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模板”页签创建数据库模板,模板中数据库表列的数目为固定,行数可按需设置,不同列之间,可通过列信息进行识别。列信息包含列名、描述、类型、允许为空、是否主键、是否可查询、是否唯一、提示和操作信息。单击添加列可新增一列,最多支持100列。单击操作列的图标可以删除列。 列名 列的名称不可以和PostgreSQL 11版本的关键字冲突。
数据库管理命令 创建数据库模板 获取数据库模板 删除数据库模板 导入数据库模板 创建数据库实例 获取数据库实例 删除数据库实例 引用数据库或者导入数据到指定数据库 修改数据库实例
录组测序表观遗传学等领域。 该流程以NGS得到的fastq作为输入,通过质控,比对,得到比对后的bam文件,及对fastq和bam文件的质控报告。 NGS流程由fastp、bwa-mem、picard-insertsize、bamqc应用构成,各应用说明如表1所示。 表1 应用说明
/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/templates/{template_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。
最小长度:0 最大长度:1024 columns 是 Array of DatabaseColumnDto objects 数据库列信息 数组长度:1 - 100 表4 DatabaseColumnDto 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 列名 最小长度:1 最大长度:55
新建研究 进入“专题”页面,单击“新建研究”。 图1 新建研究 参考表1,设置运行信息。 表1 参数说明 参数 说明 选择项目 选择创建好,并带有数据的项目。 研究名称 可自定义研究名称。 流程 选择资产市场中订阅的Docking Summary流程。 配体分子 选择上传的配体小分子文件。
图1 上传和下载文件 OBS存储类型的Notebook 在创建Notebook时,如果“存储配置”选择的是“OBS”。Notebook列表的所有文件读写操作是基于所选择的OBS路径下的内容操作,即Notebook中的数据和OBS中的数据是同步的。在OBS路径中创建文件夹、上传数
cm/s。 结果解释:大于-5.15 log cm/s代表具有较好的渗透性。 MDCK Permeability: MDCK细胞的表观渗透系数Papp用来估计药物进入人体的吸收效率。单位为cm/s。 结果解释:大于20 x 10-6cm/s代表具有较好的渗透性,2~20 x 10-6cm/s具有一般渗透性,小于2
数据库(可选) 数据库对应的是“项目管理>数据库”功能,可按使用需要购买。 图1 购买数据库 父主题: 购买计算资源(主账号操作)
数据库管理 数据库管理 模板管理 父主题: API(医疗智能体平台)
数据作业id,不填写时未获取数据作业列表,填写时为获取数据作业详情。 --name -n 否 数据作业名称,根据名称搜索作业,获取数据作业列表时生效。 --type -t 否 数据作业类型,根据类型搜索作业,获取数据作业列表时生效。支持获取以下类型数据: CLONE_DATA DELETE_DATA
ject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 表3 FormData参数 参数 是否必选 参数类型 描述 file 是 File 模板文件 响应参数 状态码: 201 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 模板id 请求示例
数据库资源管理 获取数据库资源规格列表 删除数据库资源 购买数据库资源 查询数据库资源 父主题: 系统管理
CSS常见问题 如果子用户看不到“CSS资源列表”,需要授权子用户CSS权限。 如果在创建和追加数据库的过程,显示资源不足,需要扩容CSS集群。 若CSS集群显示“不可绑定”。 检查购买的CSS资源状态是不是正常的。 检查购买的CSS资源是不是绑定了公网IP。 已绑定的集群修改了密码或者公网IP。
最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 source_project_id 是 String 源项目id 最小长度:1 最大长度:128 import_templates 是 Array of TemplateSrcReq objects 导入模板列表 数组长度:1
csv,修改描述为simple database。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/drug/drug-database/{database_id} { "description" : "simple database", "file" :
/v1/{project_id}/system/database-resources 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选
vcf文件生成数据库。创建的数据库需要保证数据文件与模板对应。创建数据库时,可以不选择导入的数据文件,建立空的数据库,后期可以新增数据行或者导入数据。如果使用自动作业的数据表创建数据库,在导入数据,需要参照数据库模板格式进行导入。 您可以导入本项目或使用其他项目中的数据生成数据库。 选择好文件后,通过设置数据的分
您可以根据以下不同场景将大文件上传或下载到Notebook中。 图1 上传和下载文件 OBS存储类型的Notebook Notebook列表中所有文件的读写操作是基于所选择的OBS路径下的内容操作,即Notebook中的数据和被挂载的OBS路径中的数据是同步的。在OBS路径中创建
编辑应用 您可以对已经创建的应用进行编辑,修改对应参数信息。 在应用列表页面,选择需要修改的应用,单击操作列“编辑”。 图1 编辑应用 在编辑应用页面,可以修改相关的参数。相关参数描述可参考新建应用。 如果更改了版本号,相当于新建一个应用。 父主题: 工具管理