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虚拟药物筛选简介 虚拟药物筛选功能 医疗智能体平台支持根据靶点蛋白和小分子药物的3D结构,计算蛋白与药物之间的结合能量,进而预测小分子是否有成为候选药物的可能性。 虚拟药物筛选可实现如下功能。 整合分子对接结果,生成结合能矩阵。 整合受体与分子对接产生的配体构象,用于可视化展示。
用来设置启动容器时默认运行的命令。 ENTRYPOINT 用来指定容器启动时的默认运行的命令,与CMD类似。区别在于:运行容器时添加在镜像之后的参数,对ENTRYPOINT是拼接,CMD是覆盖。 若在DockerFile中指定了容器启动时的默认运行命令为ls -l,则运行容器时默认启动命令为ls
data-job-id 无 否 数据作业id,不填写时未获取数据作业列表,填写时为获取数据作业详情。 --name -n 否 数据作业名称,根据名称搜索作业,获取数据作业列表时生效。 --type -t 否 数据作业类型,根据类型搜索作业,获取数据作业列表时生效。支持获取以下类型数据: CLONE_DATA
镜像类型 支持系统镜像和自定义镜像。 工作环境 选择系统镜像时,工作环境选择“PY3”。 自定义镜像:当提供的镜像无法满足您的需求时,可以使用自己制作的Notebook镜像。镜像制作方法请参见镜像管理。制作Notebook自定义镜像时,需要依赖平台提供的基础镜像,获取地址请参见获取镜像。
参数说明 参数 简写 是否必选 说明 project-name 无 否 项目名称,在EIHealth平台创建项目时,由用户填写。 指定具体项目名称时,返回此项目的详情信息。 为空时,获取当前用户有权限访问的项目列表。 --current -c 否 同时使用project-name和--
批量删除时,若选择的文件包含禁止删除的文件或文件夹,则这些文件或文件夹会删除失败,其他文件/文件夹删除正常。 恢复数据 平台支持数据的恢复机制,您可以将归档的核心数据进行恢复,避免造成损失。 数据归档成功后,可以在“归档”页面查看归档记录,并进行恢复、删除操作。归档恢复时,您可以将数据恢复至本项目或有权限的其他项目。
format 否 String 文件格式,支持PDB、SDF、MOL2、SMI,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:1 最大长度:6 data 否 String 文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:0 最大长度:10000000 响应参数 状态码: 201 表7 响应Body参数
超时时间:作业运行时间超过设置时间时,认为超时,默认1440分钟,最大可设置为144000分钟,即作业运行至多100天。 加速类型: 加速效率:IO加速>本地盘加速>无 无:作业运行于OBS中,不使用加速。 IO加速:IO加速使用弹性文件服务(SFS)提供高性能的数据读写,作业运行时,会将非最终结果
医疗智能体(EIHealth)基于华为云AI和大数据技术优势,为基因组分析、药物研发、临床研究三个领域提供专业AI研发平台。 产品介绍 用户指南 仅两个按钮时选用 立即使用 成长地图 由浅入深,带您玩转EIHealth 01 了解 医疗智能体(EIHealth)面向基因组分析、药物研发、临床研究三
超时时间:作业运行时间超过设置时间时,认为超时,默认1440分钟,最大可设置为144000分钟,即作业运行至多100天。 加速类型: 加速效率:IO加速>本地盘加速>无 无:作业运行于OBS中,不使用加速。 IO加速:IO加速使用弹性文件服务(SFS)提供高性能的数据读写,作业运行时,会将非最终结果
选择需要复制的文件或文件夹,以及数据存储路径,单击“确认”,复制数据。 例如,将“test.zip”文件复制到“abc”文件夹中。复制数据时可单击图标创建文件夹。 图2 复制数据 下载数据 下载数据操作会产生流量费用,计费方式为按需计费,计费详情请参考OBS数据下载费用。 以下操
项目管理常用操作 对项目执行冻结、解冻、转移、分享和删除操作时,需要项目成员具备相应的权限,不同类型成员所拥有的权限请参见成员角色和权限。 冻结:冻结项目。一个项目可能由于某些原因暂时中止,此时可以将项目暂时冻结,待下次重新启动时再激活。处于“冻结”状态的项目,用户无法进入该项目查看项
Notebook 如何使用Notebook的Terminal功能 如何将Notebook中的数据下载至本地 如何在Notebook中安装外部库
超时时间:作业运行时间超过设置时间时,认为超时,默认1440分钟,最大可设置为144000分钟,即作业运行至多100天。 加速类型: 加速效率:IO加速>本地盘加速>无 无:作业运行于OBS中,不使用加速。 IO加速:IO加速使用弹性文件服务(SFS)提供高性能的数据读写,作业运行时,会将非最终结果
几种不同类型的归档,区别是什么 标准存储 标准存储访问时延低和吞吐量高,因而适用于有大量热点文件(平均一个月多次)或小文件(小于1MB),且需要频繁访问数据的业务场景。 适合高性能,高可靠,高可用,频繁访问场景。 归档存储 归档存储适用于很少访问(平均一年访问一次)数据的业务场景
project时,默认为当前项目。 --yaml和--workflow命令不能同时存在。 --description -d 否 作业的详细描述信息。 --input -i 否 输入参数名称,该参数与流程中的输入参数对应,通过修改--input,修改输入数据。 选择时,input和input-file二选一。
format String 文件格式,支持PDB、SDF、MOL2、SMI,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:1 最大长度:6 data String 文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:0 最大长度:10000000 表8 JobResult 参数 参数类型 描述
cpu分配率百分比 最小值:1 最大值:100 add_nodes_for_cpu_rule 是 Integer 满足扩容策略中cpu分配率时增加的节点数 最小值:1 最大值:50 mem_rule_enable 是 Boolean 是否启用mem规则 mem_percent 是 Integer
超时时间:作业运行时间超过设置时间时,认为超时,默认1440分钟,最大可设置为144000分钟,即作业运行至多100天。 加速类型: 加速效率:IO加速>本地盘加速>无 无:作业运行于OBS中,不使用加速。 IO加速:IO加速使用弹性文件服务(SFS)提供高性能的数据读写,作业运行时,会将非最终结果
么是医疗智能体eihealth-toolkit。数据上传可参考上传数据。。 数据上传成功后可以在数据详情页面查询,创建Nextflow流程时可以通过设置参数指定对应数据。 镜像上传可参考上传镜像。镜像上传成功后可以在镜像详情页面查询,复制其镜像地址填入Nextflow脚本中的container字段即可。