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基于二代测序的基因组突变检测 NGS流程简介 配置命令行工具 上传数据 制作并上传镜像 创建应用 搭建NGS流程 执行分析作业 批量执行NGS分析
命令结构 health chattri [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --path -p 附加参数，可选。 修改权限的目录或文件绝对路径。 --delete-policy -d 附加参数，可选。 设置目录或文件是否允许删除。取值包括：allow、deny。 命令示例
在使用Nextflow时，作业运行失败的可能原因 由于Nextflow支持的特殊字符继承了Nextflow原有特性，因此请排查参数值，或者选择的数据名称，或者路径中带的特殊字符是否符合Nextflow原有特性。 建议启动并发作业数最多为8个。 父主题： Nextflow
添加分类标签 为了方便分类查看创建的应用和流程，您可以使用分类标签功能，筛选呈现带有相同标签的应用或流程。 在“工具”页面左侧，单击图标新建分类标签。 在添加分类标签弹窗中，输入“名称”，勾选需要呈现的标签名称。最多可以勾选5个标签。 图1 添加分类标签 勾选完成后单击“确定”。
项目信息。Linux系统下，需添加./指定当前路径。 使用数据、应用、流程、作业命令时，需先使用switch命令进入待操作的项目中。使用逻辑与EIHealth平台一致，进入项目，再对项目内的数据等内容进行操作。 命令行的参数缩写支持合并使用，例如，-r -s 可以写成-rs。 父主题：
--cpd -C 否 生成断点记录文件的文件夹，默认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹.obsutil_checkpoint。 每个分段移动任务会产生唯一对应的断点记录文件并保存至该文件夹的copy子文件夹下，分段任务执行成功后，对应的断点记录文件会被自动删除；分段任务执行失败或
命令不支持在引用的项目中创建子目录。 命令结构 health mkdir <name> 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 name 无 是 子目录的名称。 --e -P 否 指定终端节点。 --i -i 否 指定用户的AK。 --k -k 否 指定用户的SK。 --t -n
<archive-region> # 命令中的archive-region可替换为backup-region 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 archive-region 无 是 归档区域。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。
”进行导入。 图2 导入用户 导入的IAM子用户需要具有管理控制台访问方式。 导入用户时不能超出配额。如果超出配额，进行配额调整后，5分钟后生效。 以用户组的方式导入时，若超出配额的部分会导入失败。 以用户组的方式导入时，用户组里已经导入到平台的用户，不算统计个数。例如，用户组A里50个用户，10个已经导入平台，
否 指定用户的AK。 --k -k 否 指定用户的SK。 --t -n 否 指定用户的securitytoken。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 删除某个文件的分段任务 health
项目标签，多个标签使用分号(;)分隔。 --policy -p 否 设置项目级数据权限策略。 用数字0和1表示关闭和打开，以data-share、data-download、data-delete、data-encrypted的顺序排列，例如全部打开则为1111，全部关闭则为0000， 默认1110。
数据管理 数据归档 数据管理 数据作业管理 OBS桶管理 父主题： API（医疗智能体平台）
数据管理 数据管理简介 添加数据 数据管理常用操作 父主题： 用户指南（盘古辅助制药）
存储资源 存储资源的计费模式是按需或者购买套餐包的形式， 按需计费可根据数据量的大小收费，故不需要提前进行购买 套餐包需提前购买，当存储用量超过套餐包规格时，超出部分将自动按量按需计费 图1 存储资源 图2 存储套餐包 图3 购买存储套餐包 父主题： 购买计算资源（主账号操作）
Editor Mol Editor工具可以查看小分子的2D结构，以及编辑分子结构。 单击“功能模块 > 通用工具 > MOL Editor”，进入Mol Editor页面即可操作。可以通过单击右上角的“保存”，将编辑的分子结构保存在数据中心。 图1 保存分子结构 父主题： 通用工具
数据管理 数据管理简介 添加数据 发布数据 数据管理常用操作 归档数据 数据控制与数据审计 命令行工具概述 父主题： 用户指南（基因平台）
标准存储单AZ包适合数据分享、内容分享、热点对象应用场景。归档存储适合档案数据、医疗影像场景。详细可参考存储类别。 规格 套餐包支持的购买规格。 购买数量 购买套餐包的数量。取值范围：1-50。 购买时长 购买套餐包的时长。最短为一个月，最长为一年。 生效时间 选择购买套餐包后的生效时间。
资源监控数据获取 获取资源监控数据 批量获取资源统计数据 父主题： 系统管理
基础通用类软件镜像，如Tomcat、Mysql、Ngnix等。 获取创建Notebook的镜像 创建Notebook时，平台为您提供了系统镜像和自定义镜像。 系统镜像 工作环境选择PY3版本。 自定义镜像 创建Notebook时所需的自定义镜像，依赖于医疗智能体平台自研的基础镜像，您需要基于获取的基础镜像制作自定义镜像。
--description -d 否 作业的详细描述信息。 --input -i 否 输入参数名称，该参数与流程中的输入参数对应，通过修改--input，修改输入数据。 选择时，input和input-file二选一。 作业运行时，每个应用称之为一个task，应用可以设置多个输入参数，一个输入参数可以设置多个输入值。
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