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EIHealth平台 - 医疗智能体 EIHealth
EIHealth平台 应用场景 基本概念
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notebook命令 - 医疗智能体 EIHealth
notebook命令 创建notebook 获取notebook信息 删除notebook 编辑notebook 启动notebook 停止notebook
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分子生成(MG) - 医疗智能体 EIHealth
分子生成(MG) 新建分子生成任务接口 查询分子生成任务 父主题: API(AI辅助药物设计)
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自定义属性任务(MCP) - 医疗智能体 EIHealth
自定义属性任务(MCP) 新建自定义属性任务接口 查询自定义属性任务 父主题: API(AI辅助药物设计)
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运行作业 - 医疗智能体 EIHealth
运行作业 方式1:使用预置的NGS流程 方式2:使用预置应用搭建NGS流程 方式3:自定义镜像运行FastQC流程
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运行大规模虚拟药筛任务 - 医疗智能体 EIHealth
运行大规模虚拟药筛任务 药物数据输入格式说明 订阅Docking Summary流程 新建研究 查看药筛结果 查看药筛作业和结果下载
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镜像 - 医疗智能体 EIHealth
镜像 如何搭建Docker环境? 如何将生物信息学软件封装为镜像并上传?
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计费 - 医疗智能体 EIHealth
计费 平台计费方式 保留期与欠费 话单延迟导致欠费 不同类型的归档,费用分别是多少?
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创建虚拟药物筛选任务 - 医疗智能体 EIHealth
创建药物虚拟筛选任务 虚拟药物筛选可以使用资产市场中预置的“Docking Summary”流程对小分子化合物配体和蛋白受体进行对接。 使用步骤如下所示。 登录医疗智能体平台,在“资产市场”中订阅“Docking Summary”流程至所需的项目中。 进入“专题”页签,单击“新建研究”。 图1 新建研究
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NGS流程简介 - 医疗智能体 EIHealth
过质控、比对、变异检测等步骤,最终输出包含样本SNP、INDEL的VCF文件。 该案例介绍NGS的搭建步骤,涵盖镜像、应用、流程制作方法。用户也可以使用“资产市场”提供的已经搭建好的“Variant Calling Based On NGS”流程。该案例比“资产市场”流程多出VCF文件进行质控步骤。
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添加数据 - 医疗智能体 EIHealth
S类型数据。 使用URL导入数据 使用URL方式将公网http/https/ftp链接的数据或者OBS中的数据导入。 单击数据中心右上角“URL导入”。 单击“添加URL”,填写URL地址。 选择需要导入数据的文件夹。 单击“确定”,导入数据。 图5 使用URL导入 父主题: 数据管理
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数据库(可选) - 医疗智能体 EIHealth
数据库(可选) 数据库对应的是“项目管理>数据库”功能,可按使用需要购买。 图1 购买数据库 父主题: 购买计算资源(主账号操作)
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什么是医疗智能体 - 医疗智能体 EIHealth
究工作。 成熟的权限管理体系,保障数据安全的同时,确保团队高效协作。 医疗智能体面向的用户 从行业方向上,医疗智能体主要面对以下行业的从业者: 药物研发公司 平台以AI技术为核心的药物研发功能,通过内置的AI模型,加速药物研发过程。 科研单位 平台以流程管理及Notebook为核
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受体口袋检测 - 医疗智能体 EIHealth
用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000
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创建分子或分子复合物批量下载任务 - 医疗智能体 EIHealth
是否必选 参数类型 描述 job_id 是 String 作业ID。 最小长度:1 最大长度:128 job_result_url 是 String 作业结果文件url。 最小长度:1 最大长度:2000 mode 是 String 下载类型:MOL(小分子)、COMPLEX(复合物)。
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文件下载 - 医疗智能体 EIHealth
描述 type 否 String 下载类型(仅支持PRIVATE|PUBLIC) 枚举值: PRIVATE PUBLIC EXTRANET url 否 String 资源地址(支持https、obs地址) 最小长度:1 最大长度:2000 range_start 否 Long 指定下载对象的开始位置
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创建分子对接作业 - 医疗智能体 EIHealth
用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000
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创建靶点口袋发现作业 - 医疗智能体 EIHealth
用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000
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计算配体间的3D结构差异 - 医疗智能体 EIHealth
用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000
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获取notebook信息 - 医疗智能体 EIHealth
notebook-id 无 否 notebook id,不填写时表示获取notebook列表,填写时表示获取notebook详情。 --url -u 否 获取打开notebook的地址。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以W