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Nextflow接口 Nextflow引擎生命周期管理 Nextflow作业管理 Nextflow任务管理 Nextflow流程管理 父主题： API（医疗智能体平台）
单击界面右侧“订阅”图标，订阅该流程。 订阅的流程将显示在“项目管理 > 工具”页面的流程列表中。 步骤2：上传待分析数据 您在使用RNA-Seq流程前，请先上传待分析的数据，上传数据方法请参见数据管理。 步骤3：创建分析作业 单击项目名称，进入“项目管理”页面，并选择“工具”页签。 在“RNA-Seq
资产市场 资产管理 资产收藏管理 供应商管理 父主题： API（医疗智能体平台）
NGS”流程。 单击界面右侧“订阅”图标，订阅该流程。 订阅的流程将显示在“项目管理 > 工具”页面的流程列表中。 步骤2：上传待分析数据 您在使用NGS流程前，请先上传待分析的数据，上传数据方法请参见数据管理。数据要求是成对的双端测序样本，即您需要上传两个样本数据文件，例如：xxx.R1
omeagent_examples"), os.path.expanduser(f"~/work/{project_name}/genomeagent_examples"), dirs_exist_ok=True) os.chdir(os.path.expanduser(f"~/
Nextflow 简介 安装/卸载Nextflow 新建流程 管理流程 新建作业 管理作业 约束限制 作业执行失败排查思路 父主题： 用户指南（基因平台）
单击界面右侧“订阅”图标，订阅该流程。 订阅的流程将显示在“项目管理 > 工具”页面的流程列表中。 步骤2：上传待分析数据 您在使用Docking Summary流程前，请先上传待分析的数据，上传数据方法请参见数据管理。 步骤3：创建分析作业 单击项目名称，进入“项目管理”页面，并选择“工具”页签。 单击Docking
OBS存储费用。 用户可将归档数据恢复到项目桶，恢复到项目桶后，平台不会进行删除（恢复到项目桶中的数据会正常收取标准存储的费用）。 在归档管理页面，可以在“归档天数”列查看已归档天数（从归档复制完成时间开始算）。若用户早于90天删除归档数据，将收取费用，收取的费用=对应存储类别存
的单个文件。 使用命令行工具上传 命令行工具（eihealth-toolkit）配套EIHealth平台，提供数据、应用、流程和作业资源的管理和使用，支持上传最大为48.8TB的单个文件。 父主题： Notebook
数据上传方法请参见“数据”页面上传。 使用命令行工具上传 命令行工具（eihealth-toolkit）配套EIHealth平台，提供数据、应用、流程和作业资源的管理和使用，支持上传最大为48.8TB的单个文件。 数据上传方法请参见命令行工具概述。 对于非挂载目录以外的目录下的文件，重启Notebook
zip，大小不能超过10M。zip包文件个数规格为1024个，单个文件解压后限制，不超过10M。 如果上传的流程中包含镜像，单击镜像管理跳转至本项目的镜像管理列表，进行镜像上传，具体可参考导入或上传镜像。 图1 添加流程文件 添加完成后，单击“下一步”，配置流程参数。 添加参数方式支持
您可以根据实际情况进行变更。 续费 购买的资源到期后，您可以进行续费以延长有效期，也可以在购买时勾选到期自动续费。续费相关操作，请参见续费管理。 到期与欠费 如果购买资源到期或者账号欠费，会根据“客户等级”和“订购方式”定义不同的保留期时长，保留期内您将不能进行资源访问，保留期内
上传受体：受体仅支持PDB格式的文件。 上传配体：配体仅支持SDF、MOL2、PDB格式文件，且只支持3D结构。 选择参考配体：当前自由能微扰支持自动规划路径，选择参考配体后系统自动计算，用户也可自主添加或删除配体对。 图1 上传文件 引用外部桶时，需要确保所引用的数据不超过45层级的目录。 单击“下一步”，选择配体对。
准备工作 购买服务 购买存储套餐包 购买系统资源 获取认证信息 父主题： 用户指南（基因平台）
使用Unix管道技术连接比对和排序步骤，以缩短bwa和samtools的存放、读取、删除中间文件的时间。 流程针对GATK4中的限速步骤，进行了系统的优化加速。流程从contig-file中提取contig，根据contig下发对应的任务，并依据不同任务，指定并行下发的任务数，以降低流程整体的运行时间。
作业运行后，页面将跳转至“项目管理 > 作业”页面。您可以在该页面，查看作业的执行状态。单击作业名称即可进入作业详情页，查看运行进展和执行结果。 图2 作业详情 单击“概述”列按钮，在展开的信息栏中查看作业的输入&输出、节点参数、应用，单击输入输出参数的路径，即可跳转至数据管理页面，查看相应数
最大长度：64 profile 否 String 系统镜像名 枚举值： PY3 响应参数 状态码： 201 表8 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String notebook ID 请求示例 创建notebook，使用系统默认镜像，需要cpu资源1C，内存资源5G。 https://eihealth
析和验证，提高分析的效率和分析质量。也可以通过聚类找出一些关键的骨架，来进行下游分析或者优化等。 在输出结果页面左上角单击“聚类分析”后，系统开始进行分析，同时显示“聚类分析中”。 图5 聚类分析 待聚类分析完成后，单击“查看聚类结果”。进入聚类结果页。 图6 查看聚类结果 在聚
表4 NotebookToolDto 参数 参数类型 描述 display_name String 显示名称 profile String 系统镜像名 枚举值： PY3 请求示例 获取notebook工作环境 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud
notebook镜像，支持PY3或者指定项目中镜像（格式为SourceProjectName/ImageName:TagName）。 若选择PY3，则代表使用系统镜像创建notebook；若选择SourceProjectName/ImageName:TagName，则代表使用自定义镜像创建notebook。
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