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是 String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数
是 String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数
k(在基础镜像中安装化学分子格式转换工具Open Babel),详细步骤如下所示: 步骤1:安装容器引擎 步骤2:获取Notebook基础镜像 步骤3:制作并上传镜像 步骤4:创建并使用Notebook 步骤1:安装容器引擎 在制作自定义镜像时,您需要准备一台安装有Docker的
步骤3:初始化配置 在使用命令行工具前,需要初始化配置信息,通过config命令对eihealth-toolkit进行初始化配置。本节以Windows为例介绍配置过程,Linux和macOS环境配置过程相同。 命令结构 执行health config add命令配置AK、SK、r
场景将大文件上传或下载到Notebook中。 图1 上传和下载文件 OBS存储类型的Notebook 在创建Notebook时,如果“存储配置”选择的是“OBS”。Notebook列表的所有文件读写操作是基于所选择的OBS路径下的内容操作,即Notebook中的数据和OBS中的数
使用create app命令引用本地的配置文件,创建应用。 命令结构 health create app [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --yaml -y 否 本地的应用模板路径。获取应用模板方法请参见应用配置文件说明。 --description -d
使用create workflow命令引用本地的配置文件,创建流程。 命令结构 health create workflow [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --yaml -y 否 本地的流程模板路径。获取流程模板方法请参见流程配置文件说明。 --description
机字符。 消息头:发送邮件时,邮件标题。 语言:选择中文或英文。 删除邮箱后,将不再发送邮件通知。 图1 邮件配置 邮箱配置完成后,单击“测试”,验证配置是否有误。配置成功后将在邮箱中收到测试通知。 图2 邮箱测试通知 收到邮箱测试通知后,单击“更新”,完成邮箱设置。 设置邮箱接收消息范围
与example.ipynb内容基本相同,为python脚本形式示例。 配置eihealth-toolkit(见example.ipynb中配置提示,需要添加config以及切换到当前目录)。 初始化配置请参考步骤3:初始化配置章节。 切换项目,请参考切换项目,运行成功时会提示: health
分子生成基于盘古药物分子大模型,对初始数据集进行采样,多目标、多方向的快速生成新颖且与靶点蛋白亲和力高的化合物。 单击“分子生成”功能卡片,进入配置页面。 输入初始数据集,有两种输入方式: 选择文件:支持SDF、MOL2、PDB、SMI格式文件;小分子支持10-10000个。如果没有初
传受体文件,进行受体蛋白预处理配置。 受体文件仅支持PDB格式,若文件中存在多个受体,默认只处理第一个。受体文件支持上传1个或者多个文件,最多支持输入20个受体文件,文件来源包含数据中心、PDB库、示例数据。 图1 上传受体文件 受体预处理参数配置。 去水:去掉受体蛋白里面的水分子。
排查思路、解决方法请参考查看执行结果章节的说明。 场景4 参数配置的不合理导致的作业执行失败。 解决方法 选择运行失败的分析作业,单击操作列“更多>重试”。 在弹出的提示框中选择“更改参数”。 图6 更改参数 在作业配置页面,修改相关参数后,单击页面右上角的“重试作业”。 图7 重试作业
月。 单击“下一步”,确认订单详情。 单击“立即购买”,并支付订单,完成服务购买。 购买成功后,需要大约30分钟时间完成服务自动部署,请耐心等待。部署完成后,您可以使用注册的华为账号使用医疗智能体平台。 父主题: 准备工作
是 String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数
创建项目 您可以创建一个新的项目。 在平台左上角单击项目名称,选择“创建新项目”。 图1 创建新项目 配置项目信息。 表1 参数说明 参数 说明 项目名称 项目名称。取值范围3~45个字符,包含数字、小写字母、下划线、中划线,且只能以小写字母数字开头结尾。 项目创建成功后,不支持修改名称。
source String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据
步骤4:查看与执行操作命令 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。配置信息导入后,即可查询命令行工具支持的操作,并执行相关命令,使用EIHealth平台。 详细的操作命令请参见其他章节。 查询操作命令列表。 执行health
月。 单击“下一步”,确认订单详情。 单击“立即购买”,并支付订单,完成服务购买。 购买成功后,需要大约30分钟时间完成服务自动部署,请耐心等待。部署完成后,您可以使用注册的华为账号使用医疗智能体平台。 父主题: 准备工作
创建项目 您可以在“项目管理”页面创建一个新的项目。 在“项目管理”页面单击“创建项目”。 配置项目信息。 表1 参数说明 参数 说明 项目名称 项目名称长度限制3-45,以小写字母数字开头结尾,全文包含数字、小写字母、下划线、中划线。 核心项目 如果设置该项目为核心项目,不支持
ARCHIVE_DATA_DELETE 删除归档数据。删除归档数据时给予消息提示,删除结果给予消息提示。 IMPORT_NETWORK_DATA 导入网络数据。导入网络数据时给予消息提示,导入结果给予消息提示。 SUBSCRIBE_DATA 订阅数据。订阅数据时给予消息提示,订阅结果给予消息提示。 DATABASE_IMPORT