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显示示例yaml文件内容,以yaml格式打印到控制台,需要直接获取示例文件可使用Linux输出流重定向。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 获取模板列表
获取指定归档的全部数据清单,需要与archive-id一起使用才生效。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 查看归档列表 health get archive -l 2 -o 3 # 返回结果如下 Name
Non-Authoritative Information 非授权信息,请求成功。 204 No Content 请求完全成功,同时HTTP响应不包含响应体。 在响应OPTIONS方法的HTTP请求时返回此状态码。 205 Reset Content 重置内容,服务器处理成功。 206 Partial Content
供应商名称。 --logo -l 是 供应商图标本地路径。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 设置供应商名称 health edit vendor-config --name xxx1 --log
无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 获取数据库实例列表 health get db instance # 返回结果如下 Database
是 需要进入的项目名称,名称在创建项目时由用户填写。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 执行如下命令,切换到名为“lmx-test-01”的项目。 health switch project
用户名。 --job-name -j 否 任务名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 使用health get job -s命令获取模板,详细的模板介绍和使用请参见获取作业模板。
--t -n 否 指定用户的securitytoken。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 若当前所在目录为src2,新增子目录dataset。 health mkdir dataset
无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 从源项目lmx-project-01导入应用,并重命名应用。 health import app
-z 否 可用区id。如:cn-north-7c。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 获取计算资源列表 health get resource -t computing # 执行成功返回结果如下
您可以使用“\*”代表匹配“*”字符本身,使用“\?”代表匹配“?”字符本身。如果待复制的对象名匹配该参数,则跳过该对象的复制。 建议使用引号传递该匹配模式( macOS/Linux操作系统使用单引号,Windows操作系统使用双引号)防止特殊符号被操作系统转义,导致不可预期的结果。 该匹配模式作用于对象全路径(含从
无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 获取作业列表 health get data-job # 返回结果如下 Name
按指定的对象名前缀批量删除多版本对象和多版本删除标记。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 删除单个数据 health rm /src2/test.txt 删除单个文件夹 health
无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 引用单个数据库实例 health import db instance 12345 --project
无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 从源项目lmx-project导入流程,并重命名流程。 health import workflow
医疗智能体EIHealth平台迭代更新 支持消息、邮件、安全、商标设置。 支持通过命令行工具对平台进行管理和使用,支持Windows、Linux系统。 开放API 优化 优化流程的搭建和运行过程。 商用 用户指南 命令行工具 API参考 2020年11月 序号 功能名称 功能描述 阶段 相关文档 1
--label -l 否 根据label标签搜索workflow 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 使用health get workflow -s命令获取模板,详细的模板介绍和使用请参见获取流程模板。
--t -n 否 指定用户的securitytoken。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 删除某个文件的分段任务 health abort /tmp/a -r -f # 返回结果如下
方式2:使用预置应用搭建NGS流程 将EIHealth平台预置的应用构建成流程,并运行作业。以二代基因组分析流程:fastp,bwa-mem,bamqc,picard-insertsize两个算法为例。 应用是对每个软件的镜像封装,将应用封装好后可以反复利用并也可以让其他人很容易的使用,不用担心复杂的开发环境问题。
--label -l 否 根据label标签搜索应用。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 使用health get app -s命令获取模板,详细的模板介绍和使用请参见获取应用模板。