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优化性能 性能比普通云服务器提高30%。 通过虚拟化优化(SR-IOV、PCI直通)等,各类测试报告显示:大规模云化HPC性能损耗不大。 HPC与云服务的关系 表1 所需云服务 云服务 作用 弹性云服务器(ECS) 用于在公有云平台上创建高性能计算服务器。 虚拟私有云(VPC)
息。 云服务器组 可选配置,云服务器组内的弹性云服务器将遵循反亲和策略,尽量分散地创建在不同主机上。 如果您使用SCSI类型的共享云硬盘作为数据盘,此时,为支持SCSI锁命令,建议您设置待创建弹性云服务器的云服务器组。 标签 对弹性云服务器的标识。 可选配置,给弹性云服务器添加标
及时协同工作,提高效率。 可以利用公有云的跨地域能力,共享计算资源,海量数据,并能实现云端大数据分析。 优化性能 性能比普通云服务器大幅提升。 通过虚拟化优化(SR-IOV、PCI直通)等,各类测试报告显示:大规模云化HPC性能损耗不大。 约束与限制 MPI和通讯库的版本需要提前
创建弹性云服务器 弹性云服务器C6h实例介绍 C6h实例为弹性云服务器下的一款裸金属产品,相比于普通的裸金属产品,C6h实例除了提供标准的以太网卡,还提供了一个支持RoCE协议的网卡,而RoCE协议相比于普通的以太协议最大的优势在于时延极低,特别适合HPC场景低时延业务。 购买弹性云服务器
该任务指导用户在已配置好的弹性云服务器上,运行社区MPI应用(3.1.1版本)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 登录用户为创建弹性云服务器时指定的用户名。
libXt libXext libSM libX11 cd /root unzip siemens.star-ccm15.zip cd Siemens.STAR-CCM+15 tar zxvf STAR-CCM+15.02.009_01_linux-x86_64-r8.tar.gz cd
安全组用来实现安全组内和安全组间裸金属服务器的访问控制,加强裸金属服务器的安全保护。用户可以在安全组中定义各种访问规则,当裸金属服务器加入该安全组后,即受到这些访问规则的保护。购买裸金属服务器时,支持选择裸金属服务器所在的安全组。目前,申请一台裸金属服务器时只能选择一个安全组。 说明: 裸金属服务器初始化需要确保安全组出方向规则至少满足如下要求:
方法二:使用已有节点部署HPC集群 操作场景 如果用户需要使用已有的ECS节点资源构建HPC集群,可以使用该功能进行集群的部署。下面介绍如何使用已有节点部署HPC集群。 使用已有节点部署集群,首先选择管理节点,再选择计算节点,切换计算节点与管理节点需要有相同的CPU架构,需要在相
鲲鹏裸金属服务器支持使用的MPI HPC当前支持的MPI包括: 驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI MPICH 以下小节的内容详细介绍了MPI的安装与使用,您可以根据需要选择合适的MPI进行安装。 父主题: 安装和使用MPI(鲲鹏BMS场景)
STAR-CCM+部署HPC集群流程图 本文档介绍如何通过仿真软件STAR-CCM+部署HPC集群,流程如图1所示。 图1 基于STAR-CCM+部署HPC集群流程图 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
弹性云服务器场景最佳实践 HPC断点续算计算方案 基于STAR-CCM+部署HPC集群
裸金属服务器场景支持使用的MPI HPC当前支持的MPI包括: 驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 以下小节的内容详细介绍了MPI的安装与使用,您可以根据需要选择合适的MPI进行安装。 父主题: 安装和使用MPI(X86
弹性云服务器场景支持使用的MPI HPC当前支持的MPI包括: 驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 以下小节的内容详细介绍了MPI的安装与使用,您可以根据需要选择合适的MPI进行安装。 父主题: 安装和使用MPI
使用私有镜像创建的弹性云服务器创建成功后,您可以在弹性云服务器列表页查看详情,这些云服务器将被用作HPC集群。 API方式 以创建H2型ECS集群为例: URI POST /v1/{$tenant_id}/cloudservers 请求样例 假设需要批量创建4台弹性云服务器,则修改count值为4,请求样例如下:
裸金属服务器场景典型应用 创建裸金属服务器集群 配置BMS集群互相免密登录 安装和使用MPI(X86 BMS场景) 安装和使用MPI(鲲鹏BMS场景) 在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景) 在HPC集群上运行MPI应用(鲲鹏BMS场景)
弹性云服务器场景典型应用 创建支持IB网卡的弹性云服务器 配置单个ECS免密登录 安装和使用MPI 制作私有镜像 创建应用集群 配置ECS集群互相免密登录 在HPC集群上运行MPI应用
MMPS, GROMACS。同时HPC常用的调度软件也对断点续算有集成支持,如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例,介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令,安装FFTW软件。 yum install gcc-gfortran gcc-c++
smpi_lic_s-10.1Eval-rh7_Sep15.x86_64.rpm 选择手动接受IBM Spectrum MPI安装许可协议的,执行以下命令: # rpm -ivh ibm_smpi_lic_s-10.1Eval-rh7_Sep15.x86_64.rpm 图1 手动接受IBM
配置单个ECS免密登录 操作场景 该任务指导用户在单个弹性云服务器内执行相关配置,使其可以免密登录。 背景信息 $:表示在普通用户下,执行相关操作。 #:表示在管理员用户下,执行相关操作。 普通用户切换至管理员用户,请使用命令sudo su。 前提条件 已成功创建弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。
规格:公有云提供了多种类型的弹性云服务器供您选择,单击下拉框查看支持的云服务器规格。 系统盘:根据所需要的选择磁盘类型和大小。 选择云服务器类型前,请认真阅读各种类型云服务器的介绍和注意事项。具体内容请参见实例类型。 选择“计算节点配置”。 规格:公有云提供了多种类型的弹性云服务器供您选择,单击下拉框查看支持的云服务器规格。