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盘古辅助制药平台购买完成后，单击“进入平台”，在平台右上角单击用户名，选择“资源中心”。 您可以根据实际需求选择购买功能调用套餐包和存储套餐包。在后续使用过程中，也可根据使用情况随时购买资源。 资源中心 在“资源中心>功能调用”中可以查看功能调用套餐包的使用情况。 图1 功能调用套餐包 在“资源中心>存储资源”中可以查看存储使用量等信息。
-haplotypecaller、gatk-mergevcfs和discvrseq-variantqc应用构成。NGS流程执行步骤如表1所示。 表1 NGS执行步骤 步骤 描述 Read Quality 对测序得到的fastq数据进行质控。 Mapping and Sort and
Token的有效期为24小时，需要使用同一个Token鉴权时，可以缓存起来，避免频繁调用。 Token在计算机系统中代表令牌（临时）的意思，拥有Token就代表拥有某种权限。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限。
新建文件后，自动进入文件编写页面，您也可以单击文件名称进入。 图3 编写文件 表1 编写文件页面介绍 区域 区域名称 详细说明 1 文件名称 您可以在此区域填写自定义的文件名称，修改保存后，对应的File列表也将发生变化。 2 菜单栏 菜单栏中有File、Edit、View、Inse
用户已开启的自定义属性集合 表6 CpiResultItem 参数 参数类型 描述 smiles String 分子SMILES表达式 props Array of objects 分子ADMET属性值列表 score Number 分子与蛋白质的打分 表7 CustomProp 参数
单击界面右侧“订阅”图标，订阅该镜像。 订阅的镜像将显示在“项目管理 > 镜像”页面的镜像列表中。 步骤2：创建Notebook 在“项目管理 > 开发”页面，单击“创建Notebook”，参考表 参数说明填写信息。 表1 参数说明 参数名称 说明 名称 Notebook的名称。 描述 Notebook的简要描述。
器，并使用快照方式制作bwa镜像。 购买弹性云服务器。 云服务器创建成功后，在云服务器列表页，选中待登录的弹性云服务器。单击“远程登录”，输入ECS初始账号，登录ECS。 图1 云服务器列表 安装容器引擎。 启动一个空白的基础容器，并进入容器。 例如，启动一个CentOS容器。 docker
单击项目名称，并选择“数据”。 图1 数据管理 单击“新建文件夹”，创建文件夹。 文件夹名称命名规则： 支持创建单个文件夹和多层级的文件夹。 单个斜杠（/）表示分隔并创建多层级的文件夹。 单个文件夹名称不能包含以下字符： \ / : ; * ? < " > |。 文件夹的绝对路径总长度不能超过1023字符。
#子任务使用的IO加速类型，取值范围SFS、EVS。为空表示不使用加速。SFS表示使用io加速，EVS表示使用本地盘加速 - task_name: app1-2 inputs: - name: input-dir
不包含源对象的匹配模式，如：*.txt。 支持“*”匹配多个任意字符和“?”匹配单个任意字符，例如abc*.txt代表匹配以abc开头以.txt结尾的任意文件。 您可以使用“\*”代表匹配“*”字符本身，使用“\?”代表匹配“?”字符本身。如果待下载的对象名匹配该参数，则跳过该对象的复制。 建议使用引号传递
持选择12个列名保存到数据库。 组织共享： 如果关闭，则该数据库只能自己使用。 如果开启组织共享，则其他子用户也可以使用您的数据库进行分子搜索。 默认为关闭。 数据库列表展示数据库的名称、分子数量、创建时间、状态等信息。对于已创建的数据库，可以执行删除和追加数据操作。数据库状态介绍如下：
序、转录组测序表观遗传学等领域。 该流程以NGS得到的fastq作为输入，通过质控，比对等步骤，输出针对fastq的qc报告，输出STAR比对得到的bam文件。 RNA-Seq流程由fastqc、trimmomatic、star应用构成，各应用说明如表1所示。 表1 应用说明 应用名称
录组测序表观遗传学等领域。 该流程以NGS得到的fastq作为输入，通过质控，比对，得到比对后的bam文件，及对fastq和bam文件的质控报告。 NGS流程由fastp、bwa-mem、picard-insertsize、bamqc应用构成，各应用说明如表1所示。 表1 应用说明
将已经引用的数据解除引用关系。有以下两种方式，可以实现解除数据的引用。 单击“操作”列的“解除引用”，解除数据引用关系。 图4 解除引用 鼠标指向左侧数据列表，选择需要解除引用的数据。单击右侧图标，解除引用关系。 图5 解除引用 下载数据 下载数据操作会产生流量费用，计费方式为按需计费，计费详情请参考OBS数据下载费用。
-to-pdbqt、receptor-pdb-to-pdbqt、qvina-w、docking-summary应用构成，各应用说明如表1所示。 表1 应用说明 应用名称 说明 ligand-smiles-to-3dsdf 将配体的smiles结构式转换为sdf文件。 ligand-3dsdf-to-pdbqt
如果msm=1则代表上传的URL是一组文件/文件夹列表（以英文逗号分隔）。如果文件/文件夹名本身包含英文逗号，请不要使用msm=1的模式。 如果msm=2则代表上传的URL是一个包含文件/文件夹列表的文件。 多文件/文件夹上传时必选，如果没有设置--recursive参数，则列表中的文件夹不会被上传。
不包含源对象的匹配模式，如：*.txt。 支持“*”匹配多个任意字符和“?”匹配单个任意字符，例如abc*.txt代表匹配以abc开头以.txt结尾的任意文件。 您可以使用“\*”代表匹配“*”字符本身，使用“\?”代表匹配“?”字符本身。如果待复制的对象名匹配该参数，则跳过该对象的复制。 建议使用引号传递该匹配模式（
txt。批量移动时该参数可选。 支持“*”匹配多个任意字符和“?”匹配单个任意字符。例如，abc*.txt代表匹配以abc开头以.txt结尾的任意文件。 您可以使用“\*”代表匹配“*”字符本身，使用“\?”代表匹配“?”字符本身。如果待移动的对象名匹配该参数，则跳过该对象的移动。 建议使用引号传递
用OBS桶中数据用于本地盘加速，可能会导致作业运行失败。 图1 “OBS”标签代表数据引用来源为OBS桶 单击“确定”，保存作业信息。 配置输入和依赖数据 NGS流程中涉及的输入、输出和依赖数据如表1所示。配置数据前，请先参考上传数据，上传原始Fastq文件和依赖数据。 如果在创
不包含文件的匹配模式，如：*.txt。 支持“*”匹配多个任意字符和“?”匹配单个任意字符，例如abc*.txt代表匹配以abc开头以.txt结尾的任意文件。 您可以使用“\*”代表匹配“*”字符本身，使用“\?”代表匹配“?”字符本身。如果待上传的文件名匹配该参数，则跳过该文件的上传。 建议使用引号传递
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