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将质控之后得到的Clean Reads比对到参考基因组上。 bwa-mem:0.7.17 该镜像由bwa和samtool合并而成，镜像制作方法请参见制作bwa-mem镜像。 Insert Size Estimation 针对构建Index后的bam文件，统计测序数据的Insert
to_time 否 Long 查询监控数据截止时间，UNIX时间戳，单位毫秒，不填时默认为当前时间 method 否 String 统计方法。枚举值，取值范围：maximum（最大值）、minimum（最小值）、average（平均值），不填时默认为maximum 缺省值：maximum
配置好参数后，单击右上角“启动作业”按钮启动作业，同时会跳转回作业列表。 图7 作业列表 步骤4：查看作业运行状态、获取作业结果 查看方法与方式1相同。 父主题： 运行作业
结”状态。 图1 项目管理 分享项目 前提条件 平台管理员首先通过“用户管理”功能添加平台用户，才能将该用户添加至项目中。 创建用户的详细方法请参见创建平台用户。 已创建一个项目。 操作步骤 单击“操作”列“分享”。 图2 分享项目 输入已添加至平台的用户名称。 图3 输入用户名全称
钟粒度）、one_hour（1小时粒度），不填时默认为real_time 缺省值：real_time method 否 String 统计方法。枚举值，取值范围：max（最大值）、min（最小值）、average（平均值），不填时默认为max 缺省值：max metric_name
在本地编写模板，模板中的参数与在EIHealth平台新建应用过程一致。模板修改好后，再使用命令行工具上传模板，创建应用。 修改模板时，需填写镜像地址，获取方法请参见获取镜像地址。镜像制作和上传方法请参见镜像管理和创建FastQC应用样例。 # 详情说明可参考API文档中应用管理-创建应用 app: name:
real_time five_minutes fifteen_to_twenty_minutes one_hour method 否 String 统计方法。枚举值，取值范围：max（最大值）、min（最小值）、average（平均值），不填时默认为max 枚举值： max min average
应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 响应参数 无 请求示例 删除数据库 https://{endpoint}/v1/{project_id}/databases/{database_id} 响应示例 无 状态码 状态码
响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 响应参数 无 请求示例 删除标签 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/system/labels/{label_id}
头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 响应参数 无 请求示例 删除css集群。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/drug/css-clusters/{css_cluster_id} 响应示例
度，通过质控、比对、变异检测等步骤，最终输出包含样本SNP、INDEL的VCF文件。 该案例介绍NGS的搭建步骤，涵盖镜像、应用、流程制作方法。用户也可以使用“资产市场”提供的已经搭建好的“Variant Calling Based On NGS”流程。该案例比“资产市场”流程多出VCF文件进行质控步骤。
在计算资源页面，选择需要统计的节点，单击“资源统计”。 图19 选择统计节点 选择的节点不能跨页。 配置资源统计的时间、周期和方法。 图20 配置资源统计信息 单击“下载”。 如选择统计方法为“最大值”，则选择所有取值的最大值；如选择“平均值”，则选择所有取值的平均值。 查看计算资源节点监控 您可
头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 响应参数 无 请求示例 修改跨域归档设置 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/system/arch
响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 响应参数 无 请求示例 收藏资产 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/assets/{asset_id}/stars
NodeLabelRsp objects 数据对象列表 表4 NodeLabelRsp 参数 参数类型 描述 name String 标签名称 请求示例 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/system/nodes/labels
quantity Integer 剩余服务器数 cpu Integer 剩余CPU ram Integer 剩余内存 请求示例 获取节点剩余配额 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/system/comp
应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 响应参数 无 请求示例 取消收藏。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id
String 认证方式:sms，email，vmfa 最小长度：1 最大长度：128 响应参数 无 请求示例 发送验证码，发送方式为email https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/users/{user
文件的最后修改时间不一致。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 下载数据前需要使用switch命令进入待操作的项目。例如，使用health switch project test命令进入到名为test的项目中。
枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 format 否 String 文件格式
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