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指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 使用本地已填写好的流程模板workflow.yaml创建流程。 health create workflow
project id 检查URL中提供的项目ID是否正确。 401 eihealth.03000003 invalid token 检查请求头中的X-Auth-Token是否正确。 401 eihealth.03001003 unauthorized task 检查任务ID是否正确。 401
删除指定作业 功能描述 删除指定作业 命令结构 health nextflow delete job ID 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 不涉及 是 作业id 命令示例 health nextflow delete job f17a3542-3f7c-1
功能描述 停止作业。 命令结构 health nextflow stop job <job-id> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 job-id 不涉及 是 作业id 命令示例 health nextflow stop job f17a3542-3f7c-
-d 否 项目描述。 只有项目所有者和管理员能修改。 --tags -t 否 项目标签,多个标签使用分号(;)分隔。 只有项目所有者和管理员能修改。 --policy -p 否 设置项目级数据权限策略。只有项目所有者能修改。 用数字0和1表示关闭和打开,以data-share、da
功能描述 重试作业。 命令结构 health nextflow retry job <job-id> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 job-id 不涉及 是 作业ID -- params -p 否 本地json/yaml格式参数文件路径 命令示例 health
删除计算资源节点。 命令结构 health delete compute-resources <node id> 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 描述 node id 不涉及 是 计算节点id。 命令示例 删除计算节点 health delete compute-resources
他用户,并限定其他用户的访问权限。项目角色为项目粒度权限控制,同一用户在不同的项目上可能拥有不同的角色。 创建的项目配额请参见配额管理进行查询。详细添加项目成员并分配角色的方法请参见添加项目成员。 父主题: 项目管理
批量复制时的最大并发数,默认为配置文件中的defaultJobs。 --exclude -x 否 不包含源对象的匹配模式,如:*.txt。 支持“*”匹配多个任意字符和“?”匹配单个任意字符,例如abc*.txt代表匹配以abc开头以.txt结尾的任意文件。 您可以使用“\*”代表匹配“*”字符本身,使用“\
修改指定workflow内容(名称不支持修改)。 命令结构 health nextflow edit workflow ID [params] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 无 是 流程id。 --workflow -w 否 本地workflow文件路径,可以是zip或nf文件。 --description
nextflow create job [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --workflow-id -w 是 nextflow作业ID。 --name -n 是 作业名称。 --description -d 否 作业的详细描述信息。 --labels -l
他用户,并限定其他用户的访问权限。项目角色为项目粒度权限控制,同一用户在不同的项目上可能拥有不同的角色。 创建的项目配额请参见配额管理进行查询。详细添加项目成员并分配角色的方法请参见添加项目成员。 父主题: 项目管理
过程一致。 修改yaml模板时,详细的命令和参数请参见应用配置文件说明。 # 详情说明可参考API文档中应用管理-创建应用 app: id: '' # 应用id name: 'demo-app'
返回结果 请求发送以后,您会收到响应,包含:状态码、响应消息头和响应消息体。 状态码 状态码是一组从1xx到5xx的数字代码,状态码表示了请求响应的状态,完整的状态码列表请参见状态码。 对于获取用户Token接口,如果调用后返回状态码为“201”,则表示请求成功。 响应消息头 对
认证信息 获取项目ID、项目、账号信息
附录 状态码 错误码(医疗智能体与盘古辅助制药平台) 错误码(AI辅助药物设计) 获取项目ID 配置OBS访问权限
使用NGS的详细步骤如下所示: 步骤1:订阅流程 步骤2:上传待分析数据 步骤3:创建分析作业 步骤4:查看执行结果 步骤1:订阅流程 使用NGS流程前,需要您在资产市场中订阅该流程。 在“资产市场”中查找“Variant Calling Based On NGS”流程。 单击界面右侧“订阅”图标,订阅该流程。
“\t”,有效数据从第2行开始,跳过文件行数填写为1。 在本地编写.csv、.txt、.vcf文件时,文件编码格式使用UTF-8。 为保证查询性能,建议数据库行数小于500万行,若超过该量级,建议拆分数据库。 导入数据文件大小建议小于1GB。 新增的double类型数据,double的取值范围是-2^1024
命令结构 health delete label [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 描述 list -l 否 删除的标签id列表,json数组格式。 命令示例 health delete label -l "[\"1001\",\"1002\"]" delete
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