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回归型:预测一系列连续变量的模型,主要侧重定量描述。 二分型:预测二分类离散变量的模型,主要侧重定性分析。 模型数据 选择模型数据。可选择数据中心数据,或者示例数据。 仅支持CSV格式,数据条数支持100-50000条,文件不大于5MB。 组织共享 如果关闭,则该模型只能自己使用。 如果开启
EIHealth中的流程由应用搭建形成,应用包含了数据的输入、输出等参数定义。 应用呈现的信息在创建应用过程中定义,包含参数名称、数据类型、描述、默认值等。 单击参数名称,可查看参数的详细信息。 单击输入参数图标,可指定输入数据路径。输出数据路径在新建流程和运行分析作业时可指定。 新建流程
通过丰富的加速技术,实现算法工具的数倍加速,加速生物医疗大数据的分析。 平台由项目管理、数据管理、作业、工具、开发环境、镜像等核心部件组成,各个部件沉淀了丰富的技术细节和人性化的设计。 初学者能够基于页面可视化的完成数据管理、复现业内的分析流程和算法。资深从业者能够基于镜像打造自己的分析流程。
应用场景 基因组分析 提供从基因组数据管理、生物信息分析流程到科研分析管理整个流程的服务,快速实现基因组数据分析及AI建模,提供高性能、高可靠性、高性价比的基因测序计算、存储、分析和AI能力支持,让科研过程标准化、可执行。 基因组测序是新型冠状病毒疑似病例确诊的病原学证据之一,基
性能加速(可选) 当普通的计算资源不满足业务场景时,可以选择购买性能加速资源,加快算法的数据分析速度。 单击“购买性能加速”。选择包年包月或者按需,同时选择购买的性能盘大小。 图1 购买性能加速 父主题: 购买计算资源(主账号操作)
作自定义应用,创建分析流程。 流程 医疗智能体流程包含基因组学分析过程所需应用的执行先后信息以及数据输入输出等定义。分析流程由至少一个应用组成,流程中的各个应用由其前后顺序关系形成数据流,前序应用为后序应用提供输入。医疗智能体基因组分析平台为您提供了多种分析流程,帮助您快速完成分析任务。
DELETE_DATA 数据删除。删除数据时给予消息提示,删除结果给予消息提示。 CLONE_DATA 数据拷贝。数据拷贝时给予消息提示,拷贝结果给予消息提示。 IMPORT_DATA 数据导入。数据导入时给予消息提示,导入结果给予消息提示。 ARCHIVE_DATA 归档数据。归档数据时给予消息提示,归档结果给予消息提示。
图12 性能加速节点信息 购买数据库 使用数据库功能前,需要先购买数据库,数据库只能购买一个。 在“数据库”页面,单击“购买数据库”。 选择“数据库规格”、“性能规格”、“磁盘加密”、“计费模式”、“购买时长”、“购买数量”。 图13 购买数据库 数据库规格:选择“标准版”。 性能规格:根据您的需求选择规格。
在使用Nextflow时,作业运行失败的可能原因 由于Nextflow支持的特殊字符继承了Nextflow原有特性,因此请排查参数值,或者选择的数据名称,或者路径中带的特殊字符是否符合Nextflow原有特性。 建议启动并发作业数最多为8个。 父主题: Nextflow
创建项目 使用create或submit命令创建项目,并可设置项目级数据权限策略。 命令结构 health create project <project-name> [flags] 或 health submit project <project-name> [flags] 表1
单击“功能模块 > 通用工具 > MOL Editor”,进入Mol Editor页面即可操作。可以通过单击右上角的“保存”,将编辑的分子结构保存在数据中心。 图1 保存分子结构 父主题: 通用工具
存储资源 存储资源的计费模式是按需或者购买套餐包的形式, 按需计费可根据数据量的大小收费,故不需要提前进行购买 套餐包需提前购买,当存储用量超过套餐包规格时,超出部分将自动按量按需计费 图1 存储资源 图2 存储套餐包 图3 购买存储套餐包 父主题: 购买计算资源(主账号操作)
只有项目所有者和管理员能修改。 --tags -t 否 项目标签,多个标签使用分号(;)分隔。 只有项目所有者和管理员能修改。 --policy -p 否 设置项目级数据权限策略。只有项目所有者能修改。 用数字0和1表示关闭和打开,以data-share、data-download、data-delete、
String 自动作业的描述,取值范围:输入字符最大长度为255 最大长度:255 database_id 是 String 自动作业依赖的数据库ID 最小长度:1 最大长度:128 database_column 是 String 自动作业状态更新列 最小长度:1 最大长度:55
获取系统资源 使用get命令获取购买的计算资源、性能加速资源、数据库资源、存储资源列表。 命令结构 health get resource [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --type -t 是 名称,支持computing、performance、d
kit)是配套EIHealth平台,为EIHealth平台各功能组件提供命令行管理工具。借助此工具,可以辅助您对EIHealth平台项目中数据、应用、流程和作业资源进行管理和使用。 操作步骤 下载命令行工具。 安装命令行工具。 本示例中以Windows系统为例,介绍安装命令行工具的方法。
目成员角色。 数据管理 您可以使用该工具查看、上传、下载、复制、导入、引入、创建和删除项目中的数据,创建、获取、删除、恢复归档数据,也可以对数据作业执行获取、删除、重试、取消操作。 数据库管理 您可以使用该工具创建、获取、删除和导入数据库模板,创建、获取和删除数据库实例,也可以引用数据库。
套餐包到期后,如果账号欠费,会根据“客户等级”和“订购方式”定义不同的保留期时长,保留期内您将不能进行资源访问,保留期内资源处理和费用详见“保留期”。保留期满仍未续订或充值,数据将被删除且无法恢复。 当平台处于冻结状态,且资源不再使用,您可以进入EIHealth控制台,在操作列的“更多”中手动删除或释放平台。 图1
创建FastQC应用样例 本章节提供了在EIHealth平台创建FastQC应用的样例,帮助您快速熟悉平台的使用方法。 FastQC是一款高通量序列数据的质量检测工具,此样例基于开源的FastQC软件,将软件制作成镜像,上传至平台,并基于此镜像创建应用。应用创建完成后可以直接使用FastQ
如何将生物信息学软件封装为镜像并上传 本章节提供了在EIHealth平台创建FastQC应用的样例,帮助您快速熟悉平台的使用方法。 FastQC是一款高通量序列数据的质量检查工具,此样例基于开源的FastQC软件,将软件制作成镜像,上传至平台,并基于此镜像创建应用。应用创建完成后可以直接使用FastQ