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IPoIB(Internet Protocol over InfiniBand),指利用物理IB网络(包括服务器上的IB卡、IB连接线、IB交换机等)通过IP协议进行连接,并进行数据传输。 它提供了基于RDMA之上的IP网络模拟层,允许应用无修改的运行在InfiniBand网络上。但是,I
高性能计算(High-performance computing,HPC)是一个计算机集群系统,它通过各种互联技术将多个计算机系统连接在一起,利用所有被连接系统的综合计算能力来处理大型计算问题,所以又通常被称为高性能计算集群。 HPC的业务特点 科学研究、气象预报、仿真实验、生物制药
检查是否已安装IB驱动。 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 执行以下命令,切换为root 用户。 $ sudo su 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令,查询是否已安装IB驱动。 # rpm -qa | grep mlnx-ofa #
ssh目录下,命名为“id_rsa”。 $ cd ~/.ssh $ mv *.pem id_rsa 执行以下命令,给密钥文件配置权限。 $ sudo chmod 600 id_rsa 执行以下命令,查询主机名。 # hostname 执行以下命令,添加本主机私网IP地址和主机名。 # vi /etc/hosts 示例:
STAR-CCM+启动相关问题 STAR-CCM+使用OpenMPI启动时,命令中有"-x"和"--mca"导致启动失败 问题现象: STAR-CCM+使用OpenMPI启动时候命令中同时有"-x"和"--mca"会启动失败,OpenMPI不支持"-x"参数和"--mca"同时使用,报错如下图所示。
普通用户切换至管理员用户,请使用命令sudo su。 前提条件 已成功创建ECS集群,并绑定了弹性IP进行登录。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令,添加集群中所有主机的私网IP地址和主机名。
执行以下命令,设置环境变量。 如果选择自动接受IBM Spectrum MPI安装许可协议,执行以下命令: # export IBM_SPECTRUM_MPI_LICENSE_ACCEPT=yes 如果选择手动接受IBM Spectrum MPI安装许可协议,执行以下命令: # export
#:表示在管理员用户下,执行相关操作。 普通用户切换至管理员用户,请使用命令sudo su。 前提条件 已成功创建BMS,并绑定了弹性IP进行登录。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 将BMS对应的密钥文件(
如果存在多个pkey,使用英文逗号隔开。 执行以下命令,检查环境变量是否配置成功。 # which mpirun 图3 检查环境变量 在单个BMS上运行Platform MPI。 执行以下命令,重新编译hello.c文件。 $ mpicc hello.c -o hello 执行以下命令,在单个BMS上运行Platform
如果存在多个pkey,使用英文逗号隔开。 执行以下命令,检查环境变量是否配置成功。 # which mpirun 图3 Platform MPI环境变量导入成功 执行下列命令,在单个ECS上运行Platform MPI。 执行以下命令,重新编译hello.c文件。 # mpicc hello
集群中所有的BMS,均已安装Spectrum MPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1
集群中所有的BMS,均已安装Spectrum MPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1
集群中所有的BMS,均已安装社区OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1
集群中所有的BMS,均已安装Platform MPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1
集群中所有的BMS,均已安装社区OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1
openmpi-4.0.2a1/lib64 执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。 $ which mpirun 图5 查看IB 驱动自带的Open MPI 环境变量 如果回显如图5所示,表示环境变量配置成功。 执行以下命令,在单台BMS上运行IB驱动自带的Open MPI。
集群中所有的BMS,均已安装IB驱动自带的OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1
集群中所有的BMS,均已安装IB驱动自带的OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1
openmpi-3.1.0rc2/lib64 执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。 $ which mpirun 图3 查看IB驱动自带的Open MPI环境变量 如果回显如图3所示,表示环境变量配置成功。 执行以下命令,在单台BMS上运行IB驱动自带的Open MPI。 $