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MPI应用(IBM Spectrum MPI v10.1)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 登录用户为创建弹性云服务器时指定的用户名。 执行以下命令,防止系统超时退出。
社区OpenMPI 操作场景 本节指导用户安装和使用社区OpenMPI(以3.1.1版本的OpenMPI为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装HPC-X工具套件。 下载需要的HPC-X工具套件以及OpenMPI。 使用社区OpenMPI时,需要同时使用Mellanox的HPC-X
Platform MPI 操作场景 本节指导用户在ECS上安装和使用Platform MPI应用(以版本platform_mpi-09.01.04.03r-ce为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装Platform MPI。 执行以下命令,安装需要的库文件。
Intel MPI 操作场景 本节指导用户在ECS上安装和使用Intel MPI应用(以版本l_mpi_2018.0.128为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装Intel MPI。 下载Intel MPI。 下载地址:https://software.intel
Spectrum MPI 操作场景 本节指导用户安装和使用IBM Spectrum MPI(以IBM Spectrum MPI v10.1为例)。 其中,IBM Spectrum MPI v10.1版本当前支持的操作系统列表如下: IBM Spectrum MPI 10.1.0.1
实施步骤 创建HPC私有镜像 创建弹性云服务器 配置节点互信 创建SFS Turbo 挂载共享目录 通讯录安装 MPI安装 STAR-CCM+安装与运行 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
执行以下命令,给密钥文件配置权限。 $ sudo chmod 600 id_rsa 执行以下命令,查询主机名。 # hostname 执行以下命令,添加本主机私网IP地址和主机名。 # vi /etc/hosts 示例: 192.168.0.1 ecs-ff-0001 执行以下命令,ssh方式登录本节点,验证是否可以不输入密码登录ECS。
执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令,添加集群中所有主机的私网IP地址和主机名。 # vi /etc/hosts 添加的内容为集群中所有ECS的私网IP地址和主机名,例如: 192.168.0.1 ecs-ff-0001 192.168.0.2 ecs-ff-0002
Intel MPI Platform MPI 以下小节的内容详细介绍了MPI的安装与使用,您可以根据需要选择合适的MPI进行安装。 父主题: 安装和使用MPI
驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI MPICH 以下小节的内容详细介绍了MPI的安装与使用,您可以根据需要选择合适的MPI进行安装。 父主题: 安装和使用MPI(鲲鹏BMS场景)
验证MPI运行在RoCE网络上 执行以下命令,安装iproute2。 yum -y install iproute* 执行以下命令,查看RoCE上是否有流量。 rdma res show 若MPI运行中,回显结果中qp 数量较大(大于1),则证明运行在 RoCE 网络上: 无业务时 有业务时
判断系统是否开启超线程。 通过查询系统的物理核数和逻辑核数的关系可以判断是否开启多线程,如果:逻辑核数 = 物理核数,说明没有开超线程;逻辑核数 = 2*物理核数,说明系统开启了多线程。 Linux系统可以通过查询/proc/cpuinfo文件得到和cpu相关的信息,所需要参数解释如下: cat
常见问题 RoCE网络问题 STAR-CCM+启动相关问题 父主题: 附录
通讯录安装 Udapl安装和测试 Udapl安装 cd /root wget https://linux.mellanox.com/public/repo/mlnx_ofed/4.1-1.0.2.0/SRPMS/dapl-2.1.10mlnx-OFED.3.4.2.1.0.41102
STAR-CCM+使用OpenMPI启动时,命令中有"-x"和"--mca"导致启动失败 问题现象: STAR-CCM+使用OpenMPI启动时候命令中同时有"-x"和"--mca"会启动失败,OpenMPI不支持"-x"参数和"--mca"同时使用,报错如下图所示。 解决方案: 1
提供的“进度”页查看当前集群部署的具体进展和详细信息。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。 在“集群管理”页面选择要查看的集群,单击操作列的“进度”进入查看,日志类型选择“部署”,查看当前集群的创建的具体进展和详细信息。 父主题: 查看部署进度
进度”页查看当前集群创建的具体进展和详细信息。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。 在“集群管理”页面选择要查看的集群,单击操作列的“进度”进入查看。 在集群的进度详情页面的“部署”页签可查看当前集群的创建的具体进展和详细信息。 父主题: 查看部署进度
“进度”页查看当前集群缩容的具体进展和详细信息 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。 在“集群管理”页面选择要查看的集群,单击操作列的“进度”进入查看。 在集群的进度详情页面的“缩容”页签可查看当前集群缩容的具体进展和详细信息。 父主题: 查看部署进度
“进度”页查看当前集群扩容的具体进展和详细信息。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。 在“集群管理”页面选择要查看的集群,单击操作列的“进度”进入查看。 在集群的进度详情页面的“扩容”页签可查看当前集群扩容的具体进展和详细信息。 父主题: 查看部署进度
配置节点互信 配置节点互信免密登录 STAR-CCM+集群运行时候需要跨节点运行,推荐使用互信免密登录。 # 生成ssh公钥和私钥 ssh-key-gen # 拷贝公钥到指定主机的~/.ssh/authorized_key文件中 ssh-copy-id root@目标主机IP 例如:ssh-copy-id