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get-docker.sh 启动一个空白的基础容器，并进入容器。 例如，启动一个CentOS容器。 docker run -it centos 安装依赖包。 yum -y install https://dl.fedoraproject.org/pub/epel/epel-release-latest-8
--sample -s 否 获取流程模板，模板为yaml格式。 --downloadPath -d 否 获取workflow详情时，将内容下载到的指定文件夹路径（文件夹需要存在）。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 --label -l 否
FOLDER size Long 大小 缺省值：0 create_time String 创建时间 download_url String 下载链接 请求示例 查询审计日志详情 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{pr
单击“流程文件”后面的“添加”，添加流程文件。 如果流程文件上传的是zip包，则可以选择添加“主文件”。主文件必须为.nf，为压缩文件夹中的文件完整路径。例如：main.nf。若不填写，默认为main.nf。 支持上传的文件格式为nf、 zip，大小不能超过10M。zip包文件个数规格为1024个，单个文件解压后限制，不超过10M。
该参数用于获取任务实例事件列表。不带该参数，默认输出任务实例详情（默认json格式）。 --file-path -p 否 获取任务实例详情时，设置任务实例详情下载路径。 --yaml -y 否 获取任务实例详情时，以yaml格式输出任务实例详情（默认json格式）。 --project 无 否 指定
Crr/endpointCrr，目标桶对应的配置信息为配置文件中的：ak/sk/token/endpoint。 开启该模式后，会占用上传和下载的双向带宽。 --fr -R 否 同步上传文件时生成结果清单文件。同步上传文件时该参数可选。 --arcDir -g 否 同步上传文件成功
安装容器引擎。 启动一个空白的基础容器，并进入容器。 例如，启动一个CentOS容器。 docker run -it centos 安装依赖包。 yum -y install https://dl.fedoraproject.org/pub/epel/epel-release-latest-8
提交成功后，可以在“作业中心”查看执行结果。 图1 设置靶点口袋发现文件 查看靶点口袋发现结果。 单击作业名称，在输出结果页面，可以单击“查看轨迹”，下载运动轨迹。可以单击”下游分析”，将发现的口袋作为对接口袋进行分子对接。也可以在右边口袋列表中查看口袋信息。 单击口袋列表的，可以收藏靶点口
FOLDER size Long 大小 缺省值：0 create_time String 创建时间 download_url String 下载链接 请求示例 查询审计日志列表 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{pr
strings 流程标签 workflow_file String 流程的文件名 workflow_file_url String 流程的文件名下载地址 main_file String 主文件名 params_file String 用户上传时使用的参数文件名 params Array
timeline， report,，trace配置，医疗智能体（EIHealth）平台会默认开启并且指定相关路径，会覆盖用户侧配置，可以在作业详情页面查询和下载相关信息。相关信息可参考https://www.nextflow.io/docs/latest/tracing.html 对于pod配置，
JupyterLab”，然后选择“Terminal”，进入Terminal界面。 图5 Terminal 例如，您可以执行wget命令在公开数据集中下载基因组测序数据。 图6 执行命令 父主题： 开发环境（Notebook）
图4 引用的数据 引用OBS类型数据时，如果数据在OBS中的存储类型为“归档存储”，则将该数据引用过来后，该数据不能用于创建作业，并不可下载。 平台系统管理员在自己的所有者、管理员、操作者项目可以引用OBS类型数据。平台系统管理员在自己的所有者、管理员、操作者项目可以解除引用O
功能调用消耗：运行一次功能会消耗一次。 图2 设置靶点优化MD配置页面 查看靶点优化结果 单击作业名称，进入作业结果页面，拟时结果根据构象RMSD聚类。 单击“查看轨迹”，下载运动轨迹。 单击“下游分析”，将聚类之后的不同构象进行分子对接。 单击每一个Model的按钮，查看构象。 单击每个Model的按钮，可以收藏构象，收藏后可直接在收藏夹页查看。
switch project test命令进入到名为test的项目中。 将本地数据上传到test项目中的src文件夹中。 详细的数据操作命令，如下载、删除、拷贝、切换路径等请参见“命令行工具 > 数据管理命令”章节“命令行工具 > 数据管理命令”章节。 将本地D:\local\data\test
引用OBS类型数据时，如果数据在OBS中的存储类型为“归档存储”，则将该数据引用过来后，该数据不能用于创建分析作业、数据库导入数据，并不可下载、归档。 引用外部OBS桶的数据时，在页面左侧数据栏中，将显示出完整的外部桶目录结构，对于非引用路径的数据，不支持数据归档操作。例如，桶中
由于生物信息学软件，往往由于不同的操作系统（Windows、Linux、Mac等）原因，无法实现统一的运维管理。同时，这些软件具有不同的版本和软件包，安装、使用过程复杂。 将生物信息学软件封装成Docker镜像，可以使程序在不同的环境中运行，并通过EIHealth平台的镜像管理，实现高效的调用，极大方便了软件的安装和运行。
Crr/endpointCrr，目标桶对应的配置信息为配置文件中的：ak/sk/token/endpoint。 开启该模式后，会占用上传和下载的双向带宽。 --vlength -v 否 复制完成后，验证目标桶对象大小是否与源桶中对象的大小一致。 必须与--crr参数配合使用。 --vmd5
0:projectname。 --sample -s 否 获取应用模板，模板为yaml格式。 --downloadPath -d 否 获取应用详情时，将内容下载到的指定文件夹路径（文件夹需要存在）。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 --label -l 否
建和管理操作。您可以将生物信息学软件封装为应用，并将其编排调度，形成自定义分析流程。 准备工作 1. 购买服务 2. 获取认证信息 3. 下载命令行工具 4. 命令行工具初始化 用户管理 1. 创建子用户 2. 添加项目成员和权限 数据管理 数据管理常用操作 命令行工具概述 镜像、应用、流程、作业
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