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在一起，利用所有被连接系统的综合计算能力来处理大型计算问题，所以又通常被称为高性能计算集群。 HPC的业务特点 科学研究、气象预报、仿真实验、生物制药、基因测序、图像处理等行业都涉及高性能计算集群来解决大型计算问题，管理节点对计算任务进行分解，交给不同的计算节点完成计算。 各种业
MAKE/Makefile.mpi 根据图1、图2，修改红框标识中的内容。其中，版本号需根据实际情况进行填写。 只修改图1、图2中红框标识的内容。 图1 修改Makefile文件01 图2 修改Makefile文件02 执行以下命令，编译lammps，并将当前目录生成的lmp_mpi文件拷贝至“/share”目录。
hello 不同版本的MPI运行的hello文件是不同的，都需要使用命令mpicc hello.c -o hello对hello.c文件重新编译。 执行以下命令，在单个BMS上运行社区OpenMPI。 $ mpirun -np 2 /home/rhel/hello 图4 社区OpenMPI运行成功
执行下列命令，导入环境变量。 $ source ~/.bashrc 执行下列命令，查看是否导入成功。 $ which mpirun 图2 Intel MPI环境变量导入成功 回显结果如图2所示，表示环境变量导入成功。 执行以下命令，在单个BMS上运行Intel MPI。 执行以下命令，生成可执行文件。
hello 不同版本的MPI运行的hello文件是不同的，都需要使用命令mpicc hello.c -o hello对hello.c文件重新编译。 执行以下命令，在单个BMS上运行社区OpenMPI。 $ mpirun -np 2 /home/rhel/hello 图4 社区OpenMPI运行成功
4 export MPI_IB_PKEY=步骤2.1中获取的pkey $source ~/.bashrc 如果存在多个pkey，使用英文逗号隔开。 执行以下命令，检查环境变量是否配置成功。 # which mpirun 图3 Platform MPI环境变量导入成功 执行下列命令，在单个ECS上运行Platform
form_mpi”文件夹下。 图1 Platform MPI成功安装 配置环境变量。 执行以下命令，获取pkey。 # cat /sys/class/infiniband/mlx5_0/ports/1/pkeys/* | grep -v 0000 图2 获取pkey 普通用户下，在~/
创建文件系统”。 图1 创建文件系统 2.在"创建文件系统"界面的"文件系统类型"选项中，根据业务需要，选择"HPC型"或"HPC缓存型"文件系统类型。 图2 选择文件系统类型 3.在"创建文件系统"界面的"选择网络"选项中，需注意与购买的弹性云服务器选择相同的网络配置。 4.在
执行下列命令，导入环境变量。 $ source ~/.bashrc 执行下列命令，查看是否导入成功。 $ which mpirun 图2 MPICH环境变量导入成功 回显结果如图2所示，表示环境变量导入成功。 执行以下命令，在单个BMS上运行MPICH。 执行以下命令，生成可执行文件。 $ mpicc
本节操作介绍创建HPC集群的方式，以及创建流程，引导您一站式完成集群的创建、配置，并在HPC-S²上完成高性能计算作业。 部署方式简介 购买高性能计算解决方案：根据实际计算需求购买HPC集群，可以在购买时同时指定管理节点配置与计算节点配置。 图1 购买HPC集群 使用已有节点
firewalld status 图1 确认关闭防火墙成功 依次登录集群中所有BMS，重复执行1.b～1.c，关闭所有BMS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令，查看BMS的主机名。 $ hostname 图2 查看BMS的主机名 依次登录集群中所有BMS，重复执行1
firewalld status 图1 确认关闭防火墙成功 依次登录集群中所有BMS，重复执行1.b～1.c，关闭所有BMS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令，查看BMS的主机名。 $ hostname 图2 查看BMS的主机名 依次登录集群中所有BMS，重复执行1
firewalld status 图1 确认关闭防火墙成功 依次登录集群中所有BMS，重复执行1.b～1.c，关闭所有BMS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令，查看BMS的主机名。 $ hostname 图2 查看BMS的主机名 依次登录集群中所有BMS，重复执行1
firewalld status 图1 确认关闭防火墙成功 依次登录集群中所有BMS，重复执行1.b～1.c，关闭所有BMS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令，查看BMS的主机名。 $ hostname 图2 查看BMS的主机名 依次登录集群中所有BMS，重复执行1
系统进入“服务配额”页面。 图1 我的配额 您可以在“服务配额”页面，查看各项资源的总配额及使用情况。 如果当前配额不能满足业务要求，请参考后续操作，申请扩大配额。 如何申请扩大配额？ 登录管理控制台。 在页面右上角，选择“资源 > 我的配额”。 系统进入“服务配额”页面。 图2 我的配额 单击“申请扩大配额”。
status firewalld.service 图1 成功关闭防火墙 依次登录集群中所有ECS，重复执行1.a～1.c，关闭所有ECS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令，查看ECS的主机名。 # hostname 图2 查看主机名 依次登录集群中所有ECS，重复执行2
firewalld.service 图1 关闭防火墙成功 依次登录集群中所有ECS，重复执行步骤1.1～步骤1.3，关闭所有ECS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令，查看ECS的主机名。 # hostname 图2 查看ECS的主机名 依次登录集群中所有ECS，重复执行步骤2
3eval_170901-rh7_Apr11.x86_64.rpm 下载需要的HPC-X工具套件。 IBM MPI在EDR SR-IOV场景下的运行需要HPC-X提供的MXM库的支持，HPC-X 的下载需要参考弹性云服务器操作系统的版本以及IB驱动版本，例如，下载的HPC-X版本为：hpcx-v2.0.0-gcc-MLNX_OFED_LINUX-4
本节指导用户安装和使用社区OpenMPI（以3.1.1版本的OpenMPI为例）。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装HPC-X工具套件。 下载需要的HPC-X工具套件以及OpenMPI。 使用社区OpenMPI时，需要同时使用Mellanox的HPC-X 套件，HPC-X 的下载需要参考弹性云服
以不输入密码登录BMS。 $ ssh localhost 图1 免密登录BMS 系统回显结果如图1所示，可以无密钥登录本节点，表示权限配置成功。 依次登录集群中其他BMS，重复执行步骤1～5。 执行以下命令，验证参加测试的BMS之间是否可以免密码互相登录。 $ ssh 用户名@SERVER_IP
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