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启动一个空白的基础容器，并进入容器。 例如，启动一个CentOS容器。 docker run -it centos 安装依赖包。 yum -y install https://dl.fedoraproject.org/pub/epel/epel-release-latest-8.noarch.rpm yum
String 子任务实际名称 display_name String 流程的子任务展示名称 output_dir String 子任务的输出存放路径 whole_output_dir String 子任务的完整输出路径，查看流程不会返回，查看作业时才会返回完整输出路径 io_acc_type
作业运行成功后，可以看到每个应用的运行信息：输入输出，节点参数，应用以及日志等信息，最多可以显示5000条日志。 单击具体的输出参数可跳转到具体的文件位置。 图2 获取作业结果 同时，项目支持导出作业的元数据信息，包括以下内容。 作业的基本配置信息，以yaml文件导出，包含作业名称，依赖的w
库）。 枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url String 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 format String 文件格式，支
workflow_name --limit -l 否 代表当次请求获取的最大条数。此参数用于获取作业列表。 默认值：100。 --offset -o 否 代表从哪个位置开始。默认为0。此参数用于获取作业列表。 --jobName -j 否 作业名。此参数用于获取作业列表。 --labels -a 否 按标签筛选列表，标签间用
如果当前目录为health所在目录，可以使用./health命令使用命令行工具。 如果当前目录不是health所在目录，需要使用绝对路径。如当前目录为/opt，假设health存放在/root/health-toolkit/下，需要指定/root/health-toolkit/health路径进行使用。 如果无法运行，提示Permission
通过VariantQC对vcf进行质量控制，输出变异数目，变异类型统计等指标。 流程优势 使用Unix管道技术连接比对和排序步骤，以缩短bwa和samtools的存放、读取、删除中间文件的时间。 流程针对GATK4中的限速步骤，进行了系统的优化加速。流程从contig-file中提取contig，根据c
64格式 最小长度：1 最大长度：10000000 bounding_box BoundingBox object 结合口袋，包含口袋中心位置和尺寸大小 表11 BoundingBox 参数 参数类型 描述 center Array of numbers 口袋中心坐标; x, y
display_name 否 String 流程的子任务展示名称，最大长度64 最小长度：0 最大长度：64 output_dir 否 String 子任务的输出存放路径，用户可显式指定;输出路径必须以斜杠（/）开头且不能以斜杠（/）结尾，不能包含两个以上相邻的斜杠（/），不能包含以下特殊字符：\ : ;
display_name 否 String 流程的子任务展示名称，最大长度64 最小长度：0 最大长度：64 output_dir 否 String 子任务的输出存放路径，用户可显式指定;输出路径必须以斜杠（/）开头且不能以斜杠（/）结尾，不能包含两个以上相邻的斜杠（/），不能包含以下特殊字符：\ : ;
调用说明 医疗智能体平台提供了REST（Representational State Transfer）风格API，支持您通过HTTPS请求调用。 调用方法请参见如何调用API。 父主题： 使用前必读
间”、“加速类型”。设置完成后单击“确定”。 基本信息：包含作业名称、标签、描述。 流程名称：显示已创建的流程名称，不可编辑。 输出路径：存放输出结果的路径，格式以/开头。例如项目中的output文件夹，输出路径可设置为/output。不填写路径时，默认以“作业名-UUID”格式生成输出路径。
覆盖关系：作业->流程->应用 output_dir: # 子任务的输出存放路径，用户可显示指定，必须以/开头，结尾不能有/。 inputs: - name: 'input-dir'
如果当前目录为health所在目录，可以使用./health命令使用命令行工具。 如果当前目录不是health所在目录，需要使用绝对路径。如当前目录为/opt，假设health存放在/root/health-toolkit/下，需要指定/root/health-toolkit/health路径进行使用。 如果无法运行，提示Permission
作业名称：可选择“数据库表”、“自定义”或“自动生成”。 标签：设置作业标签。 描述：根据需要填写。 输出路径：可选择“数据库表”和“自定义”。选择“自定义”时，存放输出结果的路径，格式以/开头。例如项目中的output文件夹，输出路径可设置为/output。不填写路径时，默认以“作业名-UUID”格式生成输出路径。
文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：0 最大长度：10000000 响应参数 无 请求示例 将外部文件https://files.rcsb.org/download/1TQN.pdb转为SDF格式。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/drug-common/t
覆盖关系：作业->流程->应用 output_dir: # 子任务的输出存放路径，用户可显示指定，输出路径必须以斜杠（/）开头且不能以斜杠（/）结尾，不能包含两个以上相邻的斜杠（/），不能包含以下特殊字符：\ : ;
} --output_dir -o 否 输出路径（EIHealth平台数据路径）。可自定义。不指定时，按照“作业名称+UUID”格式自动生成存放输出结果的目录。输出路径只能以/开头，不能以/结尾。 --timeout -t 否 超时时间。运行时间超过设置时间时，认为超时，默认1440分钟，最大可设置为144000分钟。
和“描述”，设置“输出路径”、“优先级”、“计算节点标签”、“超时时间”和“加速类型”。 基本信息：包含作业名称、标签、描述。 输出路径：存放输出结果的路径，格式以/开头。例如项目中的output文件夹，输出路径可设置为/output。 不填写路径时，默认以“作业名-UUID”格式生成输出路径。
和“描述”，设置“输出路径”、“优先级”、“计算节点标签”、“超时时间”和“加速类型”。 基本信息：包含作业名称、标签、描述。 输出路径：存放输出结果的路径，格式以/开头。例如项目中的output文件夹，输出路径可设置为/output。 不填写路径时，默认以“作业名-UUID”格式生成输出路径。
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