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和大分子,小分子通常为低分子量的化合物,如蛋白质配体;大分子多为蛋白质靶点。 小分子涉及分子对接、分子优化、靶点口袋分子设计、CPI、分子生成、分子搜索、FEP、聚类详情页。 大分子涉及靶点口袋发现、靶点优化。 使用限制 下载操作将会产生流量费用,具体可参考计费说明。 如果收藏分
输出路径:存放输出结果的路径,格式以/开头。例如项目中的output文件夹,输出路径可设置为/output。不填写路径时,默认以“作业名-UUID”格式生成输出路径。 优先级:运行优先级,分为0~9级,优先级高的作业会被优先执行。默认值为0。 如果当前投递的IO加速的作业,超过sfs总的作业配额数,
虚拟药物筛选 创建study 删除study 列举study所有作业 创建study作业 列举study 获取study作业的最值信息 获取生成study作业3D结构的内容 父主题: 项目管理
successfully! 图3 命令示例 执行以上命令行,会在系统所在的用户目录下自动生成一个.health文件夹,文件夹中包含config.ini配置文件,用于存储任务执行所涉及到的配置,如密钥、区域、当前项目等信息。 生成的配置文件不建议直接修改,如需改动请使用命令行工具修改。 配置文件中保
数据库简介 EIHealth平台提供了数据库的创建、查询和管理能力。您可以将表型、基因型或其他数据导入EIHealth平台并生成数据库。同时,除了自定义数据库外,支持将作业运行中产生的数据文件创建为数据库。 创建数据库时,数据库模板为您提供了一个数据表的搭建框架,可通过数据库模板
分子对接作业管理 分子合成路径规划作业管理 分子优化作业管理 靶点口袋发现作业管理 靶点口袋分子设计作业管理 分子属性预测作业管理 分子搜索作业管理 分子生成作业管理 CPI作业管理 靶点优化作业管理 聚类分析作业管理 药物模型管理
命令结构 health clear [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 upload -u 是 上传文件时,本地生成的断点目录。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。
--fr -R 否 下载对象时生成结果清单文件。 --tempFileDir -D 否 分段下载时保存临时文件的文件夹,默认为配置文件中的defaultTempFileDir。 如果该值为空,且配置文件中的defaultTempFileDir也为空,则分段下载时生成的临时文件会保存在待下载文件的同目录下并以
对于输入参数,打开“并发”开关,在启动作业时,每个参数可以设置多个参数值,自动生成多个作业并发执行。并发执行的作业数为设置的参数值个数的乘积。 例如,存在输入参数a和输入参数b,在启动作业时,分别给参数a设置了2个参数值,给参数b设置了2个参数值。那么,系统将自动生成4个作业并发执行。 对于输出参数,如果镜像启动
设置名称匹配模式(include、exclude)和时间匹配模式(timeRange)对文件夹也生效。 --o -o 否 生成结果清单文件的文件夹,命令执行完成后,会在该文件夹下生成结果清单文件(可能包含成功结果、失败结果、警告结果三个文件),默认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹
邮箱地址:填写邮箱地址,用于发送EIHealth平台的消息通知。 用户名:邮箱的用户名,如果未修改过,默认为邮箱地址。 密码:邮箱开通SMTP功能时生成的一段随机字符。 消息头:发送邮件时,邮件标题。 语言:选择中文或英文。 删除邮箱后,将不再发送邮件通知。 图1 邮件配置 邮箱配置完成后
创建study、列举study、删除study等相关操作API。 表2 临床研究、AI辅助药物设计API 类型 API 说明 药物设计 API(AI辅助药物设计) 分子生成、分子优化、靶点化合物结合预测、分子属性预测相关操作API。
设置名称匹配模式(include、exclude)和时间匹配模式(timeRange)对对象名以“/”结尾的对象也生效。 --o -o 否 生成结果清单文件的文件夹,命令执行完成后,会在该文件夹下生成结果清单文件(可能包含成功结果、失败结果和警告结果三个文件),默认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹
作业名称:可选择“数据库表”、“自定义”或“自动生成”。 标签:设置作业标签。 描述:根据需要填写。 输出路径:可选择“数据库表”和“自定义”。选择“自定义”时,存放输出结果的路径,格式以/开头。例如项目中的output文件夹,输出路径可设置为/output。不填写路径时,默认以“作业名-UUID”格式生成输出路径。
txt路径下的txt文件上传至src文件夹中。 上传完成后,会在EIHealthG42 Health AI平台数据管理页面的src文件中,生成test.txt文件。 health upload D:\local\data\test.txt /src/ 上传文件并重命名为abc.txt。
修改为空,实际作业输出结果依然默认存在该路径。最终输出结果路径按照“流程输出路径/作业名称-UUID/Task输出路径/应用输出路径”规则生成。 单击界面上方按钮,保存流程。并提示“流程保存成功”。 创建好的流程,将显示在流程列表中。 父主题: 工具管理
01050222 The task instance {0} does not exist in the task {1}. 请检查该任务是否生成了该任务实例 404 eihealth.01050304 The column {0} does not exist in database
到较好结果的参数进行后续训练。训练过程中可选择在验证数据集上进行评估,评估结果更好的模型参数将会保留。 提取降维之后数据:完成模型训练后,生成降维后的结果数据。 当您在运行AutoGenome示例出现“Warning:restart the kernel and run the notebook
结果解释:预测值的范围在0~1之间。 SR-MMP: Mitochondrial membrane potential,线粒体膜电位。线粒体是动植物细胞生成ATP的主要地点,是促进细胞能量转换、参与细胞凋亡的重要细胞器。 线粒体在产生能量时会将电化学势能储存于线粒体内膜,在内膜两侧,若质子及其
输出路径:存放输出结果的路径,格式以/开头。例如项目中的output文件夹,输出路径可设置为/output。 不填写路径时,默认以“作业名-UUID”格式生成输出路径。 优先级:运行优先级,分为0~9级,优先级高的作业会被优先执行。默认值为0。 如果当前投递的IO加速的作业,超过sfs总的作业配额数,