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靶点口袋发现 靶点口袋发现实现全新元动力学算法,高效遍历柔性蛋白表面,找到潜在口袋位置。 单击“靶点口袋发现”功能卡片,进入配置页面。 在配置页面,选择靶点文件、探针文件,配置相关参数信息。 靶点文件:支持PDB格式文件。 探针文件:探针分子建议原子数不超过400,分子量过大可以
图17 查看聚类结果 单击某个聚类的操作列的“查看详情”,即可进入聚类详情页面,聚类详情页支持以卡片、列表以及3D的形式查看。默认展示卡片页面,用户可自行进行切换。 每个结果页面只用进行一次聚类分析操作。 聚类结果是存成文件,如果文件被删或者获取不到的话会有警告, 聚类结果不存在。此时可以单击“重新聚类分析”。
靶点优化 靶点优化基于分子动力学模拟和结构聚类,实现靶点结构优化 单击“靶点优化”功能卡片,进入配置页面。 配置靶点文件和相关参数信息。 靶点文件:支持PDB格式文件,文件大小不能超过10M。若文件中含有多个受体,默认只处理第一个。 靶点预处理: 去配体:提交任务时系统会自动删除配体。
CPI预测 CPI预测基于蛋白质的一级序列和化合物的2D结构进行靶点匹配,精确的预测化合物-蛋白相互作用。 单击“CPI预测”功能卡片,进入配置页面。 配置靶点文件。 支持3种输入方式,分别是输入氨基酸序列、选择文件、输入PDB ID 输入FASTA格式氨基酸序列,输入框最多支持
查询用户设置 功能介绍 查询用户设置 URI GET /v1/{project_id}/users/{user_id}/settings 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1
分子搜索 可自定义数据库,以用户输入的参考化合物结构为起点,可以按照相似度或者骨架从小分子数据库中搜索到相似结构和排序,可实现百亿级小分子的秒级搜索。 单击“分子搜索”功能卡片,进入分子搜索页面。 在配置页面,进行分子搜索配置,包括输入小分子、选择搜索算法、选择输出个数。 图1 分子搜索页面
None 医学文本标注 医疗智能体 EIHealth 使用ModelArts进行数据管理和标注 07:08 医学文本管理和标注 医疗智能体 EIHealth 使用ModelArts进行团队标注 05:44 医学文本团队标注 药物虚拟筛选 医疗智能体 EIHealth 药物虚拟筛选
projects_per_user 否 Integer 用户可创建项目数配额 最小值:0 最大值:20 缺省值:2 响应参数 无 请求示例 更新用户设置,设置开启资源配额限制,设置作业配额为10,作业超时时长为1天,CPU的核数配额为50,内存的配额为128GB,用户可创建的项目数为2 https://eihealth
email String 用户邮箱,需符合邮箱格式 phone String 用户手机号,纯数字,长度小于等于32位。必须与国家码同时存在。 areacode String 国家码。中国大陆为“0086” is_domain_owner Boolean 是否domain用户 create_time
在聚类结果页面,可以查看每个聚类的分子数量等信息。 单击某个聚类的操作列的“查看详情”,即可进入聚类详情页面,聚类详情页支持以卡片、列表以及3D的形式查看。默认展示卡片页面,用户可自行进行切换。 每个结果页面只用进行一次聚类分析操作。 聚类结果是存成文件,如果文件被删或者获取不到的话会有警告, 聚类结果不存在。此时可以单击“重新聚类分析”。
修改用户基本信息 功能介绍 修改用户基本信息(邮箱,手机) URI PUT /v1/{project_id}/users/{user_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1
上传配体:配体仅支持SDF、MOL2、PDB格式文件,且只支持3D结构。 选择参考配体:当前自由能微扰支持自动规划路径,选择参考配体后系统自动计算,用户也可自主添加或删除配体对。 图1 上传文件 引用外部桶时,需要确保所引用的数据不超过45层级的目录。 单击“下一步”,选择配体对。 页面显
国家码,当且仅当重置手机号时传入空串。中国大陆为“0086” 最小长度:0 最大长度:10 email 否 String 用户邮箱,需符合邮箱格式 最小长度:0 最大长度:128 响应参数 无 请求示例 修改子用户信息,修改子用户密码为example,电话为12345678910,邮箱为example@huawei
合成路径规划 合成路径规划基于盘古药物分子大模型,根据给定的目标分子,可以设计出完整且合理的合成路径。 单击“合成路径规划”功能卡片,进入配置页面。 在配置页面,可以在左侧绘制分子,也可以通过上传分子文件方式上传分子或者在白框内输入小分子SMILES表达式。 上传分子文件:支持S
新用户重置密码 功能介绍 新用户重置密码 URI PUT /v1/{project_id}/users/{user_id}/init-password 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。
ADMIN OPERATOR 响应参数 状态码: 200 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 用户id 请求示例 更新用户角色,更新用户角色为ADMIN https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{p
of IamUserDto objects 用户列表 count Integer 总数 表4 IamUserDto 参数 参数类型 描述 id String IAM用户id name String IAM用户名 请求示例 查询iam用户列表 https://eihealth.cn-north-4
配额说明 为防止资源滥用,平台限定了各服务资源的配额,对用户的资源数量和容量做了限制。 如果当前资源配额限制无法满足使用需要,您可以申请扩大配额。 EIHealth平台应用的基础设施如下: 统一身份认证(IAM) 容器镜像服务(SWR) 对象存储服务(OBS) 关于如何查看配额,如何申请扩大配额,请参见“《用户指南》
参数类型 描述 count Integer 用户数 users Array of GetUserRsp objects 用户信息列表 表4 GetUserRsp 参数 参数类型 描述 id String 用户id name String 用户名,长度4~31之间,首位不能为数字,特殊
MOL 3D Viewer Mol 3D Viewer工具支持查看蛋白质和小分子的3D结构。单击“功能模块 > 通用工具 > MOL 3D Viewer”,进入MOL 3D Viewer页面即可操作。 主要功能包括: 本地分子结构的3D可视化,支持多种显示样式,支持本地文件拖拽进画布区域进行渲染。