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表1 参数说明 参数 说明 名称 设置归档数据的名称。归档名称长度为1-100。 描述 归档数据描述信息。 归档类型 选择归档数据存储类型。默认为标准存储。 标准存储：适合高性能，高可靠，高可用，频繁访问场景。 归档存储：适合长期存储，平均一年访问一次。 说明： 归档存储的费用为单独计费。
选择资产市场中订阅的Docking Summary流程。 配体分子 选择上传的配体小分子文件。 受体蛋白 选择上传的受体蛋白文件夹。这里会默认用文件夹里面所有的蛋白质和配体小分子文件里面的小分子进行一一对接。 超时时间 根据受体配体对个数进行调整，一个受体配体对对接大约需要25s。
面。 在配置页面上传靶点结构，及配置其他参数。 图1 查看配置页面 靶点结构：选择靶点结构文件，仅支持PDB格式。若文件中包含多个受体，则默认只处理第一个。 设计方式：支持“从头生成”和“片段优化”两种方式。 从头生成：通过指定的口袋生成小分子。 可以直接指定口袋，指定口袋的方式
EIHealth中的流程由应用搭建形成，应用包含了数据的输入、输出等参数定义。 应用呈现的信息在创建应用过程中定义，包含参数名称、数据类型、描述、默认值等。 单击参数名称，可查看参数的详细信息。 单击输入参数图标，可指定输入数据路径。输出数据路径在新建流程和运行分析作业时可指定。 新建流程
受体，默认只处理第一个。受体文件支持上传1个或者多个文件，最多支持输入20个受体文件，文件来源包含数据中心、PDB库、示例数据。 图1 上传受体文件 受体预处理参数配置。 去水：去掉受体蛋白里面的水分子。 去金属离子：去掉受体蛋白里面的金属离子。 去水、去金属离子参数默认是勾选状
的数值后，系统将自动清除。 在平台右上角用户名中选择“系统设置”，设置作业的最多保留条数。已完成作业保留数量最少1万条，最多1000万条，默认设置为500万条。已有作业条数表示系统所有用户的作业总条数。 图1 设置作业保留条数 设置消息保留条数 您可以在系统设置中设置消息最多保留
文件的最后修改时间不一致。 --parallel -p 否 上传文件时，每个分段上传任务数的最大并发数，默认为5。取值范围[1,10]。 --jobs -j 否 上传文件夹时，批量任务的最大并发数，默认为5。取值范围[1,10]。 --fr -R 否 上传对象时生成结果清单文件。 --arcDir
--jobs -j 否 下载文件夹时，批量任务的最大并发数，默认为5。取值范围[1,10]。 --fr -R 否 下载对象时生成结果清单文件。 --tempFileDir -D 否 分段下载时保存临时文件的文件夹，默认为配置文件中的defaultTempFileDir。 如果该值
字母数字开头结尾。 项目创建成功后，不支持修改名称。 描述 设置项目描述。 图2 创建项目 单击“确认”，创建一个新的项目。 项目的创建者默认拥有项目的完整权限，同时项目可以分享给其他用户，并限定其他用户的访问权限。项目角色为项目粒度权限控制，同一用户在不同的项目上可能拥有不同的角色。
否 查询类型，默认detail。此参数用于获取作业列表。 取值：logs、detail、reports 。 logs：获取job日志。 detail：获取job详情。 reports：获取job报告 。 --sortDir -d 否 排序规则，按创建时间排序，默认DESC。此参数用于获取作业列表。
1-128]，单位C，支持一位小数。对于应用，不填默认1C；对于流程和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用 最小长度：0 最大长度：24 cpu_type String cpu架构类型，不填默认X86 最小长度：0 最大长度：24 memory
参数名称：fq-file1 数据类型：File 必传：是 默认值：/fastp_1.fq.gz 参数2 参数名称：fq-file2 数据类型：File 必传：是 默认值：/fastp_2.fq.gz 参数3 参数名称：json-file 数据类型：File 必传：是 默认值：/fastp.json 参数4
个配体，默认只处理第一个。 时间步长： 默认值为0.002ps，输入范围：0.001<dt<=0.002，单位：ps。分子动力学模拟的步长，建议不超过0.002ps，步长越大，越难收敛。 最小化步数：默认值为20000，输入范围：5000-50000。 预平衡时长：默认值为100
1-128]，单位C，支持一位小数。对于应用，不填默认1C；对于流程和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用 最小长度：0 最大长度：24 cpu_type 否 String cpu架构类型，不填默认X86 最小长度：0 最大长度：24 memory
1-128]，单位C，支持一位小数。对于应用，不填默认1C；对于流程和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用 最小长度：0 最大长度：24 cpu_type 否 String cpu架构类型，不填默认X86 最小长度：0 最大长度：24 memory
1-128]，单位C，支持一位小数。对于应用，不填默认1C；对于流程和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用 最小长度：0 最大长度：24 cpu_type 否 String cpu架构类型，不填默认X86 最小长度：0 最大长度：24 memory
# 流程超时时间，取值范围[1,144000]，单位分钟，默认1440 output_dir: # 流程的当前工作目录，默认为根目录，用户可显示指定，必须以/开头，结尾不能有/。 tasks:
对于输出参数，如果镜像启动命令中指定了输出参数，则在设置输出参数时，需要勾选“必传”，并填写“默认值”。 如果输出参数为Directory、File类型，默认值必须以/开头，且不能以/结尾，开头的'/'代表本项目的桶路径。 如果输出参数为String，默认值最大长度不超过256，仅支持字母、数字、中划线、下划线、小数点和斜线。
--flavor -f 否 flavor规格，格式为cpu:gpu:memory，不填默认为1:0:2，也即其中cpu规格默认1C，范围[1,128]，gpu规格默认0，范围[0,16]，memory规格默认2G，范围[2,512]。 --storage-path -s 是 notebook存储路径。
# 流程超时时间，取值范围[1,144000]，单位分钟，默认1440 output_dir: # 流程的当前工作目录，默认为根目录，用户可显示指定，输出路径必须以斜杠（/）开头且不能以斜杠（/
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