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项目角色为项目粒度权限控制,同一用户在不同的项目上可能拥有不同的角色。 创建的项目配额请参见配额管理进行查询。详细添加项目成员并分配角色的方法请参见添加项目成员。 父主题: 项目管理
如果开启组织共享,则其他子用户也可以使用您的数据库进行分子搜索。 默认为关闭。 数据库列表展示数据库的名称、分子数量、创建时间、状态等信息。对于已创建的数据库,可以执行删除和追加数据操作。数据库状态介绍如下: 可用:数据库正常,可以进行分子搜索使用。 等待中:数据库创建任务正在等待。
[flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 destdir 无 是 目的文件或目录。 --force -f 否 强制操作,不进行询问提示。 --recursive -r 否 按指定的对象名前缀批量删除,批量删除时必选。 --jobs -j 否 批量删除对象时,批量任务的最大并发数,默认为5。取值范围[1
否 String 子任务的参数类型,不填默认MANUAL values 否 Array of strings 子任务的参数数值,根据参数类型进行合法性校验 最小长度:0 最大长度:2048 数组长度:0 - 128 表6 TaskResourceDto 参数 是否必选 参数类型 描述
CPI预测 CPI预测基于蛋白质的一级序列和化合物的2D结构进行靶点匹配,精确的预测化合物-蛋白相互作用。 单击“CPI预测”功能卡片,进入配置页面。 配置靶点文件。 支持3种输入方式,分别是输入氨基酸序列、选择文件、输入PDB ID 输入FASTA格式氨基酸序列,输入框最多支持
images命令查看已有的镜像。 详细的命令介绍请参见“命令行工具 > 镜像管理命令”章节。 登录EIHealth平台,在镜像列表中查看已上传的镜像。 步骤4:创建应用 登录EIHealth平台,在“项目管理”页面“工具”页签中,单击“新建应用”。 图2 新建应用 填写应用的基本信息。
不存在,或者目标对象大小与源对象大小不一致,或者目标对象的最后修改时间早于源对象的最后修改时间时进行移动。 如果目标对象与源对象大小以及修改时间都一致,此时会直接删除源对象,而不进行移动操作。 --parallel -p 否 每个分段移动任务的最大并发数,默认为配置文件中的defaultParallels。
删除单个分段上传任务时该参数必选。 --fr -R 否 删除单个分段上传任务时生成结果清单文件。删除单个分段上传任务时该参数可选。 --force -f 否 强制操作,不进行询问提示。 --recursive -r 否 按指定的对象名前缀批量删除分段上传任务。 批量删除分段上传任务时该参数必选。 --jobs -j
无需指定destdir。 --md5s -m 否 网络下载链接对应的md5列表,值用; 分隔,和网络数据链接一一对应。值用于下载完后对文件进行md5校验。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eiheal
供方向。药物虚拟筛选以项目成员为粒度进行资源的隔离和访问控制,不同成员角色对数据库的操作权限请参见成员角色和权限。 创建药物虚拟筛选任务 虚拟药物筛选支持使用资产市场中预置的“Docking Summary”流程对小分子化合物配体和蛋白受体进行对接。该流程可以实现以下功能。 整合分子对接结果,生成结合能矩阵。
资源级的角色配置,以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组,以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。详细介绍请参见项目管理。 表2 盘古辅助制药平台用户管理类型 类型 说明 系统级别用户管理 系统级的角色配置,可创建平台的子用户,并为其分配权限。 项目级别用户管理 资源级的角色配置,以项目为粒度
EIHealth提供了个性化分析流程的搭建和管理操作。您可以将生物信息学软件封装为应用,并将其编排调度,形成自定义分析流程。 准备工作 1. 购买服务 2. 获取认证信息 3. 下载命令行工具 4. 命令行工具初始化 用户管理 1. 创建子用户 2. 添加项目成员和权限 数据管理 数据管理常用操作 命令行工具概述
String 子任务的参数类型,不填默认为MANUAL values 否 Array of strings 子任务的参数数值,根据参数类型进行合法性校验 最小长度:0 最大长度:2048 数组长度:0 - 128 响应参数 状态码: 201 表8 响应Body参数 参数 参数类型
String 子任务的参数类型,不填默认为MANUAL values 否 Array of strings 子任务的参数数值,根据参数类型进行合法性校验 最小长度:0 最大长度:2048 数组长度:0 - 128 响应参数 无 请求示例 更新流程,更新流程的cpu资源为1C,内存资源为1G。
述”和“描述”。 图2 基本信息 选择镜像和镜像版本。 详细的镜像介绍和制作方法请参见镜像管理。 填写镜像启动命令。 镜像启动命令需要引用输入、输出参数中的变量,并以大括号扩起,以$符号进行引用。 镜像启动命令支持多行输入,每行最多256字符,最多支持300行。 例如,bamqc
导入数据库模板 导入模板 提供两种模板导入方式: 平台支持导入其他项目的模板,用户需是其他项目中的成员,且为其他项目的“所有者”或“管理员”,预置的模板不支持导入。 在左侧导航栏选择“模板”页签,单击“导入模板”。 导入方式选择“项目”,选择项目名称,勾选需要导入的模板,可以在“
开发环境:预置基因组自动建模工具AutoGenome,提供多种AI引擎切换。 应用、流程支持X86、ARM运行。 消息中心:支持异步任务提示。 商用 项目管理 预置流程 数据管理 工具管理 分析作业管理 开发环境 2020年8月 序号 功能名称 功能描述 阶段 相关文档 1 医疗智能体EIHealth平台上线 基于华
None 医学文本标注 医疗智能体 EIHealth 使用ModelArts进行数据管理和标注 07:08 医学文本管理和标注 医疗智能体 EIHealth 使用ModelArts进行团队标注 05:44 医学文本团队标注 药物虚拟筛选 医疗智能体 EIHealth 药物虚拟筛选
0M。 如果上传的流程中包含镜像,单击镜像管理跳转至本项目的镜像管理列表,进行镜像上传,具体可参考导入或上传镜像。 图1 添加流程文件 添加完成后,单击“下一步”,配置流程参数。 添加参数方式支持两种,一种为单击进行添加,一种为单击进行添加。如果参数比较多,建议使用“上传参数”方式。
在本地编写模板,模板中的参数与在EIHealth平台新建流程过程一致。 修改yaml模板时,详细的命令和参数请参见流程配置文件说明。 # 详情说明可参考API文档中流程管理- 创建流程 workflow: id: # 流程id