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参数说明 参数 简写 是否必选 说明 data-job-id 无 是 数据作业id。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。
rcproject为源项目名称,可选。不指定srcproject时,默认为当前项目。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。
image-name 无 是 镜像名称。 tag-name 无 是 镜像tag名称。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 health docker pull demo-project/demo-image:v1.0 # 执行成功返回结果如下
参数说明 参数 简写 是否必选 说明 data-job-id 无 是 数据作业id。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。
rcproject为源项目名称,可选。不指定srcproject时,默认为当前项目。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。
用名称”是选填项,可以使用原有名称,或自定义。 图2 导入应用 单击“确定”,导入应用,导入过程中可以查看每个应用的导入状态。 父主题: 工具管理
路径在新建流程和运行分析作业时可指定。 新建流程 单击“新建流程”,进入流程设计器页面。 流程设计器是一种用于创建、查看、修改流程的图形化工具,详细介绍请参见流程设计器。新建流程时,自动保存默认打开。 图1 新建流程 填写流程参数信息,填写完成后单击“确定”。 填写流程基本参数,
”。 图1 编辑应用 在编辑应用页面,可以修改相关的参数。相关参数描述可参考新建应用。 如果更改了版本号,相当于新建一个应用。 父主题: 工具管理
-d 否 归档描述。 --delete -l 否 是否删除已归档数据(默认false)。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 --storage-type -s 否 归档的存储类型,支持STANDARD和COLD。 命令示例 本节以Windows
获取完整的描述信息。 --chip -c 否 镜像芯片类型,只支持ARM或者X86。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 Linux ./health docker update lmx-project-01/demo-image --type
--downloadPath -d 否 获取应用详情时,将内容下载到的指定文件夹路径(文件夹需要存在)。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 --label -l 否 根据label标签搜索应用。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-tool
划线、下划线、小数点和斜线。 如果输出参数为Enum类型,需填写有效值,并在有效值中选择默认值。 单击“立即创建”,创建应用。 父主题: 工具管理
进入资产市场,分别订阅fasp,bwa-mem,bamqc,picard-insertsize应用。 图1 订阅应用 可以在“工具 > 应用”列表可以看到刚刚订阅的应用。 图2 查看订阅的应用 步骤2:新建流程 在“工具 > 流程”页面,单击“新建流程”按钮,填写流程名称,版本等信息。 图3 新建流程 利用拖拽的
--type -t 否 查询某个类型的镜像,可选APP、NOTEBOOK、OTHER。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 查询当前所在项目demo-project下面的类型为APP的镜像。 health docker images -t
导入用户 盘古辅助制药平台支持把IAM子用户导入至平台子用户。通过导入已有子用户,增加用户使用的便捷度,方便用户维护账号。 使用管理员账户登录盘古辅助制药平台。 在右上角用户名中选择“用户管理”。 在用户管理页面,单击“导入用户”,进入“导入用户”页面。 在导入用户页面,可以选择“用户”或者“用户组”进行导入。
选择需要引用的项目以及项目中的流程,选择流程的版本。“导入流程名称”是选填项,可以使用原有名称,或自定义。 图2 导入流程 单击“确定”,导入流程。 父主题: 工具管理
表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 template-id 无 是 模板id。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。
最多挂载5个。 格式为ProjectName:/path,多个路径用分号(;)隔开。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。
至平台子用户。通过导入已有子用户,增加用户使用的便捷度,方便用户维护账号。 IAM用户导入只支持使用Domain用户导入。 使用管理员账户登录医疗智能体平台。 在右上角用户名中选择“用户管理”。 图1 用户管理 在用户管理页面,单击“导入用户”,进入“导入用户”页面。 在导入用户
基于二代测序的基因组突变检测 NGS流程简介 配置命令行工具 上传数据 制作并上传镜像 创建应用 搭建NGS流程 执行分析作业 批量执行NGS分析