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(NGS)是一种基于边合成边测序的方式。NGS在保持了测序高准确度的同时，大幅地提高了测序速度，有力推动了相关研究。目前，NGS已广泛应用于全基因组测序、外显子测序、表观遗传学修饰等重要的生物学问题。 本示例中NGS流程基于医疗智能体（EIHealth）平台搭建，流程以fastq格式数据作为
Generation Sequencing (NGS)是一种基于边合成边测序的方式。NGS在保持了测序高准确度的同时，大幅的提高了测序速度。目前NGS已经普遍的应用于全基因组测序、全外显子测序、转录组测序表观遗传学等领域。 该流程以NGS得到的fastq作为输入，通过质控，比对等步骤，输出针对f
创建分析作业 创建分析作业有以下几种不同的方式，您可以任选其中一种方式。 通过“新建流程”时创建 通过“作业”页面创建 •新建作业 •克隆作业 通过“工具”页面创建 通过“上传作业”创建 如果在创建应用时打开了“并发”开关，可以设置多个参数值，批量执行作业。 可通过在“系统资源 >
在平台右上角用户名中选择“系统设置”，设置邮件配置。 服务器地址：邮箱开通SMTP功能时的服务器地址，不同邮箱开通SMTP方式不同，请使用搜索引擎查找邮箱开通SMTP方式。 邮箱地址：填写邮箱地址，用于发送EIHealth平台的消息通知。 用户名：邮箱的用户名，如果未修改过，默认为邮箱地址。
作业”中查看药筛作业的后台进程。 图1 查看作业进程 对接完成后的小分子构象下载 单击应用中的“qvina-w”，获取输出结果的路径。 文件的命名方式为：蛋白质名称_vs_配体名称_blinddock.pdbqt。 图2 下载小分子构想数据 父主题： 运行大规模虚拟药筛任务
依据“应用参数说明表”依次创建搭建NGS流程所需的应用。 图2 填充应用内容 对于测序得到的大量数据，如果需要批量执行NGS分析，可以选取以下任意一种方式进行批量执行： 方式一：对于输入参数，打开“并发”开关，在启动作业时，每个参数可以设置多个参数值，自动生成多个作业并发执行。并发执行的作业数为设置的参数值个数的乘积。
描述 id String 作业ID。 limit_concurrency Integer 限制的并发量。 请求示例 创建聚类分析作业，输入方式为分子文件，作业名称为demo-job。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-proj
描述 id String 作业id。 limit_concurrency Integer 限制的并发量。 请求示例 创建分子生成作业，输入方式为分子表达式，作业名称为demo-job，分子文件为project:/dir/file，靶点设置的受体文件为project:/test.pdb，口袋中心位置为[0
、药物研发和临床研究三个领域提供的专业AI研发平台。平台提供大量相关模型、算法及数据资源，是一站式的医疗研发平台。EIHealth以开放API的方式提供给用户，您可以根据本文档提供的API来使用服务，支持的全部API请参见API概览。 在调用医疗智能体平台API之前，请确保已经充
获取示例数据 本示例中使用小分子化合物SMILES结构式文件和蛋白3D结构PDB文件作为输入数据，可通过如下方式获取。 登录医疗智能体平台，在“资产市场”中订阅“docking summary测试数据”至所需的项目中。 图1 示例数据 父主题： 新型冠状病毒（COVID-19）虚拟药物筛选
出作为另一个应用的输入，流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流。 在EIHealth平台，创建流程通过拖拽应用的方式完成。在命令行工具中，该过程以配置文件的形式给出，对于由多个应用搭建出来的流程，命令行工具中通过指定不同应用间的输入输出关系，完成应用的连接。您可以基于获
resource_id String 监控资源id device_id String 显卡id 请求示例 批量下载监控数据，设置起止时间，实时数据，统计方式为max, 指定资源id列表 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{proj
请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 quote_project_id 是 String 引入项目ID 最小长度：1 最大长度：128 sub_paths 是 Array of strings 引入路径集 最小长度：0 最大长度：2000 数组长度：1 - 50 响应参数 无 请求示例
进行导入。 图1 导入用户 导入的IAM子用户需要具有管理控制台访问方式。 导入用户时不能超出配额。如果超出配额，进行配额调整后，5分钟后生效。 以用户组的方式导入时，若超出配额的部分会导入失败。 以用户组的方式导入时，用户组里已经导入到平台的用户，不算统计个数。例如，用户组A里50个用户，10个已经导入平台，
下载数据 在EIHealth平台下载数据 下载数据操作会产生流量费用，计费方式为按需计费，计费详情请参考OBS数据下载费用。 以下操作步骤是在“数据”页面下载数据至本地。您也可以使用命令行工具实现数据的下载。 在EIHealth平台“项目 > 数据”页面，展开数据文件夹，选择待下载的数据。
Repository for Container，简称SWR）进行简单易用、安全可靠的镜像管理。单击项目名称，进入所选项目，在“镜像”页签中，以列表形式展示了项目中的镜像。您可查看镜像的详细信息，执行镜像分类、添加描述、删除和查询操作。 图1 镜像管理 镜像用途 用于创建分析应用 应
下载操作将会产生流量费用，具体可参考计费说明。 图2 查看结果（1） 分子属性预测结果支持以卡片视图的形式进行查看，参考图3，在卡片视图中： 单击右上方的选择下拉框，可以选择分子的排序方式，将分子按照所选的排序方式进行展示。 图3 查看运行结果（2） 图4 排序方式 单击每个分子卡片右上方的，可以收藏该分子属性预测结果，收藏后的结果可在收藏夹页直接查看。
安装容器引擎 容器引擎是一个开源的引擎，可以轻松的为任何应用创建一个轻量级的、可移植的、自给自足的容器。 容器引擎几乎支持在所有操作系统上安装，用户可以根据需要选择要安装的容器引擎版本。请使用自己的电脑搭建Docker环境，或者使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。
高级筛选 下载操作会产生流量费用，具体可参考计费说明。 分子生成结果支持以卡片视图的形式进行查看，参考图10，在卡片视图中： 单击右上方的选择下拉框，可以选择分子的排序方式，将分子按照所选的排序方式进行展示。 图9 排序方式 单击每个分子卡片右上方的可以收藏分子生成结果，收藏的结果可在收藏夹页直接查看。
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