检测到您已登录华为云国际站账号,为了您更好的体验,建议您访问国际站服务网站 https://www.huaweicloud.com/intl/zh-cn
不再显示此消息
导入模板名称”中修改模板名称,单击“确定”。 图1 从其他项目导入模板 平台也提供了yaml格式的数据库模板,您可以在本地编辑完成后上传至平台进行使用,数据库模板支持yaml或yml格式,且文件大小不能超过10M。 导入方式选择“上传”,单击“下载示例文件”下载数据库模板示例,编辑后上传模板文件至平台,单击“确定”。
修改列名和对应的值,用反单引号引用列名和值,格式为`column-name1:value1`;`column-name2:value2`,更新或插入多个列值时使用分号。 说明: 对于极其特殊的值,例如:qqq'\"`22,qqq'\"`22,aa`;`aaa:4444`,因为与上述要求的格式冲突,暂时不支持操作。
[flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 job-id 不涉及 是 作业ID -- params -p 否 本地json/yaml格式参数文件路径 命令示例 health nextflow retry job f17a3542-3f7c-11eb-868a-fa163e3ddba1
如果流程文件上传的是zip包,则可以选择添加“主文件”。主文件必须为.nf,为压缩文件夹中的文件完整路径。例如:main.nf。若不填写,默认为main.nf。 支持上传的文件格式为nf、 zip,大小不能超过10M。zip包文件个数规格为1024个,单个文件解压后限制,不超过10M。 如果上传的流程中包含镜像,单击
类型”。 基本信息:包含作业名称、标签、描述。 输出路径:存放输出结果的路径,格式以/开头。例如项目中的output文件夹,输出路径可设置为/output。 不填写路径时,默认以“作业名-UUID”格式生成输出路径。 优先级:运行优先级,分为0~9级,优先级高的作业会被优先执行。默认值为0。
配模式后才会执行该匹配模式。 使用“time1-time2”,代表匹配的时间段,其中time1必须小于等于time2,格式为yyyyMMddHHmmss。时间格式支持自动补全,例如yyyyMMdd等价于yyyyMMdd000000,yyyyMM等价于yyyyMM01000000。
下载3D:如果分子设置了靶点,可以单击“下载3D”下载优化后的小分子或者复合物,如果分子未设置靶点,单击“下载3D”只能下载小分子。小分子下载支持SDF和PDB格式,复合物支持PDB格式。 每个分子卡片上会展示相应分子序号与对应的参数Score、Vina Score、Similarity(侧链修饰/骨架跃迁场景)、QED。
"分隔,如:"a,b"。 --main_file -m 否 流程主文件名,默认为:main.nf。 --params -p 否 本地json/yaml格式参数文件路径。 命令示例 health nextflow create workflow -n h2 -w "D:\testzip.zip"
流程标签列表,用","分割,如"a,b,c"。 --main_file -m 否 流程主文件名。 --params -p 否 本地json/yaml格式参数文件路径。 命令示例 health nextflow edit workflow 5b5cd09c-bc14-11ed-b7f6-fa163e504fdd
查看对象属性 查看对象属性。 命令格式 health stat <obj> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 obj 不涉及 是 查看的文件、文件夹对象。 注意: 如果为引用数据,必须要使用绝对路径(文件夹最后要加/)。未引用的数据不能查看。 --bf -b
<dest-dir> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 src-dir 无 是 源路径,支持四种格式,分别是医疗项目、外部桶、外部并行文件系统或者网络数据下载链接,对应格式分别为ProjectName:/path、OBS:BucketName:/path、OBSFS:ObsfsName:/path、下载url。
--add-command -a 否 作业额外执行的命令,如:--param1 hello。 --params -p 否 本地json/yaml格式参数文件路径。 --priority -o 否 作业优先级,支持输入的参数为0-9,默认值为0,0为最低优先级。 命令示例 health nextflow
project为源项目名称,可选。不指定srcproject时,默认为当前项目。 --sample -s 否 获取流程模板,模板为yaml格式。 --downloadPath -d 否 获取workflow详情时,将内容下载到的指定文件夹路径(文件夹需要存在)。 --project
输入参数对应的文件路径(本地路径),该参数与流程中的输入文件路径对应,通过修改input-file,修改输入数据。 选择时,input和input-file二选一。 格式为:{"task0": {"input-1": "datapath"}, "task1": {"inputs": "datapath"}}。
D:\local\test.txt /src/ --update -r 列举路径中的对象时,需使用/xxx/格式,如示例中的/src/。 列举本地路径中的文件夹对象时,需要使用“路径/文件名”或“路径\文件名”格式。请依据操作系统的路径规范使用,如示例中的D:\local。 如果路径中带有特殊字符比如
跳过的header行数。不指定参数值时默认为0。 --delimiter -e 否 常用的三种分隔符为(;,\t),也可以根据导入数据的文件格式设定其他分隔符。 --files -f 否 生成实例数据的文件列表,多个文件用分号(;)分隔。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。
--createStartTime -c 否 最小创建时间,格式:YYYY-MM-DD HH:MM:SS。例子:"2006-01-02 15:04:05"。此参数用于获取作业列表。 --createEndTime -e 否 最大创建时间,格式:YYYY-MM-DD HH:MM:SS。例子:"2006-01-02
数据库创建完成后,单击数据库名称进入数据库详情页,在页面左上角单击“新增行”按钮。 图3 新增行 在新增的数据行中,填写数据。 新增的行的数据请按照模板的格式填写。 填写完成后,单击“保存”。 父主题: 数据库管理
日志路径,不填写时默认为命令行工具当前路径下healthcli.log文件。 路径设置格式: Windows系统为“路径\文件名”。 Linux系统格式为“路径/文件名”。 --http-proxy -p 否 HTTP代理配置,格式为“http://username:password@your-proxy:your-port”。
模式表示的时间是UTC时间。 使用“time1-time2”,代表匹配的时间段,其中time1必须小于等于time2,格式为yyyyMMddHHmmss。时间格式支持自动补全,例如yyyyMMdd等价于yyyyMMdd000000,yyyyMM等价于yyyyMM01000000。