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HPC断点续算计算方案 操作场景 在HPC领域很多应用本身是支持断点续算功能的，例如LAMMPS， GROMACS。同时HPC常用的调度软件也对断点续算有集成支持，如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例，介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令，安装FFTW软件。
进入一站式HPC服务提供的“进度”页查看当前集群创建的具体进展和详细信息。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。 在“集群管理”页面选择要查看的集群，单击操作列的“进度”进入查看。 在集群的进度详情页面的“部署”页签可查看当前集群的创建的具体进展和详细信息。
所在区域、虚拟私有云、安全组、节点信息以及共享存储以及集群的关系图等信息。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。 在“集群管理”页面选择要查看的集群，单击集群名称查看集群详情页。 在集群的详情页面可查看集群ID、状态、所在区域、虚拟私有云、安全组、节点信息以及共享存储以及集群的关系图等信息。
Server根据该标识来区分客户端分配IP地址。 HPC解决方案当前采用的是DHCP方式的IPoIB方案，实现IP地址自动化发放和配置。 IPoIB的约束和限制 支持管理一个IB网卡。 继承BMS、H2型、HL1型、HI3型云服务器对IB网卡的使用约束与限制，使用IPoIB特性的弹性云服务器不支持迁移。 继
CE协议的网卡，而RoCE协议相比于普通的以太协议最大的优势在于时延极低，特别适合HPC场景低时延业务。 购买弹性云服务器 登录管理控制台。 单击管理控制台左上角的，选择区域和项目。 单击""，选择“计算 > 弹性云服务器”。 单击“购买弹性云服务器”，系统进入购买页后按图1步骤进行操作。
HPC和公有云 公有云上部署HPC的优势 传统的HPC使用中存在如下问题： 投资成本高，扩容部署复杂，重复利用已有投资十分困难。 应用复杂，资源预测困难，灵活性差，亟待提升效率。 效率低下导致决策缓慢，失去市场、以及开发研究成果的良机。 应用计算量快速膨胀，对性能要求越来越高。
STAR-CCM+安装与运行 安装STAR-CCM+ yum install libXt libXext libSM libX11 cd /root unzip siemens.star-ccm15.zip cd Siemens.STAR-CCM+15 tar zxvf STAR-CCM+15
在HPC集群上运行IB驱动自带的OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在已配置好的弹性云服务器上，运行IB驱动自带的MPI应用（3.0.0rc6版本）。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器，并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。 操作步骤 使
HPC-S²与其他服务的关系 服务名称 HPC-S²与其他服务的关系 主要交互功能 弹性云服务器（ECS） 购买弹性云服务器创建HPC集群或使用已有弹性云服务器部署HPC集群。 自定义购买ECS 虚拟私有云（VPC） 同一个HPC场景的云服务器，都位于同一个VPC中，并且需要使用
按需购买的集群删除时未勾选“删除云服务器”，因此只删除了集群信息，集群中的云服务器资源仍在继续扣费。 包周期类型的集群删除时只能删除集群信息，云服务器资源需要手动退订。 管理节点如使用购买EIP的选择，集群删除时，即使勾选了“删除云服务器”，绑定的EIP资源也不会删除，仍然正常计费。如需停止EIP资源计费，请手动删除EIP。
性能计算集群。 HPC的业务特点 科学研究、气象预报、仿真实验、生物制药、基因测序、图像处理等行业都涉及高性能计算集群来解决大型计算问题，管理节点对计算任务进行分解，交给不同的计算节点完成计算。 各种业务场景下，因数据处理量、计算任务关联关系等不同，对计算能力、存储效率、网络带宽及时延要求有各自侧重。
集群创建任务提交失败，提示“Insufficient EIP quota”怎么办？ 集群创建提交失败，提示集群配额不足怎么办？ 集群的管理节点为运行状态，但是集群异常提示“master node cannot reached”怎么办？
挂载共享目录 安装软件 yum install nfs-utils 挂载SFS Turbo 将SFS Turbo挂载到/opt/Siemens目录 mkdir /opt/Siemens # 在/etc/fstab中添加开启自动挂载 echo "192.168.0.15:/ /opt/Siemens
通讯录安装 Udapl安装和测试 Udapl安装 cd /root wget https://linux.mellanox.com/public/repo/mlnx_ofed/4.1-1.0.2.0/SRPMS/dapl-2.1.10mlnx-OFED.3.4.2.1.0.41102
弹性云服务器场景典型应用 创建支持IB网卡的弹性云服务器 配置单个ECS免密登录 安装和使用MPI 制作私有镜像 创建应用集群 配置ECS集群互相免密登录 在HPC集群上运行MPI应用
修订记录 发布日期 修订记录 2022-08-10 第十次正式发布 新增基于STAR-CCM+部署HPC集群 2021-08-11 第九次正式发布。 新增 1.1-图解HPC解决方案 2019-02-15 第八次正式发布。 新增 配额调整 2018-09-30 第七次正式发布。 修改
实施步骤 创建HPC私有镜像 创建弹性云服务器 配置节点互信 创建SFS Turbo 挂载共享目录 通讯录安装 MPI安装 STAR-CCM+安装与运行 父主题： 基于STAR-CCM+部署HPC集群
裸金属服务器场景典型应用 创建裸金属服务器集群 配置BMS集群互相免密登录 安装和使用MPI（X86 BMS场景） 安装和使用MPI（鲲鹏BMS场景） 在HPC集群上运行MPI应用（X86 BMS场景） 在HPC集群上运行MPI应用（鲲鹏BMS场景）
方案概述 方案应用 HPC提供了超高浮点计算能力解决方案，可用于解决计算密集型、海量数据处理等业务的计算需求，如科学研究、气象预报、计算模拟、军事研究、CAD/CAE、生物制药、基因测序、图像处理等，缩短需要的大量计算时间，提高计算精度。 方案架构 方案优势 降低TCO 可以按需
STAR-CCM+启动相关问题 STAR-CCM+使用OpenMPI启动时，命令中有"-x"和"--mca"导致启动失败 问题现象： STAR-CCM+使用OpenMPI启动时候命令中同时有"-x"和"--mca"会启动失败，OpenMPI不支持"-x"参数和"--mca"同时使用，报错如下图所示。
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