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该任务指导用户在已配置好的弹性云服务器上,运行社区MPI应用(3.1.1版本)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 登录用户为创建弹性云服务器时指定的用户名。 执行以下命令,防止系统超时退出。
动自带的MPI应用(3.0.0rc6版本)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 登录用户为创建弹性云服务器时指定的用户名。 执行以下命令,防止系统超时退出。
多节点批量删除操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“节点管理”; 在“节点管理”页面集群的下拉框切换到要进行节点操作的集群。 可同时在节点列表左侧勾选多个要进行删除操作的节点,单击集群名称左侧的“删除”。 按需类型节点批量删除 选择是否删除云服务器资源,如勾选,连同云服务器一同删除,如不勾选
依次登录集群中其他ECS,重复执行步骤1~4。 执行以下命令,验证参加测试的ECS之间是否可以免密码互相登录。 假设集群中有2个弹性云服务器,另一个云服务器的主机名为hostname2,则命令行为: $ ssh 用户名@SERVER_IP $ ssh hostname2 父主题: 弹性云服务器场景典型应用
lib/linux_amd64 export MPI_IB_PKEY=2.a中获取的pkey $source ~/.bashrc 如果存在多个pkey,使用英文逗号隔开。 执行以下命令,检查环境变量是否配置成功。 # which mpirun 图3 检查环境变量 在单个BMS上运行Platform
件拷贝至“/share”目录。 make mpi 步骤3 配置lammps 算例输入文件。 以melt为例,生成一个算例melt.in文件。设置每迭代100步生成一个checkpoint文件,假定该文件存放在共享目录“/share”中。内容如下: # 3d Lennard-Jones
b/linux_amd64 export MPI_IB_PKEY=步骤2.1中获取的pkey $source ~/.bashrc 如果存在多个pkey,使用英文逗号隔开。 执行以下命令,检查环境变量是否配置成功。 # which mpirun 图3 Platform MPI环境变量导入成功
态、所在区域、虚拟私有云、安全组、节点信息以及共享存储以及集群的关系图等信息。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。 在“集群管理”页面选择要查看的集群,单击集群名称查看集群详情页。 在集群的详情页面可查看集群ID、状态、所在区域、虚拟私有云、安全组、节点
Server根据该标识来区分客户端分配IP地址。 HPC解决方案当前采用的是DHCP方式的IPoIB方案,实现IP地址自动化发放和配置。 IPoIB的约束和限制 支持管理一个IB网卡。 继承BMS、H2型、HL1型、HI3型云服务器对IB网卡的使用约束与限制,使用IPoIB特性的弹性云服务器不支持迁移。 继承H
验证MPI运行在RoCE网络上 执行以下命令,安装iproute2。 yum -y install iproute* 执行以下命令,查看RoCE上是否有流量。 rdma res show 若MPI运行中,回显结果中qp 数量较大(大于1),则证明运行在 RoCE 网络上: 无业务时 有业务时
规格:公有云提供了多种类型的弹性云服务器供您选择,单击下拉框进行选择; 系统盘:根据所需要的选择磁盘类型和大小; 网络配置。 集群扩容时,网络配置包括“虚拟私有云”、“安全组”以及“网卡”不可选,和集群初始创建时保持一致。 选择“镜像”。 推荐使用公共镜像,其他类型镜像可能出现扩容时自动部署失败的情况。
裸金属服务器场景支持使用的MPI HPC当前支持的MPI包括: 驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 以下小节的内容详细介绍了MPI的安装与使用,您可以根据需要选择合适的MPI进行安装。 父主题: 安装和使用MPI(X86
HPC-S²应用场景与使用限制 HPC-S²应用场景 计算资源创建:HPC-S²支持一键式报价和一键式购买HPC集群,并在创建集群时自动部署所配置的调度器、域控制器以及运行时的依赖。 计算资源配置:HPC-S²支持计算资源的多种配置管理,包括集群管理、节点管理、扩容集群节点及资源状态查看等。
安装和使用社区OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行社区OpenMPI(以4.0.2版本为例))。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装社区OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。
社区OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行社区OpenMPI(以3.1.1版本为例)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装社区OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。
IB驱动自带的OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行IB驱动自带的MPI应用(3.1.0rc2版本)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装IB驱动自带的OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。
安装和使用IB驱动自带的Open MPI 操作场景 该任务指导用户在鲲鹏BMS集群上运行IB驱动自带的MPI应用(以版本4.0.2a1为例)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装IB驱动自带的OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。
Spectrum MPI 操作场景 本节指导用户安装和使用IBM Spectrum MPI(以IBM Spectrum MPI v10.1为例)。 其中,IBM Spectrum MPI v10.1版本当前支持的操作系统列表如下: IBM Spectrum MPI 10.1.0.1