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String 参数类型。取值:[STRING,FILE,DIRECTORY,ENUM] pattern 否 String 提示用户参数填写的格式,取值范围:[0-64]。对于STRING类型,匹配字符串内容,比如后缀约束.fastq;对于ENUM类型,可以提示一定要在param_e
查询镜像 使用health docker images命令查询项目中的镜像。 命令结构 health docker images [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --name -n 否 查询指定镜像名下的所有tag信息,支持模糊查找。 --type -t
跳过的header行数。不指定参数值时默认为0。 --delimiter -e 否 常用的三种分隔符为(;,\t),也可以根据导入数据的文件格式设定其他分隔符。 --files -f 否 生成实例数据的文件列表,多个文件用分号(;)分隔。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。
BindingSite 参数 是否必选 参数类型 描述 protein 否 String 蛋白质3D结构,使用gzip压缩然后转base64格式 最小长度:1 最大长度:10000000 bounding_box 否 BoundingBox object 结合口袋,包含口袋中心位置和尺寸大小
--createStartTime -c 否 最小创建时间,格式:YYYY-MM-DD HH:MM:SS。例子:"2006-01-02 15:04:05"。此参数用于获取作业列表。 --createEndTime -e 否 最大创建时间,格式:YYYY-MM-DD HH:MM:SS。例子:"2006-01-02
根据表面离散点坐标集生成可渲染的文件内容 将传入的蛋白和小分子拼接成复合物结构 单分子文件格式转换 创建分子或分子复合物批量下载任务 查询分子或分子复合物批量下载任务详情 受体预处理(Fasta格式) 单分子预对接 父主题: API(盘古辅助制药平台)
RAW url 否 String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format 否 String 文件格式,支持PDB、SDF、MOL2、SMI,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:1
导出多个job-id时,用分号(;)隔开。 格式:id1;id2;id3。 --file -f 否 要导出的id列表文件,使用job-id文件导出作业时必选。 job-id-file 无 否 要导出的id列表的文件位置。 文件内容格式:{"ids":"id1;id2;id3"}。
project为源项目名称,可选。不指定srcproject时,默认为当前项目。 --sample -s 否 获取流程模板,模板为yaml格式。 --downloadPath -d 否 获取workflow详情时,将内容下载到的指定文件夹路径(文件夹需要存在)。 --project
-b 否 列举结果中字节数的显示格式。取值范围[human-readable, raw]。 如果未设置该参数,则列举结果中字节数的显示格式由配置文件中的humanReadableFormat参数决定。 --format -F 否 指定以自定义格式打印列举结果。当前仅支持值[default],指定列举结果在一行显示。
0::gwj-test-01' # 应用id,取值范围[1,135],正则先不能有中文,两种格式。特殊id,采用{app_name}::{app_version}::{src_project_name}格式,用于手动创建场景;
订阅镜像 功能介绍 订阅镜像 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eih
订阅资产市场数据 功能介绍 订阅资产市场数据 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-proje
输入参数对应的文件路径(本地路径),该参数与流程中的输入文件路径对应,通过修改input-file,修改输入数据。 选择时,input和input-file二选一。 格式为:{"task0": {"input-1": "datapath"}, "task1": {"inputs": "datapath"}}。
get app -s命令获取创建应用的模板,复制模板并保存到本地,您可以保存成.yaml或.txt文件,保存为txt文件时,其内容需为yaml格式。 在本地编写模板,模板中的参数与在EIHealth平台新建应用过程一致。模板修改好后,再使用命令行工具上传模板,创建应用。 修改模板时,
不带--detail参数,以yaml格式展示作业基本信息。 带--detail参数,以json格式展示作业基本信息。 --detail -d 否 配合ID使用,返回作业的详细信息。 --sample -s 否 获取作业模板,模板为yaml格式。 --limit -l 否 代表当次请求获取的最大查询条数(默认为10)。
project时,默认为当前项目。例如GATK:4.0:projectname。 --sample -s 否 获取应用模板,模板为yaml格式。 --downloadPath -d 否 获取应用详情时,将内容下载到的指定文件夹路径(文件夹需要存在)。 --project 无 否
"分隔,如:"a,b"。 --main_file -m 否 流程主文件名,默认为:main.nf。 --params -p 否 本地json/yaml格式参数文件路径。 命令示例 health nextflow create workflow -n h2 -w "D:\testzip.zip"
绑定CSS集群 功能介绍 绑定CSS集群。 URI POST /v1/{project_id}/drug/css-clusters 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
创建项目 功能介绍 创建项目 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects 表1 路径参数