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curl -fsSL get.docker.com -o get-docker.sh sh get-docker.sh 启动一个空白的基础容器，并进入容器。 例如，启动一个CentOS容器。 docker run -it centos 安装依赖包。
如何在Notebook中安装外部库 在Jupyter Notebook中安装 例如，通过Jupyter Notebook在“TensorFlow-1.8”的环境中安装Shapely。 打开一个Notebook实例。 在Jupyter控制面板中，选择“New”（新建），然后选择“TensorFlow
curl -fsSL get.docker.com -o get-docker.sh sh get-docker.sh 步骤2：获取Notebook基础镜像 创建Notebook时所需的自定义镜像，依赖于医疗智能体平台自研的基础镜像，您需要基于获取的基础镜像制作自定义镜像。
curl -fsSL get.docker.com -o get-docker.sh sh get-docker.sh 容器镜像服务支持使用容器引擎1.11.2及以上版本上传镜像。 父主题： 镜像管理
wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2022.10-Linux-x86_64.sh --no-check-certificate bash Anaconda3-2022.10-Linux-x86_64.sh 在第一个暂停中按
} &> ${input-sh}.log ' ], 'inputs': [ {'enum': [], 'name': 'input-sh', 'description': '', 'required': False, 'concurrent'
curl -fsSL get.docker.com -o get-docker.sh sh get-docker.sh 检查安装结果。 执行docker --version命令，如果显示如下类似信息，表示Docker安装成功。
curl -fsSL get.docker.com -o get-docker.sh sh get-docker.sh 配置完成后，运行docker命令，可查看docker的信息。 图1 docker信息 构建fastqc镜像。
curl -fsSL get.docker.com -o get-docker.sh sh get-docker.sh 检查安装结果。 执行docker --version命令，如果显示如下类似信息，表示Docker安装成功。
execution log提示其它因脚本语法的问题，请根据报错信息进行修改，若无法解决请提交工单或联系服务技术支持。 作业状态已为完成态，task仍在运行中 问题现象 作业的状态已为完成态（失败、成功、取消），但是仍有部分task处于运行中。
Dockerfile中不可以指定CMD以及ENTRYPOINT，否则会覆盖基础镜像启动脚本，引起异常。 基础镜像中的PyPi Mirror，默认配置为华为云软件开发云的PyPi mirror。您可以在容器中执行如下命令，查看PyPi Mirror。
编写执行脚本并提交作业 运行分析作业时，流程中的每一个应用称之为一个任务（Task），通过循环读取Task的输入数据，可以实现作业的批量执行。 例如，您可以在本地创建.bat格式的批处理文件，执行该脚本即可批量运行NGS分析作业。
流程是由1各或者N个应用串联构建而成，平台页面以简单拖拽、连接的方式将不同的应用连接起来构建成一个分析流程，避免了写繁杂的bash脚本。 步骤1：订阅应用 进入资产市场，分别订阅fasp，bwa-mem，bamqc，picard-insertsize应用。
镜像上传成功后可以在镜像详情页面查询，复制其镜像地址填入Nextflow脚本中的container字段即可。 process test { container 'swr.
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