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镜像上传可参考上传镜像。镜像上传成功后可以在镜像详情页面查询,复制其镜像地址填入Nextflow脚本中的container字段即可。 process test { container 'swr.${regionID}.myhuaweicloud.com/eihealth/admet:2
用户指南(盘古辅助制药) 欢迎使用盘古辅助制药平台 关键概念 准备工作 配额管理 系统设置 项目管理 功能模块 AI模型 自定义数据库 数据管理 作业管理 收藏夹 相关参数
environment String task执行的环境变量值 module Array of strings 子任务运行环境列表 container String 容器名称 attempt Integer 执行次数 scratch String 临时工作目录 execution_time
最小长度:1 最大长度:32 数组长度:0 - 5 status_list 否 Array 作业运行状态列表, 支持WAITING|RUNNING|FINISHED|FAILED|CANCELLED。 数组长度:0 - 10 type_list 否 Array 作业类型列表, 支持DO
ject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 availability_zone_id 是 String 可用区 最小长度:1 最大长度:64 spec_code 是 String 规格编码 最小长度:1
Integer 扩容后多久再次判断缩容 delay_after_delete Integer 节点删除后多久再次判断缩容 delay_after_failure Integer 缩容失败后多久再次判断缩容 max_nodes_batch_deletion Integer 缩容并发数 check_interval
最大长度:32 areacode 否 String 国家码,当且仅当重置手机号时传入空串。中国大陆为“0086” 最小长度:0 最大长度:10 email 否 String 用户邮箱,需符合邮箱格式 最小长度:0 最大长度:128 ticket 否 String 预验证凭证 最小长度:0 最大长度:1024
Docker安装成功 步骤2:制作镜像 方法1:直接下载官方的FastQC镜像。 执行如下命令下载FastQC镜像。 docker pull biocontainers/fastqc:v0.11.5 方法2:通过Dockerfile制作FastQC镜像。 执行vi Dockerfile命令,进入Dockerfile文件中,编写文件。
Docker安装成功 步骤2:制作镜像 方法1:直接下载官方的FastQC镜像。 执行如下命令下载FastQC镜像。 docker pull biocontainers/fastqc:v0.11.5 方法2:通过Dockerfile制作FastQC镜像。 执行vi Dockerfile命令,进入Dockerfile文件中,编写文件。
最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 数据库名称,长度为5-32个字符,首位需以小写英文字母开头,仅可以使用小写字母、数字、下划线“_”和中划线“-”。 最小长度:5 最大长度:32 description 否 String 数据库描述。
200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 status String 任务状态:WAITING、RUNNING、FINISHED、CANCELLED、ABNORMAL、FAILED。 最小长度:1 最大长度:16 filename String 下载文件名。 最小长度:1
delay_after_delete 否 Integer 节点删除后多久再次判断缩容 最小值:1 最大值:10080 delay_after_failure 否 Integer 缩容失败后多久再次判断缩容 最小值:1 最大值:10080 max_nodes_batch_deletion
面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。 EIHealth平台使用容器镜像服务(Software Repository for Container,简称SWR)进行简单易用、安全可靠的镜像管理。单击项目名称,进入所选项目,在“镜像”页签中,以列表形式展示了项目中的镜像。您可查看
),默认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹.obsutil_output。 结果清单文件命名规则:rm_{succeed | failed}_report_时间_TaskId.txt。单个结果清单文件默认情况下最大为30MB且最大可保留的文件个数为1024,可在配置文件
GSeWOUkZxjKyVBXQ75IVLJmfMmY49ixkjTyJKGYgAQfcqdwaIeN3PsOc1t0lujvFQ9eOv1pjUrSjw7YlgYbe/v0tf1AigKungHmJT9Z6PE8plyCwHKr668I5wZ2kADVMj7lhoCFP1dZU
共租户提供通用云服务的Region;专属Region指只承载同一类业务或只面向特定租户提供业务服务的专用Region。 可用区(AZ,Availability Zone) 一个AZ是一个或多个物理数据中心的集合,有独立的风火水电,AZ内逻辑上再将计算、网络、存储等资源划分成多个集
参数类型 描述 count Integer 镜像版本总数 tags Array of GetTagDetailRsp objects 镜像版本详情列表 表4 GetTagDetailRsp 参数 参数类型 描述 tag String 镜像版本名称 size Long 镜像版本大小 create_time
String 状态 create_time String 创建时间 node_spec NodeSpecDto object 节点规格信息 availability_zone String 可用区 nodes Integer 节点数量 max_nodes Integer 扩容节点数上限
镜像下载命令 Read Quality 对测序得到的fastq数据进行质控。 fastp:0.20.1 docker pull biocontainers/fastp:v0.20.1_cv1 Mapping and Sort and index 将质控之后得到的Clean Reads比对到参考基因组上。
String 流程名称 tag String 子任务标识符 hash String 哈希值 status String 子任务状态 container String 容器名称 pod_name String pod名称 submit String 提交时间 complete String