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配置BMS集群互相免密登录 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上进行相关设置，并使其可以相互免密登录。 背景信息 $：表示在普通用户下，执行相关操作。 #：表示在管理员用户下，执行相关操作。 普通用户切换至管理员用户，请使用命令sudo su。 前提条件 已成功创建BMS，并绑定了弹性IP进行登录。
创建弹性云服务器 弹性云服务器C6h实例介绍 C6h实例为弹性云服务器下的一款裸金属产品，相比于普通的裸金属产品，C6h实例除了提供标准的以太网卡，还提供了一个支持RoCE协议的网卡，而RoCE协议相比于普通的以太协议最大的优势在于时延极低，特别适合HPC场景低时延业务。 购买弹性云服务器 登录管理控制台。
配置单个ECS免密登录 操作场景 该任务指导用户在单个弹性云服务器内执行相关配置，使其可以免密登录。 背景信息 $：表示在普通用户下，执行相关操作。 #：表示在管理员用户下，执行相关操作。 普通用户切换至管理员用户，请使用命令sudo su。 前提条件 已成功创建弹性云服务器，并绑定了弹性IP进行登录。
相互免密登录。仅支持在使用密钥登录弹性云服务器的情况下配置ECS集群互相免密登录。 背景信息 $：表示在普通用户下，执行相关操作。 #：表示在管理员用户下，执行相关操作。 普通用户切换至管理员用户，请使用命令sudo su。 前提条件 已成功创建ECS集群，并绑定了弹性IP进行登录。
bashrc 运行Platform MPI下的STAR-CCM+ 设置路径。 将/etc/ld.so.conf.d/ibm_mpi.conf中内容改为如下内容： /opt/Siemens/15.02.009-R8/STAR-CCM+15.02.009-R8/mpi/openmpi/4.0
企业分支、科研组织机构等跨全球地理位置进行及时协同工作，提高效率。 可以利用公有云的跨地域能力，共享计算资源，海量数据，并能实现云端大数据分析。 优化性能 性能比普通云服务器提高30%。 通过虚拟化优化（SR-IOV、PCI直通）等，各类测试报告显示：大规模云化HPC性能损耗不大。 HPC与云服务的关系
128.tgz # cd l_mpi_2018.0.128/ # ./install.sh 图1 Intel MPI安装成功 配置环境变量。 普通用户下，在“~/.bashrc”中添加如下语句： export PATH=$PATH:/opt/intel/impi/2018.0.128/bin64
128.tgz # cd l_mpi_2018.0.128/ # ./install.sh 图1 Intel MPI成功安装 配置环境变量。 普通用户下，在“~/.bashrc”中添加： export PATH=$PATH:/opt/intel/impi/2018.0.128/bin64
--with-mxm=/opt/hpcx-v2.2.0/mxm # make all install 图2 OpenMPI安装成功 配置MPI环境变量。 普通用户下，在“~/.bashrc”中添加如下环境变量： export PATH=$PATH:/opt/openmpi-310/bin export
CXXFLAGS=-fPIC FCFLAGS=-fPIC # make -j 128 && make install 图1 MPCHI成功安装 配置环境变量。 普通用户下，在“~/.bashrc”中添加： export PATH=/opt/mpich-332/bin: $PATH export LD_
/sys/class/infiniband/mlx5_0/ports/1/pkeys/* | grep -v 0000 图2 查询pkey值 普通用户下，在~/.bashrc中添加如下语句： export MPI_ROOT=/opt/ibm/platform_mpi export P
安装和使用Spectrum MPI 操作场景 本节指导用户在BMS集群上安装和使用Spectrum MPI应用（以版本10.01.01为例）。 对于集群中的每台BMS，都需要执行该操作。 背景信息 IBM Spectrum MPI v10.1版本当前支持的操作系统列表如下： IBM
--with-ucx=/opt/ucx160 # make -j 128 && make install 图2 OpenMPI安装成功 配置MPI环境变量。 普通用户下，在“~/.bashrc”中添加如下环境变量： export PATH=$PATH:/opt/openmpi-310/bin export
企业分支、科研组织机构等跨全球地理位置进行及时协同工作，提高效率。 可以利用公有云的跨地域能力，共享计算资源，海量数据，并能实现云端大数据分析。 优化性能 性能比普通云服务器大幅提升。 通过虚拟化优化（SR-IOV、PCI直通）等，各类测试报告显示：大规模云化HPC性能损耗不大。 约束与限制 MPI和通
/sys/class/infiniband/mlx5_0/ports/1/pkeys/* | grep -v 0000 图2 获取pkey 普通用户下，在~/.bashrc中添加： export MPI_ROOT=/opt/ibm/platform_mpi export PATH=$MPI_ROOT/bin:$PATH
修订记录 发布日期 修订记录 2022-08-10 第十次正式发布 新增基于STAR-CCM+部署HPC集群 2021-08-11 第九次正式发布。 新增 1.1-图解HPC解决方案 2019-02-15 第八次正式发布。 新增 配额调整 2018-09-30 第七次正式发布。 修改
HPC断点续算计算方案 操作场景 在HPC领域很多应用本身是支持断点续算功能的，例如LAMMPS， GROMACS。同时HPC常用的调度软件也对断点续算有集成支持，如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例，介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令，安装FFTW软件。
通讯录安装 Udapl安装和测试 Udapl安装 cd /root wget https://linux.mellanox.com/public/repo/mlnx_ofed/4.1-1.0.2.0/SRPMS/dapl-2.1.10mlnx-OFED.3.4.2.1.0.41102
HPC-S²与其他服务的关系 服务名称 HPC-S²与其他服务的关系 主要交互功能 弹性云服务器（ECS） 购买弹性云服务器创建HPC集群或使用已有弹性云服务器部署HPC集群。 自定义购买ECS 虚拟私有云（VPC） 同一个HPC场景的云服务器，都位于同一个VPC中，并且需要使用
社区OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行社区OpenMPI（以3.1.1版本为例）。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS，均已安装社区OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令，关闭BMS防火墙。
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