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作业及批量执行NGS分析。 新型冠状病毒（COVID-19）虚拟药物筛选 本最佳实践介绍如何使用EIhealth平台虚拟药物筛选功能，通过获取示例数据，创建药物虚拟筛选任务并查看结果。
中的defaultPartSize。 支持带容量单位配置，例如，配置1MB代表1048576字节。支持配置为auto，此时obsutil会根据源文件大小自动设置每个分段任务的段大小。 --cpd -C 否 生成断点记录文件的文件夹，默认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹
选择上传的配体小分子文件。 受体蛋白 选择上传的受体蛋白文件夹。这里会默认用文件夹里面所有的蛋白质和配体小分子文件里面的小分子进行一一对接。 超时时间 根据受体配体对个数进行调整，一个受体配体对对接大约需要25s。 图2 运行信息 单击“提交”，运行作业。 父主题： 运行大规模虚拟药筛任务
功能调用消耗：运行一次功能会消耗一次。 优化后的小分子在满足强约束条件的基础上，会根据满足弱约束条件的权重总和以及与参考小分子的相似度来打分并进行排序。在初始化权重的基础上，每个约束所占的权重，会在每一轮的分子优化迭代中，根据所满足的约束来进行动态调整。比如说约束条件1，在分子优化迭代中比较容
单击后将新建一个对应框架的Notebook文件。 由于每个Notebook实例选择的工作环境不同，其支持的AI框架也不同，下图仅为示例，请根据实际显示界面选择AI框架。 图3 选择AI引擎并新建一个Notebook 新建的Notebook文件将呈现在左侧菜单栏中。 图4 新建文件
打开一个Notebook实例。 在Jupyter控制面板中，选择“New”（新建）然后选择“Terminal”。 在代码输入栏输入以下命令，获取激活TensorFlow-1.8的命令并激活环境。 cat /home/ma-user/README source /home/ma-us
-t 否 镜像类型，只支持APP或者NOTEBOOK。 --description -d 否 镜像描述。当描述中带有空格时，需要添加引号来获取完整的描述信息。 --chip -c 否 镜像芯片类型，只支持ARM或者X86。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。
且按时间排序只能对当前页面进行排序，页面搜索为按前缀搜索。 使用合规数据 您添加的数据属于您的内容，您应对您的内容的合法合规性负责，建议您根据对您可适用的法律法规，进行相应的脱敏、匿名、加密或其他符合要求的处理或采取相应保护措施，当您在复制或者引用数据的时候，需审视是否存在隐私数据，请谨慎操作。
镜像命名不规范 镜像版本不存在 上传镜像数量超出配额 待上传项目不存在 对于--description 参数，当描述中带有空格时，需要添加引号来获取完整的描述信息。 父主题： 镜像管理命令
且按时间排序只能对当前页面进行排序，页面搜索为按前缀搜索。 使用合规数据 您添加的数据属于您的内容，您应对您的内容的合法合规性负责，建议您根据对您可适用的法律法规，进行相应的脱敏、匿名、加密或其他符合要求的处理或采取相应保护措施，当您在复制或者引用数据的时候，需审视是否存在隐私数据，请谨慎操作。
EIHealth提供了个性化分析流程的搭建和管理操作。您可以将生物信息学软件封装为应用，并将其编排调度，形成自定义分析流程。 准备工作 1. 购买服务 2. 获取认证信息 3. 下载命令行工具 4. 命令行工具初始化 用户管理 1. 创建子用户 2. 添加项目成员和权限 数据管理 数据管理常用操作 命令行工具概述
return 0; } } 获取作业结果 作业运行成功后，可以看到每个应用的运行信息：输入输出，节点参数，应用以及日志等信息，最多可以显示5000条日志。 单击具体的输出参数可跳转到具体的文件位置。 图2 获取作业结果 同时，项目支持导出作业的元数据信息，包括以下内容。
ref-file file 参考基因组序列。 seq-platform string 测序平台，如MGI、Illumina。 sample-id string 文件前缀，如NA12878。 输出参数 sorted-bam file 比对和排序之后得到的bam文件。 flagstat-file
择Other时，可以单击值旁边的按钮进行输入。如果选择File或者Directory类型，可以单击值旁边的按钮，选择文件或者文件夹。 值：根据参数类型，填写或者选择相关取值。 必传：参数是否必传，此参数为非必填项。如果开启“必传”，则“值”为必填项。 描述：参数描述，此参数为非必填项。
中的defaultPartSize。 支持带容量单位配置，例如，配置1MB代表1048576字节。支持配置为auto，此时obsutil会根据源对象大小自动设置每个分段任务的段大小。 --cpd -C 否 生成断点记录文件的文件夹，默认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹
在作业页面添加好运行参数，添加方式与方式1相同。 配置好参数后，单击右上角“启动作业”按钮启动作业，同时会跳转回作业列表。 图7 作业列表 步骤4：查看作业运行状态、获取作业结果 查看方法与方式1相同。 父主题： 运行作业
的存放、读取、删除中间文件的时间。 流程针对GATK4中的限速步骤，进行了系统的优化加速。流程从contig-file中提取contig，根据contig下发对应的任务，并依据不同任务，指定并行下发的任务数，以降低流程整体的运行时间。 流程执行信息 NGS流程由fastp、bwa
标签：设置作业标签。 功能调用消耗：运行一次功能会消耗一次。 图2 设置靶点优化MD配置页面 查看靶点优化结果 单击作业名称，进入作业结果页面，拟时结果根据构象RMSD聚类。 单击“查看轨迹”，下载运动轨迹。 单击“下游分析”，将聚类之后的不同构象进行分子对接。 单击每一个Model的按钮，查看构象。
的defaultPartSize。 支持带容量单位配置，例如，配置1MB代表1048576字节。 支持配置为auto，此时obsutil会根据源对象大小自动设置每个分段任务的段大小。 --cpd -C 否 生成断点记录文件的文件夹，默认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹
Not Allowed 请求中带有该资源不支持的方法。 建议直接修改该请求，不要重试该请求。 406 Not Acceptable 服务器无法根据客户端请求的内容特性完成请求。 407 Proxy Authentication Required 请求要求代理的身份认证，与401类似，但请求者应当使用代理进行授权。
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