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本地workflow文件路径,可以是zip或nf文件。 --name -n 是 流程名称。 --description -d 否 workflow的详细描述信息。 --labels -l 否 流程标签列表。以","分隔,如:"a,b"。 --main_file -m 否 流程主文件名,默认为:main
自定义属性的ID(API侧) 最小长度:1 最大长度:64 prop_definition 否 PropDefinition object 属性定义的元信息 表5 PropDefinition 参数 是否必选 参数类型 描述 id 否 String 属性业务侧ID 最小长度:1 最大长度:128
药物通用接口 生成分子SVG图 生成分子SDF三维结构 受体预处理 受体信息解析 受体口袋检测 配体格式转换为SMILES 生成相互作用2D图 计算配体间的3D结构差异 创建配体文件预览任务 查询配体文件预览任务 删除配体文件预览任务 创建配体相似性图计算任务 查询配体相似性图计算任务
--workflow -w 否 本地workflow文件路径,可以是zip或nf文件。 --description -d 否 workflow的详细描述信息。 --labels -l 否 流程标签列表,用","分割,如"a,b,c"。 --main_file -m 否 流程主文件名。 --params
--workflow-id -w 是 nextflow作业ID。 --name -n 是 作业名称。 --description -d 否 作业的详细描述信息。 --labels -l 否 作业标签列表。以","分隔,如:"a,b"。 --add-command -a 否 作业额外执行的命令,如:--param1
自定义属性的ID(API侧) 最小长度:1 最大长度:64 prop_definition PropDefinition object 属性定义的元信息 表8 PropDefinition 参数 参数类型 描述 id String 属性业务侧ID 最小长度:1 最大长度:128 name String
参数类型 描述 name 是 String 自定义属性名称 最小长度:1 最大长度:32 description 否 String 自定义属性描述信息 最小长度:0 最大长度:256 type 是 String 属性预测类型 枚举值: binary numerical smiles 是 Array
String 自定义属性的ID(API侧) 最小长度:1 最大长度:64 prop_definition 否 表9 object 属性定义的元信息 表9 PropDefinition 参数 是否必选 参数类型 描述 id 否 String 属性业务侧ID 最小长度:1 最大长度:128
自定义属性的ID(API侧) 最小长度:1 最大长度:64 prop_definition 否 PropDefinition object 属性定义的元信息 表9 PropDefinition 参数 是否必选 参数类型 描述 id 否 String 属性业务侧ID 最小长度:1 最大长度:128
若设置了该参数,必须确保更新了配置文件中客户端跨区域复制的相关配置信息,具体可参考更新配置文件。复制时源桶对应的配置信息为配置文件中的:akCrr/skCrr/tokenCrr/endpointCrr,目标桶对应的配置信息为配置文件中的:ak/sk/token/endpoint。 开
若设置了该参数,必须确保更新了配置文件中客户端跨区域复制的相关配置信息,具体可参考更新配置文件。复制时源桶对应的配置信息为配置文件中的:akCrr/skCrr/tokenCrr/endpointCrr,目标桶对应的配置信息为配置文件中的:ak/sk/token/endpoint。 开
在配置文件中通过recordMaxLogSize和recordBackups分别配置。 当涉及多文件/文件夹时,如需确认失败任务的具体错误信息,可参考结果清单文件夹下的失败结果清单文件“rm_failed_report_时间_TaskId.txt”及日志路径下的日志文件。 --e
对于系统级别的管理员用户(购买平台的账户),可以在平台右上角用户名中选择“用户管理”,在“操作”列中选择“安全设置”,重置其他用户的邮箱、手机和密码信息。 单击“重置邮箱”后,可以选择清除邮箱或绑定新邮箱。 单击“重置手机号”后,可以选择清除手机号或绑定新手机号。 单击“重置密码”后,输入
自定义属性的ID(API侧) 最小长度:1 最大长度:64 prop_definition PropDefinition object 属性定义的元信息 表12 PropDefinition 参数 参数类型 描述 id String 属性业务侧ID 最小长度:1 最大长度:128 name
prop_names Array of strings 分子ADMET属性名列表 query query object 初始查询分子的属性信息 result Array of SearchResultItem objects 查询结果列表 表6 query 参数 参数类型 描述 smiles
自定义属性的ID(API侧) 最小长度:1 最大长度:64 prop_definition PropDefinition object 属性定义的元信息 表13 PropDefinition 参数 参数类型 描述 id String 属性业务侧ID 最小长度:1 最大长度:128 name
QED: quantitative estimate of drug-likeness, 成药性。 结果解释:大于0.67为易获取,0.49 ~ 0.67不易获取,小于0.34为化合物太复杂。 SAscore: Synthetic accessibility score,合成可及性分数,旨在评估分子的合成难易程度。
-variantqc应用构成。在创建应用前,请先制作并上传应用所需的镜像。搭建NGS流程所需的镜像和版本如表1所示。 表1 NGS流程镜像信息 NGS流程步骤 描述 依赖镜像及版本 镜像下载命令 Read Quality 对测序得到的fastq数据进行质控。 fastp:0.20
在配置文件中通过recordMaxLogSize和recordBackups分别配置。 当涉及多文件/文件夹时,如需确认失败任务的具体错误信息,可参考结果清单文件夹下的失败结果清单文件“mv_failed_report_时间_TaskId.txt”及日志路径下的日志文件。 --e