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bbimber/discvrseq:release-1.17 制作bwa-mem镜像 在本地搭建Docker环境。 要求安装的容器引擎版本必须为1.11.2及以上。 下载bwa和samtools软件。 wget http://downloads.sourceforge.net/p
大分子支持PDB编号自动下载。 相互作用的可视化。 支持分子的编辑、标注。 测量、测量距离、角度、二角面等。 结构叠合，将不同结构叠合在一起，用于比较结构差异。 输出指定蛋白口袋的位置及大小，用于分子对接。 导出不同分辨率的图片文件。 播放与制作分子动力学轨迹动画。 父主题： 通用工具
health-toolkit。数据上传可参考上传数据。。 数据上传成功后可以在数据详情页面查询，创建Nextflow流程时可以通过设置参数指定对应数据。 镜像上传可参考上传镜像。镜像上传成功后可以在镜像详情页面查询，复制其镜像地址填入Nextflow脚本中的container字段即可。
本地的应用模板路径。获取应用模板方法请参见应用配置文件说明。 --description -d 否 应用的详细描述信息。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。
单击“下一步”，添加流程文件。 单击“流程文件”后面的“添加”，添加流程文件。 如果流程文件上传的是zip包，则可以选择添加“主文件”。主文件必须为.nf，为压缩文件夹中的文件完整路径。例如：main.nf。若不填写，默认为main.nf。 支持上传的文件格式为nf、 zip，大小不
本地的流程模板路径。获取流程模板方法请参见流程配置文件说明。 --description -d 否 流程的详细描述信息。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。
不填时默认为当前项目。 image-name 无 是 镜像名称。 tag-name 无 是 镜像tag名称。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 health docker pull demo-project/demo-image:v1
--description -d 否 归档描述。 --delete -l 否 是否删除已归档数据（默认false）。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 --storage-type -s 否 归档的存储类型，支持STANDARD和COLD。 命令示例
是 源项目名称。 --rename -r 否 重命名导入模板名称，不填时与源模板名称保持一致。 --current-project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。
引用数据时目的存放路径为本项目的根目录，故无需指定destdir。 --md5s -m 否 网络下载链接对应的md5列表，值用; 分隔，和网络数据链接一一对应。值用于下载完后对文件进行md5校验。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例
destination_workflow_version 是 String 目标流程版本。取值范围：长度[1,24]，以小写字母或数字或大写字母开头，允许出现中划线，必须以小写字母或数字或大写字母结尾。 最小长度：1 最大长度：24 响应参数 状态码： 200 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id
[flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 无 否 不选此参数时，列出当前所在项目的所有作业信息。 指定job-id时，列出具体作业的信息。可以同时指定多个job-id。 不带--detail参数，以yaml格式展示作业基本信息。 带--detail参数，以json格式展示作业基本信息。
version 无 否 源流程版本。 --rename -r 否 重命名目标流程名称，不填时与源流程名称保持一致。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。
镜像描述。当描述中带有空格时，需要添加引号来获取完整的描述信息。 --chip -c 否 镜像芯片类型，只支持ARM或者X86。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 Linux ./health docker update lmx-project-01/demo-image
镜像类型，可选APP、NOTEBOOK或OTHER，不填写默认为OTHER。 --chip -c 否 芯片类型，只支持X86和ARM。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 Windows health docker push demo-image:v1.0 -d
smiles_list 是 Array of strings 分子SMILES表达式列表 threshold 否 Float 打分阈值，分值必须大于该阈值才会返回 num_results 否 Integer 期望最大返回条目数（排序后取Top） custom_props 否 Array
数据文件：输入数据库文件，仅支持CSV格式，文件不大于1G，数据条数支持最多5,000,000条，超过5,000,000条将进行截取。文件必须有两列是“SMILES”、“NAME”，不区分大小写。文件不允许有中文，数据库小分子会自动去重。 数据文件列名：选择数据库列名，仅解析前1
job-id-file 无 否 要导出的id列表的文件位置。 文件内容格式：{"ids":"id1;id2;id3"}。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。
destination_workflow_version 是 String 目标流程版本 取值范围[1,24]，以小写字母或数字或大写字母开头，允许出现中划线，必须以小写字母或数字或大写字母结尾。 最小长度：1 最大长度：24 响应参数 状态码： 200 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id
version 无 否 源应用版本。 --rename -r 否 重命名目标应用名称，不填时与源应用名称保持一致。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。
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