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/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/databases/{database_id}/data/{row_num} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String
source_project_id String 源项目id source_database_id String 源数据库id destination_database_id String 引用到项目后的数据库id destination_database_name String 引用到项目后的数据库名称
创建数据库,数据库名称为database_name,选择css集群,上传项目桶中file/test.csv的数据库数据,设置列名为SMILES和NAME,打开共享开关。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/drug/drug-database { "name"
"24dfce53-0303-4b46-a2d9-4a067812b289", "database_name" : "demo-database", "database_id" : "4f7fce53-0303-4b46-a2d9-4a067812b289",
取值范围:输入字符最大长度为255 最大长度:255 database_id 是 String 自动作业依赖的数据库ID 最小长度:1 最大长度:128 database_column 是 String 自动作业状态更新列 最小长度:1 最大长度:55 database_column_type 否 String
"workflow" }, "database_id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "database_name" : "demo-database" } ], "count" : 1 } 状态码
取值范围:输入字符最大长度为255 最大长度:255 database_id 是 String 自动作业依赖的数据库ID 最小长度:1 最大长度:128 database_column 是 String 自动作业状态更新列 最小长度:1 最大长度:55 database_column_type 否 String
"24dfce53-0303-4b46-a2d9-4a067812b289", "database_name" : "demo-database", "database_id" : "4f7fce53-0303-4b46-a2d9-4a067812b289",
"template_id" : "e1ae25a0-070b-41ca-a1a9-3cb8db39e169", "database_name" : "demo-database", "relative_path" : "docking-summary", "output_file_type"
pecaller镜像制作镜像。制作好后的镜像如图1所示,请按照以下步骤将镜像上传至EIHealth平台。 图1 NGS流程镜像 使用命令行工具,使用health switch project <project-name>命令进入待操作的项目。 例如,使用health switch
自动作业结束时间 database_id String 自动作业依赖的数据库ID database_column String 自动作业状态更新列 database_column_type String 自动作业状态更新列的类型,不填默认为EXISTED clean_database_column
配体注释信息数据库,并提供对应的数据库模板。您可以在“数据库”页签单击“shennongProject-database”和“ligandAnnotation-database”数据库查看数据库详情,在“模板”页签单击“shennongProject”和“ligandAnnotation”查看模板详情。
执行分析作业 创建分析作业 登录医疗智能体平台,进入项目并选择“工具 > 流程”页签,单击NGS流程行的“启动作业”。 请参考配置输入和依赖数据章节,设置NGS流程数输入数据。 在新建作业页面,填写作业信息。 基本信息:包含作业名称、标签、描述。 输出路径:存放输出结果的路径,格
创建应用 登录医疗智能体平台,进入项目并选择“工具 > 应用”页签,单击“新建应用”。 图1 新建应用 依据“应用参数说明表”依次创建搭建NGS流程所需的应用。 图2 填充应用内容 对于测序得到的大量数据,如果需要批量执行NGS分析,可以选取以下任意一种方式进行批量执行: 方式一
导入方式选择“上传”,单击“下载示例文件”下载数据库模板示例,编辑后上传模板文件至平台,单击“确定”。 图2 上传模板 模板示例如下: database: name: demo # 模板名称,必填,长度范围[3,32],只能包含字
导入网络数据。导入网络数据时给予消息提示,导入结果给予消息提示。 SUBSCRIBE_DATA 订阅数据。订阅数据时给予消息提示,订阅结果给予消息提示。 DATABASE_IMPORT 导入数据库。导入数据时给予消息提示,导入结果给予消息提示。 JOB_STATUS 作业状态。作业的状态发生跳变时给予消息提示。
新建CPI任务接口 功能介绍 输入蛋白序列、小分子库,创建分子-蛋白互作预测任务。 URI POST /v1/{project_id}/task/cpi 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目id 请求参数 表2 请求Header参数
查询CPI任务 功能介绍 通过CPI任务ID查询CPI任务状态及结果。 URI GET /v1/{project_id}/task/cpi/{task_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目id task_id 是
查询配体文件预览任务 功能介绍 查询配体文件预览任务。 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/preview/{task_id} 表1 路径参数 参数