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128 表10 AppInfoDto 参数 参数类型 描述 app_id String 应用id app_name String 应用名称 app_version String 应用版本 app_src_project_name String 应用来源项目名称 app_labels
用户注册华为云时的账号,账号对其所拥有的资源及云服务具有完全的访问权限,可以重置用户密码、分配用户权限等。由于账号是付费主体,为了确保账号安全,建议您不要直接使用账号进行日常管理工作,而是创建用户并使用创建的用户进行日常管理工作。 用户 由账号在IAM中创建的用户,是云服务的使用人员,具有身份凭证(密码和访问密钥)。
平台节点最大规格 app_infos Array of AppFilterDto objects 筛选后的app集合 job_info JobFilterDto object 筛选后的job 表4 AppFilterDto 参数 参数类型 描述 app_id String 应用id app_name
com/clilist-eihealth/eihealth_31_0026.html # 【必须】 # 'app_id': 'ga-app::v1.0', 与APP参数中的'name': 'ga-app'和'version': 'v1.0'相匹配,默认相匹配,无需改动 # 【可选】
EIHealth中的分析流程包含分析过程中所需应用的执行信息和数据的输入、输出等参数定义。分析流程至少由一个应用组成,在多个应用构成的流程中,一个应用的输出作为另一个应用的输入,流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流。 在EIHealth平台,创建流程通过拖拽应用的方式完成。在命令行工具中
th平台新建应用过程一致。模板修改好后,再使用命令行工具上传模板,创建应用。 修改模板时,需填写镜像地址,获取方法请参见获取镜像地址。镜像制作和上传方法请参见镜像管理和创建FastQC应用样例。 # 详情说明可参考API文档中应用管理-创建应用 app: name: 'demo-app'
创建应用 登录医疗智能体平台,进入项目并选择“工具 > 应用”页签,单击“新建应用”。 图1 新建应用 依据“应用参数说明表”依次创建搭建NGS流程所需的应用。 图2 填充应用内容 对于测序得到的大量数据,如果需要批量执行NGS分析,可以选取以下任意一种方式进行批量执行: 方式一
表8 CustomPropsModelMetric 参数 参数类型 描述 name String 评估指标的名称 最小长度:1 最大长度:32 value Float 评估指标的评估结果 请求示例 查询一个自定义属性 GET https://{endpoint}/v1/{proj
获取靶点蛋白的3D结构,对超过8500个已上市、进入临床的小分子药物进行了约18万种药物-靶点配对情况的计算评估,让研究人员可以同时从21个蛋白的角度,综合、无偏地评估药物效果,从而为后续的药物机制研究、临床试验提供线索。 本案例介绍如何使用EIhealth平台虚拟药物筛选功能
用户管理介绍 EIHealth平台支持两种类型的用户管理,可以帮助您安全地控制平台的访问和使用权限。 表1 用户管理类型 类型 说明 系统级别用户管理 系统级的角色配置,可创建平台的子用户,并为其分配权限。 项目级别用户管理 资源级的角色配置,以项目为粒度对数据、分析作业、开发环
获取Nextflow作业详情 删除Nextflow作业 重试Nextflow作业 获取Nextflow作业日志 停止Nextflow作业 获取Nextflow作业报告 父主题: Nextflow接口
Array of AppFilterDto objects 筛选后的app集合 job_info JobFilterDto object 筛选后的job 表9 AppFilterDto 参数 参数类型 描述 app_id String 应用id app_name String 应用名称 app_version
最小长度:1 最大长度:32 app_id 是 String 应用id,取值范围[1,135],正则先不能有中文,两种格式。特殊id,采用{app_name}::{app_version}::{src_project_name}格式,用于手动创建场景;其他场景,app_id为系统分配的唯一标识
最小长度:1 最大长度:32 app_id 是 String 应用id,取值范围[1,135],正则先不能有中文,两种格式。特殊id,采用{app_name}::{app_version}::{src_project_name}格式,用于手动创建场景;其他场景,app_id为系统分配的唯一标识
流程说明 分析流程至少由一个应用组成,在多个应用构成的流程中,一个应用的输出作为另一个应用的输入,流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流。 EIHealth中的流程由应用搭建形成,应用包含了数据的输入、输出等参数定义。 应用呈现的信息在创建应用过程中定义,包含参数名称、数据类型、描述、默认值等。
区间上限,仅回归型存在。 表8 ModelMetric 参数 参数类型 描述 name String 评估指标的名称。 最小长度:1 最大长度:32 value Float 评估指标的评估结果。 请求示例 https://{endpoint}/v1/{project_id}/drug-models
values: - ${task-2-lk-app-0121.output1} output_dir: /sdsd - task_name: task-2-lk-app-0121 app_id: f165b7a6-5bc9-11eb-9fef-fa163ef9b34d
task_name: app1-1 # 子任务实际名称,取值范围[1,32],只能以大小写字母开头,由大小写字母、数字、中划线(-)、下划线(_)组成,以大小写字母或数字结尾。 app_id: 'demo-app::1.0.0::gwj-test-01'
cates连线关系 在流程设计器左侧应用列表中选择gatk-bqsr、gatk-applybqsr应用,并使用鼠标拖拽至画布中。 将gatk-markduplicates的输出参数markduped-bam与gatk-bqsr、gatk-applybqsr的输入参数markdup
"last_timestamp" : "2021-01-30T02:34:36Z", "message" : "创建k8s Job对象 app1-1-0-093a002fa000217 成功", "reason" : "创建成功##SuccessfulCreate",