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构相似的化合物聚成一类,从而找到有效骨架 ,辅助苗头化合物发现。 单击“功能模块 > 通用工具 > 聚类分析”功能卡片,进入配置页面。 图1 聚类分析配置页面 输入方式:选择文件和手动输入类型。 上传分子文件:选择可上传的分子文件。分子文件支持SMI格式文件;文件大小不超过5G;小分子支持10-10
情况,直至购买了计算资源或者任务超时才会停止。 单击平台右上角的账号名称,会出现账号的相关操作,包括系统资源,系统配置等。注意这里只有管理员账号有系统资源,系统配置等操作,具体说明请参见用户管理。 图1 系统资源 父主题: 购买计算资源(主账号操作)
图1 设置靶点优化配置页面 单击“下一步”,配置靶点优化配置参数。 MD引擎:仅支持GROMACS。 时间步长:MD模拟的时间步长,范围支持0<时间步长≤5fs,默认是2fs。 温度:MD模拟的温度,范围支持0<温度≤1000K,默认是300K。 配置MD的计算步骤 Energy
应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 无 请求示例 删除模型。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/drug-models/{model_id} 响应示例 无 状态码 状态码 描述
当数据过大,或者数据处于服务器上时,页面传输并不是很方便,所以可以利用EIHealth平台的命令行工具进行数据文件、文件夹传输。命令行配置方法请参见配置命令行工具。 上传数据 使用命令行工具upload命令,将本地数据上传到EIHealth平台中。该命令不支持将数据上传到引用目录。
枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format 否 String 文件格式
枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format 否 String 文件格式
头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 无 请求示例 删除性能加速资源 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/system/perf
消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 无 请求示例 删除扩容策略 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/system/auto
状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 count Integer 所有消息总数 请求示例 获取消息统计信息 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/messages/statistics
头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 无 请求示例 开启自动扩容策略 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/system/auto
请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 shareable 是 Boolean 是否共享。 响应参数 无 请求示例 设置模型为共享。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/drug-models/{model_id} { "shareable"
消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 无 请求示例 删除计算资源 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/system/comp
头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 无 请求示例 关闭自动扩容策略 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/system/auto
创建项目 新用户进入平台后需要自己创建项目,单击“创建项目”按钮,填写项目名称以及选择对应的数据保护策略,数据保护策略参考下面配置。 图1 创建项目 单击项目名称可进入到对应的项目中。 图2 进入项目
消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 无 请求示例 取消药物作业 https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id
Subject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 无 请求示例 清理Nextflow缓存 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/nextflow/clean-cache
息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 无 请求示例 删除药物作业。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id
息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 无 请求示例 删除数据库资源 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/system/database-resources/{id}
消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 无 请求示例 取消收藏资产 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/assets/{asset_id}/stars