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输入分子 单击“下一步”，进入靶点设置，此步骤为可选步骤，如果需要设置靶点，并且将对接结合能作为一个约束条件进行优化，需要进行配置。最多可添加2个靶点。在添加靶点后，会进行单分子预对接，可查看Top1的对接打分与构象。 如果不需要设置靶点，此步骤可以进行省略，如果设置了靶点，作业运行时间会加长。
苗头化合物发现 分子对接 分子属性预测 分子搜索 CPI预测 分子生成 父主题： 功能模块
置靶点，并且将对接结合能作为一个约束条件进行分子生成，需要进行配置。最多可添加2个靶点。 如果不需要设置靶点，此步骤可以进行省略，如果设置了靶点，作业运行时间会加长。 通过“靶点设置”上传靶点，并且设置对接口袋。 此处靶点设置为可选参数，如果选择靶点设置，可以将对接活性作为一个约
查看药筛作业和结果下载 查看作业进程 用户可以在“项目 > 作业”中查看药筛作业的后台进程。 图1 查看作业进程 对接完成后的小分子构象下载 单击应用中的“qvina-w”，获取输出结果的路径。 文件的命名方式为：蛋白质名称_vs_配体名称_blinddock.pdbqt。 图2
设置靶点口袋发现文件 查看靶点口袋发现结果。 单击作业名称，在输出结果页面，可以单击“查看轨迹”，下载运动轨迹。可以单击”下游分析”，将发现的口袋作为对接口袋进行分子对接。也可以在右边口袋列表中查看口袋信息。 单击口袋列表的，可以收藏靶点口袋发现结果，收藏后可在收藏夹页进行查看。 图2 查看靶点口袋发现结果
Dockerfile命令，进入Dockerfile文件中，编写文件。 FROM ubuntu:16.04 # FastQC依赖java运行，需安装java环境。安装执行下载、解压缩的软件包 RUN apt-get update && apt-get upgrade -y \
Dockerfile命令，进入Dockerfile文件中，编写文件。 FROM ubuntu:16.04 # FastQC依赖java运行，需安装java环境。安装执行下载、解压缩的软件包 RUN apt-get update && apt-get upgrade -y \
支持分子的编辑、标注。 测量、测量距离、角度、二角面等。 结构叠合，将不同结构叠合在一起，用于比较结构差异。 输出指定蛋白口袋的位置及大小，用于分子对接。 导出不同分辨率的图片文件。 播放与制作分子动力学轨迹动画。 父主题： 通用工具
挥着不可替代的基础性的作用；也将支撑病毒溯源、变异进化、致病机理等研究工作。华为云联合多家科研单位，推出基因组自动化鉴定云平台。该平台直接对接人体样本的RNA二代测序原始数据，具有对数据全自动质量控制、拼接和病毒组成分析等功能，实现了对样本中可能存在的包括新型冠状病毒在内的各种病
ReceptorDrugFile object 受体文件 engine String 对接引擎，支持DSDP、AUTODOCK_VINA。 缺省值：AUTODOCK_VINA 最小长度：0 最大长度：15 docking_type String 对接类型，支持BLIND_DOCKING、POCKET_DOCKING。
object 受体文件。 engine 否 String 对接引擎，支持DSDP、AUTODOCK_VINA。 缺省值：AUTODOCK_VINA 最小长度：0 最大长度：15 docking_type 否 String 对接类型，支持BLIND_DOCKING、POCKET_DOCKING。
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-bam ${bam-file} -outdir ${out-dir} -nt 8 --java-mem-size=80G 镜像：picard-insertsize:2.23.3 启动命令： java -jar /usr/picard/picard.jar CollectInsertSizeMetrics
ReceptorDrugFile object 受体文件。 engine String 对接引擎，支持DSDP、AUTODOCK_VINA。 缺省值：AUTODOCK_VINA 最小长度：0 最大长度：15 docking_type String 对接类型，支持BLIND_DOCKING、POCKET_DOCKING。
Score、Similarity（侧链修饰/骨架跃迁场景）、QED。 Score：代表小分子可合成性的综合打分。 Vina Score：代表分子如果添加了靶点，将会计算对接结合能。 Similarity：靶点口袋分子设计后的分子与原始分子的相似度。 QED：代表分子的成药性。 图4 查看运行结果（1） 图5 查看运行结果（2）
单击作业名称，进入作业结果页面，拟时结果根据构象RMSD聚类。 单击“查看轨迹”，下载运动轨迹。 单击“下游分析”，将聚类之后的不同构象进行分子对接。 单击每一个Model的按钮，查看构象。 单击每个Model的按钮，可以收藏构象，收藏后可直接在收藏夹页查看。 图3 靶点优化结果页面 图4
scheduled，请根据日志信息扩容计算资源。 execution log提示can't lock file，重试或者克隆作业即可。 execution log提示java.text.ParseException: Unparseable date，请提交工单或联系服务技术支持。 execution log
优化后小分子的综合打分。 Vina Score1 分子优化如果添加了靶点，将会计算对接结合能，并按照Vina Score进行排序，Vina Score Top1分数。 Vina Score2 分子优化如果添加了靶点，将会计算对接结合能，并按照Vina Score进行排序，Vina Score Top2分数。
#设置root用户为后续命令的执行者 USER root #执行操作 RUN yum update -y RUN yum install -y java #使用&&拼接命令 RUN touch test.txt && echo "abc" >>abc.txt #对外暴露端口 EXPOSE
#设置root用户为后续命令的执行者 USER root #执行操作 RUN yum update -y RUN yum install -y java #使用&&拼接命令 RUN touch test.txt && echo "abc" >>abc.txt #对外暴露端口 EXPOSE
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