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自动作业结束时间 database_id String 自动作业依赖的数据库ID database_column String 自动作业状态更新列 database_column_type String 自动作业状态更新列的类型，不填默认为EXISTED clean_database_column
获取系统标签 使用get命令获取系统标签库列表。 命令结构 health get label [flags] 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 health get label #
实践 描述 基于二代测序的基因组突变检测 本最佳实践提供了通过命令行工具上传数据、上传镜像后，在医疗智能体平台搭建NGS流程，执行分析作业及批量执行NGS分析。 新型冠状病毒（COVID-19）虚拟药物筛选 本最佳实践介绍如何使用EIhealth平台虚拟药物筛选功能，通过获取示例数据，创建药物虚拟筛选任务并查看结果。
的默认运行命令为ls -l，则运行容器时默认启动命令为ls -l。 ENTRYPOINT [ "ls", "-l"]：指定容器启动时的程序及参数为ls -l。 docker run centos：当运行centos容器时，默认执行的命令是docker run centos ls -l。
留参数接口，给需要调用的自部署模型用 # 请注意：您调用的第三方大模型API服务，其数据传输及处理可能涉及第三方服务器。本应用及平台不对第三方服务的内容、准确性、完整性及安全性承担任何责任。 # 请勿在使用过程中输入敏感、个人隐私或机密信息。使用本服务即表示您同意
获取归档数据 使用get命令查看归档列表或者下载归档的全部数据清单。 命令结构 health get archive <archive-id> [flags] # 命令中的archive可替换为backup 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 archive-id 无 否
查询计算资源规格 关闭计算资源 重启计算资源 启动计算资源 修改计算资源调度信息 查询计算资源调度信息 查询bms计算资源显卡id列表 获取EVS配额及使用情况 父主题： 系统管理
镜像全生命周期管理的服务，提供简单易用、安全可靠的镜像管理功能，帮助您快速部署容器化服务。 医疗智能体使用SWR存储工具镜像，包括内置工具及自定义工具的存储。
应用前，请先制作并上传应用所需的镜像。搭建NGS流程所需的镜像和版本如表1所示。 表1 NGS流程镜像信息 NGS流程步骤 描述 依赖镜像及版本 镜像下载命令 Read Quality 对测序得到的fastq数据进行质控。 fastp:0.20.1 docker pull biocontainers/fastp:v0
ID，用逗号或换行方式隔开；不区分大小写；如果输入多聚体靶点，仅解析第一条链；每个靶点的氨基酸序列长度不超过2048。 图3 靶点配置输入PDB ID 在配置页面输入分子信息，及配置相关参数。 输入方式：支持绘制分子、选择文件、手动输入。 绘制分子：只能绘制一个分子，能够输入分子的SMILES。 选择文件：选择分子文
分子对接结果pdbqt文件所在的文件夹。 输出参数 dir-out directory 分子对接结果汇总信息（矩阵.xlsx、3D可视化文件.pdb、配体及受体结构图片.svg等）所在的文件夹。 参数填写无误后，单击界面上方“启动作业”，运行作业。 步骤4：查看执行结果 在“项目管理”页面选择“作业”页签，单击创建的Docking
当涉及多文件/文件夹时，如需确认失败任务的具体错误信息，可参考结果清单文件夹下的失败结果清单文件“rm_failed_report_时间_TaskId.txt”及日志路径下的日志文件。 --e -P 否 指定终端节点。 --i -i 否 指定用户的AK。 --k -k 否 指定用户的SK。 --t -n
获取数据归档列表 使用get命令获取数据归档列表。 命令结构 health get archive-config # 命令中的archive-config可替换为backup-config 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linu
方式1：使用预置的NGS流程 使用EIHealth平台预置的流程进行运行作业。 步骤1：订阅流程 进入资产市场订阅已有的流程，以二代基因测序数据的变异检测流程为例。 图1 订阅流程 可以在“工具 > 流程”列表可以看到刚刚订阅的流程。 图2 查看订阅的流程 步骤2：订阅数据 若您
存在一个创建好的项目。 单击项目名称后面，进入项目设置页。 选择“成员管理”，单击“添加成员”。 图1 添加成员 选择已添加至平台的成员名称及权限。 图2 选择成员 单击“确定”，将用户添加至项目中。 移除、修改项目成员 单击项目名称后面，进入项目设置页。 选择“成员管理”，在“权限”列重新设置项目成员角色。
行，其中Notebook启动用户为health-user，流程作业默认启动用户为root。 平台提供了必要的加固措施以保证容器安全、隔离性及数据安全，但由于容器技术本身的限制，仍可能存在容器逃逸等问题，进而导致越权访问。 为避免此类问题发生，请您确保上传镜像来源的合法性、有效性，禁止上传未知来源、恶意程序等非法镜像。
启动作业 通过使用create或 submit命令引用本地的配置文件，启动分析作业。 命令结构 health create job [flags] # create和submit作用相同 health submit job [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明
"region_id": "aaa", //假设区域名称是“aaa” ...... 当接口调用出错时，会返回错误码及错误信息说明，错误响应的Body体格式如下所示 { "error_msg": "The format of message is error"
单击应用图标，弹出编辑图标，单击按钮，设置应用参数。 参数确认无误后，单击界面上方“启动作业”按钮，可以直接基于该流程创建分析作业。 克隆作业 克隆已有的分析作业，作业的参数及流程一并克隆到流程设计器中。克隆作业后，请修改作业的输出数据路径，否则会有覆盖原有作业数据风险。 执行克隆操作有两种方式，请选择任一方式执行。
当涉及多文件/文件夹时，如需确认失败任务的具体错误信息，可参考结果清单文件夹下的失败结果清单文件“cp_failed_report_时间_TaskId.txt”及日志路径下的日志文件。 --e -P 否 指定终端节点。 --i -i 否 指定用户的AK。 --k -k 否 指定用户的SK。 --t -n
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