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镜像 如何搭建Docker环境 如何将生物信息学软件封装为镜像并上传
容器引擎几乎支持在所有操作系统上安装,用户可以根据需要选择要安装的容器引擎版本。请使用自己的电脑搭建Docker环境,或者使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 例如,在Linux操作系统下,可以使用如下命令快速安装容器引擎。 curl -fsSL get.docker
NGS流程中需使用二代测序得到的原始fastq文件、参考基因组序列、参考Variants数据集。 本示例中以Windows系统命令行工具为例,介绍如何将本地数据上传到EIHealth平台。更多的命令介绍请参见命令行工具。 使用命令行工具,用switch命令进入待操作的项目。 例如,使用health
环境。 使用自己的电脑搭建Docker环境。 使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 本示例中使用华为云弹性服务器ECS,并通过ECS搭建Docker环境。在创建ECS时,可以选择ECS的操作系统。例如,ECS如果为Linux操作系统,可以依次执行如下命令快速安装容器引擎。
流程、作业 应用的参数和镜像启动命令如何设置 直接挂载OBS目录进行大规模计算,如何解决偶现报错
s/{eihealth_project_id} 响应示例 状态码: 200 OK { "id" : "fce1376b-72f9-4d15-9f95-9b533cb96fda", "name" : "demo-project", "obs_bucket_name" :
Pushed v1.0: digest: sha256:eb7e3bbd8e3040efa71d9c2cacfa12a8e39c6b2ccd15eac12bdc49e0b66cee63 size: 948 上传失败可能原因 镜像命名不规范 镜像版本不存在 上传镜像数量超出配额 待上传项目不存在
上传大于1GB数据 当数据过大,或者数据处于服务器上时,页面传输并不是很方便,所以可以利用EIHealth平台的命令行工具进行数据文件、文件夹传输。命令行配置方法请参见配置命令行工具。 上传数据 使用命令行工具upload命令,将本地数据上传到EIHealth平台中。该命令不支持将数据上传到引用目录。
--finish-from-time -x 否 查询提供时间之后的所有任务。例如,2006-01-02 15:04:05。 --finish-to-time -y 否 查询提供时间以前的所有任务。例如,2006-01-02 15:04:05。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。
提供了友好、便捷的操作体验,但是当面临大批量的测序数据时,需要重复设置输入、输出、执行等步骤。为进一步提高NGS流程的执行效率,本章节介绍如何通过循环读取输入数据,批量运行NGS。同时,您也可以参考本示例,将批量运行的方法复制到其他的分析任务中。 配置命令行工具 批量执行分析需要
账号 如何进行实名认证
"count_after_scale" : 3, "state" : "Successful", "time" : "2022-10-15T09:53:50Z" } ] } 状态码 状态码 描述 200 OK 错误码 请参见错误码。 父主题: 计算资源扩缩容
数据管理 如何获取AK/SK 几种不同类型的归档,区别是什么
"tags" : [ "tag" ] } 响应示例 状态码: 201 CREATED { "id" : "fce1376b-72f9-4d15-9f95-9b533cb96fda" } 状态码 状态码 描述 201 CREATED 错误码 请参见错误码。 父主题: 项目审计管理
"version" : "v1.0" } 响应示例 状态码: 200 OK { "id" : "fce1376b-72f9-4d15-9f95-9b533cb96fda" } 状态码 状态码 描述 200 OK 错误码 请参见错误码。 父主题: 镜像管理
"expires_time" : "2022-09-02T10:08:57.686Z", "project" : { "id" : "06f1c15e6f0010672f86c00300...", "name" : "project-example-01" }, "roles"
"chip_type" : "X86" } 响应示例 状态码: 201 CREATED { "id" : "fce1376b-72f9-4d15-9f95-9b533cb96fda" } 状态码 状态码 描述 201 CREATED 错误码 请参见错误码。 父主题: 镜像管理
project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 id 是 String 云服务器ID 最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是
缺省值:AUTODOCK_VINA 最小长度:0 最大长度:15 docking_type String 对接类型,支持BLIND_DOCKING、POCKET_DOCKING。 缺省值:POCKET_DOCKING 最小长度:0 最大长度:15 bounding_box BoundingBoxDto
最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 quantity Integer 剩余服务器数 cpu Integer 剩余CPU ram Integer 剩余内存 请求示例 获取节点剩余配额 https://eihealth.cn-north-4