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否 String 子任务的参数类型，不填默认MANUAL values 否 Array of strings 子任务的参数数值，根据参数类型进行合法性校验 最小长度：0 最大长度：2048 数组长度：0 - 128 表6 TaskResourceDto 参数 是否必选 参数类型 描述
储类型为“归档存储”，则将该数据引用过来后，该数据不能用于创建作业，并不可下载。 平台系统管理员在自己的所有者、管理员、操作者项目可以引用OBS类型数据。平台系统管理员在自己的所有者、管理员、操作者项目可以解除引用OBS类型数据。其他角色的用户仅能使用引用进来的OBS类型数据。 使用URL导入数据
ows、Linux、Mac等）原因，无法实现统一的运维管理。同时，这些软件具有不同的版本和软件包，安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像，可以使程序在不同的环境中运行，并通过EIHealth平台的镜像管理，实现高效的调用，极大方便了软件的安装和运行。 Dock
在本地编写模板，模板中的参数与在EIHealth平台新建应用过程一致。 修改yaml模板时，详细的命令和参数请参见应用配置文件说明。 # 详情说明可参考API文档中应用管理-创建应用 app: id: '' # 应用id name:
业执行完成后会清理释放SFS空间。对于涉及频繁读写场景的任务建议开启IO加速，开启前需要先购买性能加速。 本地盘加速：使用计算节点的本地盘进行加速。使用本地盘加速时，需保证购买的计算节点带有“数据盘”。OBS桶中的数据不支持本地盘加速，使用OBS桶中数据用于本地盘加速，可能会导致作业运行失败。
c文件的父目录也会显示在左侧数据栏中，但目录a, 目录b 不支持数据归档。 平台系统管理员在自己的所有者、管理员、开发者、上传者项目可以引用OBS类型数据。平台系统管理员在自己的所有者、管理员、开发者、项目可以解除引用OBS类型数据。其他角色的用户仅能使用引用进来的OBS类型数据。
在本地编写模板，模板中的参数与在EIHealth平台启动作业过程一致。模板修改好后，再使用命令行工具上传模板，启动分析作业。 # 详情说明可参考API文档中作业管理-创建作业 job: name: demo-job # 作业名称，取值范围：[1
传模板，创建应用。 修改模板时，需填写镜像地址，获取方法请参见获取镜像地址。镜像制作和上传方法请参见镜像管理和创建FastQC应用样例。 # 详情说明可参考API文档中应用管理-创建应用 app: name: 'demo-app'
否 String 子任务的参数类型，不填默认MANUAL values 否 Array of strings 子任务的参数数值，根据参数类型进行合法性校验 最小长度：0 最大长度：2048 数组长度：0 - 128 表7 TaskResourceDto 参数 是否必选 参数类型 描述
工具上传模板，创建流程。示例流程由app1和app2两个应用构成，通过指定输入、输出关系链接两个应用。 # 详情说明可参考API文档中流程管理- 创建流程 workflow: name: 'demo-workflow' #
订阅。 订阅的流程、应用类资产，将显示在“项目管理 > 工具”页面的列表中，以“[资产市场]”进行标记。 订阅的镜像类资产，将显示在“项目管理 > 镜像”页面的列表中，以“[资产市场]”进行标记。 订阅的数据类资产，将显示在“项目管理 > 数据”页面。 收藏资产 资产市场提供了官
关机、重启、标签管理、调度设置操作。 图3 计算资源列表 计算资源标签管理 标签管理：可通过设置系统内置标签“copy-in”，使作业在该计算节点上运行。用户也可以自定义标签，创建应用时，通过设置标签指定应用运行在具有相同标签的计算节点上，实现运行作业按标签进行调度。 调度设置：
如果删除单个消息，可以单击消息后面的进行删除。 图4 删除单个消息 如果批量删除消息，可以勾选多个消息后，单击“批量删除”。 图5 批量删除消息 表1 系统消息 消息类型 描述 查看权限 作业保留即将达到配额提醒 当前作业条数已经达到了配额的90%后，系统会消息提醒。 管理员 消息保留即将达到配额提醒
否 String 子任务的参数类型，不填默认MANUAL values 否 Array of strings 子任务的参数数值，根据参数类型进行合法性校验 最小长度：0 最大长度：2048 数组长度：0 - 128 表7 TaskResourceDto 参数 是否必选 参数类型 描述
didn't match node selector。该场景表示当前集群中无计算资源满足标签要求，用户可以进入系统资源页面，选择节点，通过标签管理给节点添加标签。 其他场景可以联系服务技术支持解决。 图4 购买计算资源 图5 设置计算节点标签 场景3 作业投递后显示运行成功，但是根据
数据，上传镜像和创建分析作业。也可以将团队成员引入到项目中，并通过划分角色实现项目权限的划分。 项目管理是以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组。以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。 父主题： EIHealth平台
上传镜像。 上传镜像。 在“项目管理”页面“镜像”页签中，可查看已上传的镜像。 在平台镜像管理列表中，将已上传的镜像分类为“NOTEBOOK”。 步骤4：创建并使用Notebook 在医疗智能体平台选择“项目管理 > 开发”，进入Notebook管理页面。 图1 创建Notebook
ApplyBQSR 基于比对bam文件进行矫正。 gatk HaplotypeCaller 基于比对和矫正之后的bam文件进行Variant Calling的工作。 gatk MergeVcfs 合并分bin变异检测的VCF文件。 Variant QC 针对输出的VCF文件进行质控。 图1 NGS执行步骤
单击界面右侧“订阅”图标，订阅该流程。 订阅的流程将显示在“项目管理 > 工具”页面的流程列表中。 步骤2：上传待分析数据 您在使用RNA-Seq流程前，请先上传待分析的数据，上传数据方法请参见数据管理。 步骤3：创建分析作业 单击项目名称，进入“项目管理”页面，并选择“工具”页签。 在“RNA-Seq
图中直接通过两个分子之间进行连线添加。可以在微扰图中单击某条待计算路径上的，删除该条待计算路径。 图2 添加或者删除待计算路径 图3 选择配体对 返回相似度后默认全勾选，您可以进行勾选或去除勾选要计算的路径，如果未勾选，则后面就不会对其进行FEP计算。在相似度返回之前，您也可以直接选择配体对进入下一步。
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