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删除流程 功能描述 删除指定workflow。 命令结构 health nextflow delete workflow ID 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 不涉及 是 模板id 命令示例 health nextflow delete workflow 550
入门实践 表1 常用最佳实践 实践 描述 基于二代测序的基因组突变检测 本最佳实践提供了通过命令行工具上传数据、上传镜像后，在医疗智能体平台搭建NGS流程，执行分析作业及批量执行NGS分析。 新型冠状病毒（COVID-19）虚拟药物筛选 本最佳实践介绍如何使用EIhealth平台
export PATH=~/anaconda3/bin:$PATH source ~/.bashrc 测试安装。 conda -V 查看当前环境列表，并创建新环境参数。 conda env list conda create -n py37 python=3.7 输入“y”，按“Enter”继续。
创建应用 登录医疗智能体平台，进入项目并选择“工具 > 应用”页签，单击“新建应用”。 图1 新建应用 依据“应用参数说明表”依次创建搭建NGS流程所需的应用。 图2 填充应用内容 对于测序得到的大量数据，如果需要批量执行NGS分析，可以选取以下任意一种方式进行批量执行： 方式一
称一致，命令行工具才会执行删除动作。 命令结构 health delete project <project-name> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 project-name 无 否 项目名称，不填时默认为当前所在项目。 命令示例 本节以Windo
上传对象时，支持断点续传功能，本地因此可能会残留上传异常产生的文件，可以使用该命令对异常文件进行清理。 命令结构 health clear [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 upload -u 是 上传文件时，本地生成的断点目录。 命令示例 本节以Windows为例介绍e
notebook <notebook-id> [flags] 或者 health edit notebook <notebook-id> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 notebook-id 无 是 notebook id。 --description -d 是 描述。
删除计算资源节点 删除计算资源节点。 命令结构 health delete compute-resources <node id> 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 描述 node id 不涉及 是 计算节点id。 命令示例 删除计算节点 health delete compute-resources
docker images命令查看已有的镜像。 详细的命令介绍请参见“命令行工具 > 镜像管理命令”章节。 单击“镜像”，在镜像列表中查看已上传的镜像。 图1 镜像列表 【可选】单击“镜像类型”，对上传的镜像进行分类。 上传镜像时如果上传命令中未指定镜像类型，新上传的镜像默认显示为“OTH
fastqc命令进行搜索镜像。 若dockerhub上没有想要的镜像，可以利用基础的操作系统镜像进行构造，构造方式请参见用户指南。 选择和获取镜像。 搜索到的镜像列表中选择一个fastqc镜像进行pull，这里我们选择pegi3s/fastqc。 pull镜像。 若该镜像没有lastest版本则需进入dockerhub官网进行查询。
创建子目录 使用mkdir命令，在当前目录下创建子目录，此命令不支持在引用的项目中创建子目录。 命令结构 health mkdir <name> 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 name 无 是 子目录的名称。 --e -P 否 指定终端节点。 --i -i 否 指定用户的AK。
项目的所有者有权限执行该操作。 命令结构 health transfer project <project-name> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 project-name 无 否 项目名称，不填时默认为当前所在项目。 --user -u 是 转移用户名称。
使用该命令前，您需要先创建项目，再使用switch命令进入该项目。 命令结构 health switch project <project-name> 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 project-name 无 是 需要进入的项目名称，名称在创建项目时由用户填写。 命令示例 本节
购买计算资源 按需方式购买计算资源。 命令结构 health create compute-resources [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 描述 --code -s 是 计算节点规格。 --data-disk-spec-code -d 否 额外数据盘规格。
单击“镜像导入”。并选择镜像所在的项目、镜像和镜像版本。 图1 镜像导入 单击“确定”，完成镜像导入。 从其他项目导入的镜像，在镜像列表“源项目”列中，显示所属的项目。 客户端上传镜像 使用命令行工具eihealth-toolkit上传镜像，详细的上传过程请参见上传镜像到SW
项目的所有者和管理员有权限执行该操作。 命令结构 health delete member <member-name> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 member-name 无 是 用户名称。 --project -p 否 项目名称，不填时默认为当前所在项目。
命令结构 health restore archive <archive-id> [flags] # 命令中的archive可替换为backup 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --destdir -d 是 目标路径。 archive-id 无 是 归档id。 命令示例 本节
oolkit 下载命令行工具eihealth-toolkit 针对不同操作系统，eihealth-toolkit下载地址如下所示。 表1 下载列表 支持平台 下载地址 Windows 64位 health-windows-x86_64.zip、health-windows-x86_64
步骤2：获取命令行工具 下载命令行工具eihealth-toolkit 针对不同操作系统，eihealth-toolkit下载地址如下所示。 表1 下载列表 支持平台 下载地址 Windows 64位 health-windows-x86_64.zip、health-windows-x86_64
创建配体相似性图计算任务 查询配体相似性图计算任务 删除配体相似性图计算任务 根据center、size、padding参数生成可渲染的口袋文件内容 根据表面离散点坐标集生成可渲染的文件内容 将传入的蛋白和小分子拼接成复合物结构 单分子文件格式转换 创建分子或分子复合物批量下载任务 查询分子或分子复合物批量下载任务详情
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