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128 enum 否 Array of strings 枚举参数的取值列表,列表最大长度20,每一项字符串最长128。参数类型为ENUM时需要填此字段 最小长度:0 最大长度:128 数组长度:0 - 20 表6 AppOutputParameterDto 参数 是否必选 参数类型
128 enum 否 Array of strings 枚举参数的取值列表,列表最大长度20,每一项字符串最长128。参数类型为ENUM时需要填此字段 最小长度:0 最大长度:128 数组长度:0 - 20 表6 AppOutputParameterDto 参数 是否必选 参数类型
清理本地记录的上传文件 上传对象时,支持断点续传功能,本地因此可能会残留上传异常产生的文件,可以使用该命令对异常文件进行清理。 命令结构 health clear [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 upload -u 是 上传文件时,本地生成的断点目录。
使用前一级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用 最小长度:0 最大长度:24 表6 VertexLocationDto 参数 是否必选 参数类型 描述 x 否 Double 子任务的画布横坐标 y 否 Double 子任务的画布纵坐标 表7 TaskParameterDto
使用前一级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用 最小长度:0 最大长度:24 表6 VertexLocationDto 参数 是否必选 参数类型 描述 x 否 Double 子任务的画布横坐标 y 否 Double 子任务的画布纵坐标 表7 TaskParameterDto
Vina Score:代表分子如果添加了靶点,将会计算对接结合能,并按照Vina Score进行排序 Score:代表优化后小分子的综合打分。 Similarity:代表优化后的分子与原始分子的相似度。 QED:代表分子的成药性。 SaScore:代表合成可及性分数,旨在评估分子的合成难易程度。
th)平台会默认开启并且指定相关路径,会覆盖用户侧配置,可以在作业详情页面查询和下载相关信息。相关信息可参考https://www.nextflow.io/docs/latest/tracing.html 对于pod配置,暂不支持用户侧设置。若用户侧设置的情况下可能会导致对应Pr
暂时冻结,待下次重新启动时再激活。处于“冻结”状态的项目,用户无法进入该项目查看项目的开发环境、流程等历史运行情况,当前正在运行的分析作业会继续执行直到完成。冻结的项目可以通过“解冻”操作重新激活。 解冻:解冻项目。 转移:将项目转移给其他用户。“转移”只能由项目所有者发起,并只
转换后文件格式,支持PDB、SDF、MOL2、SMI。 最小长度:0 最大长度:6 表4 ConvertFile 参数 是否必选 参数类型 描述 source 是 String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET
在“项目管理”页面“作业”页签中,以列表形式展示了项目中运行的分析作业和运行状态。您可以查看分析作业名称、标签、所使用的流程名称、版本、运行状态、创建者、创建时间、完成时间和总耗时。并可对作业执行重试、取消、删除、克隆、导出操作。对于列表中的作业,支持通过作业名称、流程名称、标
/v1/{project_id}/task/cpi 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目id 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户 token 表3 请求Body参数 参数
不填默认使用前一级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用 最小长度:0 最大长度:24 表6 VertexLocationDto 参数 参数类型 描述 x Double 子任务的画布横坐标 y Double 子任务的画布纵坐标 表7 TaskParameterDto
序、转录组测序表观遗传学等领域。 该流程以NGS得到的fastq作为输入,通过质控,比对等步骤,输出针对fastq的qc报告,输出STAR比对得到的bam文件。 RNA-Seq流程由fastqc、trimmomatic、star应用构成,各应用说明如表1所示。 表1 应用说明 应用名称
级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用 gpu_type: '' # gpu架构类型,取值范围 ' '|GPU|Snt9|D310。对于流程和作业,不填默认使用前一级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用
[flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 描述 --ids -i 否 要导出的id列表,使用job-id导出作业时必选。 job-id 无 否 作业id。 导出多个job-id时,用分号(;)隔开。 格式:id1;id2;id3。 --file -f 否 要导出的id列表文件,使用job-id文件导出作业时必选。
状态码是一组从1xx到5xx的数字代码,状态码表示了请求响应的状态,完整的状态码列表请参见状态码。 对于获取用户Token接口,如果调用后返回状态码为“201”,则表示请求成功。 响应消息头 对应请求消息头,响应同样也有消息头,如“Content-type”。 表1 公共响应消息头 消息头名称 说明
最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 basic_info DrugJobDto object 作业基本信息。 smiles_list Array of strings 分子表达式列表。 最小长度:1 最大长度:512 数组长度:10
200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 basic_info DrugJobDto object 作业基本信息。 receptors Array of 表14-14 objects 受体文件列表。 数组长度:1 - 100 ligands Array of 表14-15
配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用 gpu_type: '' # gpu架构类型,取值范围 ' '|GPU|Snt9|D310。对于流程和作业,不填默认使用前一级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用
录组测序表观遗传学等领域。 该流程以NGS得到的fastq作为输入,通过质控,比对,得到比对后的bam文件,及对fastq和bam文件的质控报告。 NGS流程由fastp、bwa-mem、picard-insertsize、bamqc应用构成,各应用说明如表1所示。 表1 应用说明