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h-4)、华东-上海一(cn-east-3)。 --platform-id 是 平台ID,获取方法请参见步骤1:获取认证信息。 图1 命令示例 父主题: 配置命令行工具
对象和历史版本的对象。 --marker -M 否 列举桶内对象的起始位置,返回结果是按照字典序排序后该参数之后的所有对象,具体可参考列举示例。 --versionIdMarker -V 否 列举桶内多版本对象的起始位置,返回结果是对象名和版本号按照字典序排序后该参数之后的所有对象。
取值:logs、detail 。 logs:获取task日志。 detail:获取task详情,用于获取task列表。 --jobId -j 是 作业Id。 命令示例 获取task列表 health nextflow get task -j "7991e0b4-bffe-4166-ac2e-45a261592dcc"
--url -u 否 获取打开notebook的地址。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 获取notebook列表
获取的是流程列表。 --param-file -p 否 参数文件保存路径,以yaml格式保存。如果没指定,则不会显示和保存参数信息。 命令示例 health nextflow get workflow 550e8400-e29b-41d4-a716-446655440000 -p
回归型:预测一系列连续变量的模型,主要侧重定量描述。 二分型:预测二分类离散变量的模型,主要侧重定性分析。 模型数据 选择模型数据。可选择数据中心数据,或者示例数据。 仅支持CSV格式,数据条数支持100-50000条,文件不大于5MB。 组织共享 如果关闭,则该模型只能自己使用。 如果开启组织共
me,获取归档列表时生效。 --data-list -d 否 获取指定归档的全部数据清单,需要与archive-id一起使用才生效。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 查看归档列表
时间会加长。 图3 靶点设置 图4 Target1设置 图5 Target2设置 图6 靶点设置完成 通过“靶点设置”上传靶点,并且设置对接口袋。 此处靶点设置为可选参数,如果选择靶点设置,可以将对接活性作为一个约束条件进行分子优化。靶点1对应的约束条件是target1_bind
Docker build构建成Docker镜像。 快照方式制作镜像 如果后续镜像没有变化,可通过快照方式制作镜像。 快照方式制作镜像示例: 本示例中使用华为云弹性云服务器服务(ECS)创建一台云服务器,并使用快照方式制作bwa镜像。 购买弹性云服务器。 云服务器创建成功后,在云服
导入文件列表,多个文件用分号(;)分隔,导入数据到数据库时此参数必填。 --current-project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 引用单个数据库实例
4 ,它的校验文件下载链接则是health-windows-x86_64.zip.sha256。 安装eihealth-toolkit 本示例中以Windows系统为例,介绍安装命令行工具的方法。 获取Windows版本的命令行工具,得到health.exe文件,health文件
加参数--o。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 上传数据前需要使用switch命令进入待操作的项目。 列举路径中的文件夹对象时,需使用/xxx/格式,如示例中的/src/。 列
受体文件仅支持PDB格式,若文件中存在多个受体,默认只处理第一个。受体文件支持上传1个或者多个文件,最多支持输入20个受体文件,文件来源包含数据中心、PDB库、示例数据。 图1 上传受体文件 受体预处理参数配置。 去水:去掉受体蛋白里面的水分子。 去金属离子:去掉受体蛋白里面的金属离子。 去水、去金属
分隔,和网络数据链接一一对应。值用于下载完后对文件进行md5校验。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 从医疗项目中引用数据
选择文件:选择分子文件,最多支持100万个小分子,且分子文件大小不超过2GB。支持SDF、MOL2、PDB、SMI格式。文件来源包括数据中心和示例数据。 手动输入:输入小分子SMILES表达式。最多支持输入1000行,每行最多输入1024个字符,SMILES不支持输入空格或者中文。
查询提供时间以前的所有任务。例如,2006-01-02 15:04:05。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 获取作业列表
计算节点id。设置了--label后使用,获取某个计算资源节点下的标签列表。 --zone -z 否 可用区id。如:cn-north-7c。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 获取计算资源列表
结果清单文件夹的路径参考附加参数--o。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 列举路径中的文件夹对象时,需使用/xxx/格式,如示例中的/src/。 如果路径中带有特殊字符比如()
列名用分号隔开(;),只有在--data参数使用时才生效。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 获取数据库实例列表
选择文件:选择分子文件,最多支持100万个小分子,且分子文件大小不超过2GB。支持SDF、MOL2、PDB、SMI格式。文件来源包括数据中心和示例数据。 手动输入:输入小分子SMILES表达式。最多支持输入1000行,每行最多输入512个字符,SMILES不支持输入空格或者中文。 选