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使用Docking Summary流程 使用RNA-Seq Analysis Based on STAR流程 使用AutoGenome镜像 genomeagent镜像 父主题： 用户指南（基因平台）
zip，大小不能超过10M。zip包文件个数规格为1024个，单个文件解压后限制，不超过10M。 如果上传的流程中包含镜像，单击镜像管理跳转至本项目的镜像管理列表，进行镜像上传，具体可参考导入或上传镜像。 图1 添加流程文件 添加完成后，单击“下一步”，配置流程参数。 添加参数方式支持两种，一种为单
最小长度：1 最大长度：128 image_name String 镜像名 最小长度：1 最大长度：128 image_tag String 镜像tag名 最小长度：1 最大长度：64 profile String 系统镜像名 枚举值： PY3 表7 NotebookStorage 参数
最小长度：1 最大长度：128 image_name String 镜像名 最小长度：1 最大长度：128 image_tag String 镜像tag名 最小长度：1 最大长度：64 profile String 系统镜像名 枚举值： PY3 表9 NotebookStorage 参数
命令行工具概述 镜像、应用、流程、作业 1. 制作镜像 2. 创建应用 3. 搭建流程 4. 执行分析作业 常见问题 了解更多常见问题、案例和解决方案 热门案例 AK/SK是什么？如何获取AK/SK 如何搭建Docker环境？ 如何制作镜像？ 如何将生物信息学软件封装为镜像？ 更多 远程登录
您可以使用该工具创建、获取、删除和导入数据库模板，创建、获取和删除数据库实例，也可以引用数据库。 镜像管理 您可以使用该工具对镜像执行标记、上传、下载、查询、导入、更新和删除标签等操作。 应用管理 应用是生物信息学软件和运行该软件所依赖的运行环境的镜像封装。 您可以使用该工具创建应用，并进行修改、删除、查询、导入操作。
相关文档 1 医疗智能体EIHealth平台迭代更新 资产市场，提供官方发布的镜像、数据、应用、流程资产。 提供了数据库的创建、查询和管理能力。 支持药物虚拟筛选能力。 命令行工具迭代更新。 开放镜像管理类API。 商用 用户指南 命令行工具 API参考 2021年3月 序号 功能名称
String 下载类型(仅支持PRIVATE|PUBLIC) 枚举值： PRIVATE PUBLIC EXTRANET url 否 String 资源地址(支持https、obs地址) 最小长度：1 最大长度：2000 range_start 否 Long 指定下载对象的开始位置 最小值：0
流程、作业 应用的参数和镜像启动命令如何设置 直接挂载OBS目录进行大规模计算，如何解决偶现报错
系统级的角色配置，可创建平台的子用户，并为其分配权限。详细介绍请参见用户管理。 项目级别用户管理 资源级的角色配置，以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组，以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。详细介绍请参见项目管理。 表2 盘古辅助制药平台用户管理类型 类型 说明 系统级别用户管理
项目管理 收藏管理 镜像管理 标签页面管理 项目审计管理 虚拟药物筛选 父主题： API（医疗智能体平台）
基于二代测序的基因组突变检测 NGS流程简介 配置命令行工具 上传数据 制作并上传镜像 创建应用 搭建NGS流程 执行分析作业 批量执行NGS分析
数据的分析。 平台由项目管理、数据管理、作业、工具、开发环境、镜像等核心部件组成，各个部件沉淀了丰富的技术细节和人性化的设计。 初学者能够基于页面可视化的完成数据管理、复现业内的分析流程和算法。资深从业者能够基于镜像打造自己的分析流程。 使用流程 EIHealth提供了个性化分析
运行作业 方式1：使用预置的NGS流程 方式2：使用预置应用搭建NGS流程 方式3：自定义镜像运行FastQC流程
用户指南（基因平台） 欢迎使用医疗智能体服务 关键概念 准备工作 用户管理 配额管理 系统设置 项目管理 数据管理 数据库管理 镜像管理 工具管理 作业管理 Nextflow 资产市场 开发环境（Notebook） 大规模药物虚拟筛选
String 磁盘类型 space String 磁盘大小 表7 ImageDto 参数 参数类型 描述 type String 镜像类型 version String 镜像版本 请求示例 查询计算资源列表 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.
开发环境（Notebook） Notebook简介 创建Notebook Notebook常用操作 数据的上传和下载 自定义镜像创建Notebook样例 JupyterLab简介及常用操作 url获取方法 Notebook安装Conda指导 父主题： 用户指南（基因平台）
入门实践 表1 常用最佳实践 实践 描述 基于二代测序的基因组突变检测 本最佳实践提供了通过命令行工具上传数据、上传镜像后，在医疗智能体平台搭建NGS流程，执行分析作业及批量执行NGS分析。 新型冠状病毒（COVID-19）虚拟药物筛选 本最佳实践介绍如何使用EIhealth平台
proxy:your-port”。 --swr-endpoint -t 是 SWR镜像仓库地址。 获取方式： 登录容器镜像服务管理控制台。 单击界面右侧“登录指令”，获取内网登录指令末尾的SWR镜像仓库地址。例如100.78.15.50:20202。 --iam-endpoint
单击按钮，进入参数设置页面，可查看修改参数。 名称：应用的原始名称。 版本：应用版本。 显示名称：应用在流程中的显示名称，可修改。 镜像启动命令：镜像启动的命令。可在右上角放大查看，在右下角下拉查看。 源项目：显示应用隶属的项目。 输入参数：由用户在创建应用时定义。 输出路径：输出数据的存放路径，可修改。
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