令在EIHealth项目中切换数据路径。 命令结构 health cd <path> 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 当前目录，不进行跳转。 health cd
CPI预测 CPI预测基于蛋白质的一级序列和化合物的2D结构进行靶点匹配，精确的预测化合物-蛋白相互作用。 单击“CPI预测”功能卡片，进入配置页面。 配置靶点文件。 支持3种输入方式，分别是输入氨基酸序列、选择文件、输入PDB ID 输入FASTA格式氨基酸序列，输入框最多支持
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