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社区OpenMPI 操作场景 本节指导用户安装和使用社区OpenMPI(以3.1.1版本的OpenMPI为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装HPC-X工具套件。 下载需要的HPC-X工具套件以及OpenMPI。 使用社区OpenMPI时,需要同时使用Mellanox的HPC-X
Platform MPI 操作场景 本节指导用户在ECS上安装和使用Platform MPI应用(以版本platform_mpi-09.01.04.03r-ce为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装Platform MPI。 执行以下命令,安装需要的库文件。
配置BMS集群互相免密登录 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上进行相关设置,并使其可以相互免密登录。 背景信息 $:表示在普通用户下,执行相关操作。 #:表示在管理员用户下,执行相关操作。 普通用户切换至管理员用户,请使用命令sudo su。 前提条件 已成功创建BMS,并绑定了弹性IP进行登录。
HPC断点续算计算方案 操作场景 在HPC领域很多应用本身是支持断点续算功能的,例如LAMMPS, GROMACS。同时HPC常用的调度软件也对断点续算有集成支持,如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例,介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令,安装FFTW软件。
Spectrum MPI 操作场景 本节指导用户安装和使用IBM Spectrum MPI(以IBM Spectrum MPI v10.1为例)。 其中,IBM Spectrum MPI v10.1版本当前支持的操作系统列表如下: IBM Spectrum MPI 10.1.0.1
方案概述 方案应用 HPC提供了超高浮点计算能力解决方案,可用于解决计算密集型、海量数据处理等业务的计算需求,如科学研究、气象预报、计算模拟、军事研究、CAD/CAE、生物制药、基因测序、图像处理等,缩短需要的大量计算时间,提高计算精度。 方案架构 方案优势 降低TCO 可以按需
IB驱动自带的OpenMPI 操作场景 本节指导用户安装和使用IB驱动自带的OpenMPI(以版本3.0.0rc6为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 检查是否已安装IB驱动。 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 执行以下命令,切换为root
资源和成本规划 所需资源如表1所示,具体资源的实际费用请以对应官网价格显示为准。 表1 资源和成本规划 序号 资源 资源说明 获取路径 数量 费用 1 STAR-CCM+ 使用STAR-CCM+15.02版本。 建议从官方网站获取 1 以官网显示价格为准。 2 MPI(可选) Plateform
RoCE RoCE概念 RDMA over Converged Ethernet (RoCE)是一种网络协议,允许应用通过以太网实现远程内存访问。目前RoCE有两个协议版本,v1和v2。其中RoCE v1是一种链路层协议,允许在同一个广播域下的任意两台主机直接访问。而RoCE v
挂载共享目录 安装软件 yum install nfs-utils 挂载SFS Turbo 将SFS Turbo挂载到/opt/Siemens目录 mkdir /opt/Siemens # 在/etc/fstab中添加开启自动挂载 echo "192.168.0.15:/ /opt/Siemens
RDMA RDMA概念 远程直接内存访问(即Remote Direct Memory Access)是一种直接内存访问技术,它将数据直接从一台计算机的内存传输到另一台计算机,无需尤其是面对高性能计算HPC、大数据分析和浪涌型IO高并发、低时延应用,现有TCP/IP软硬件架构和应用
安装和使用MPICH 操作场景 本节指导用户在鲲鹏BMS集群上安装和使用MPICH应用(以版本mpich-3.3.2为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装MPICH。 下载MPICH。 下载地址:https://aur
MPI安装 Platform MPI安装 PlatformMPI使用STAR-CCM+自带的,不需要安装。 OpenMPI安装(可选) 若使用STAR-CCM+自带的,可不用安装。 cd /root tar zxvf openmpi-4.0.1.tar.gz cd openmpi-4
配置节点互信 配置节点互信免密登录 STAR-CCM+集群运行时候需要跨节点运行,推荐使用互信免密登录。 # 生成ssh公钥和私钥 ssh-key-gen # 拷贝公钥到指定主机的~/.ssh/authorized_key文件中 ssh-copy-id root@目标主机IP 例如:ssh-copy-id
安装和使用社区OpenMPI 操作场景 本节指导用户在BMS上安装和使用社区OpenMPI(以4.0.2版本为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装OpenMPI。 下载社区OpenMPI,版本号为“openmpi-4
通讯录安装 Udapl安装和测试 Udapl安装 cd /root wget https://linux.mellanox.com/public/repo/mlnx_ofed/4.1-1.0.2.0/SRPMS/dapl-2.1.10mlnx-OFED.3.4.2.1.0.41102
RoCE网络问题 dtest或rping打流测试网络双向不通问题 问题现象: dtest/rping打流测试网络双向不通问题:A机器作为Server端,B机器作为Client端,dtest/rping测试RoCE网络异常;调换A、B机器角色,B机器作为Server端,A机器作为C
安装和使用Spectrum MPI 操作场景 本节指导用户在BMS集群上安装和使用Spectrum MPI应用(以版本10.01.01为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 背景信息 IBM Spectrum MPI v10.1版本当前支持的操作系统列表如下: IBM
安装和使用Platform MPI 操作场景 本节指导用户在BMS集群上安装和使用Platform MPI应用(以版本platform_mpi- 09.01.04.03r-ce.bin为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。
安装和使用社区OpenMPI 操作场景 本节指导用户在BMS上安装和使用社区OpenMPI(以3.1.1版本为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装HPC-X工具套件。 使用社区OpenMPI时,需要同时使用Mellanox的HPC-X