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查看,添加此参数可以只显示想要查看数据的列名,多个列名用分号隔开(;),只有在--data参数使用时才生效。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。
平台的镜像管理,实现高效的调用,极大方便了软件的安装和运行。 Docker镜像是一个模板,是容器应用打包的标准格式,在部署容器化应用时可以指定镜像。例如一个Docker镜像可以包含一个完整的Ubuntu操作系统环境,里面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。 步骤1:新建fastqc镜像
sudo apt-get update RUN sudo apt-get install -y openbabel Dockerfile中不可以指定CMD以及ENTRYPOINT,否则会覆盖基础镜像启动脚本,引起异常。 按键盘Esc键,并执行:wq保存退出Dockerfile。 执行docker
receptor-pdb-to-pdbqt 将pdb文件转换为pdbqt文件。 qvina-w 执行分子对接操作(此处为blind docking,无需指定结合位点)。 docking-summary 汇总分子对接结果。 使用Docking Summary的详细步骤如下所示: 步骤1:订阅流程
骨架跃迁:会替换您所去掉的关键骨架,生成新颖的小分子。 片段生长:选择保留部分片段后,会在您删除的方向进行补充,生成新颖的小分子。 从头生成:通过指定的口袋从头生成小分子。 选定设计方式后,上传靶点结构,并配置其他参数。 图1 查看配置页面 靶点结构:选择靶点结构文件,仅支持PDB格式。
Array of Interaction objects 相互作用力列表。 数组长度:1 - 8 exclusive Boolean 是否排除指定的约束作用力。 operator String 多个作用力之间的逻辑关系。 枚举值: or and 表14 Interaction 参数 参数类型
Array of Interaction objects 相互作用力列表。 数组长度:1 - 8 exclusive 是 Boolean 是否排除指定的约束作用力。 operator 否 String 多个作用力之间的逻辑关系。 枚举值: or and 表13 Interaction 参数
Array of Interaction objects 相互作用力列表。 数组长度:1 - 8 exclusive 是 Boolean 是否排除指定的约束作用力。 operator 否 String 多个作用力之间的逻辑关系。 枚举值: or and 表13 Interaction 参数
Array of Interaction objects 相互作用力列表。 数组长度:1 - 8 exclusive Boolean 是否排除指定的约束作用力。 operator String 多个作用力之间的逻辑关系。 枚举值: or and 表14 Interaction 参数 参数类型
400 eihealth.01020036 data event for tracker must have WRITE. 追踪器记录事件必须包含写事件日志。 400 eihealth.01020037 The path is invalid. 请确认路径是否有效。 400 eihealth
计算资源标签管理 标签管理:可通过设置系统内置标签“copy-in”,使作业在该计算节点上运行。用户也可以自定义标签,创建应用时,通过设置标签指定应用运行在具有相同标签的计算节点上,实现运行作业按标签进行调度。 调度设置:设置为“不可调度”后,作业将无法运行到此计算节点。 图4 标签管理