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传至项目中。 输入蛋白质,pdb格式,将要进行对接的所有靶标蛋白放在一个文件夹内。 输入配体小分子,配体小分子为如下格式的txt文件。 第一列为smiles字符串,第二列为smiles名称,中间用tab键分割。 父主题: 运行大规模虚拟药筛任务
列名、描述、类型、允许为空、是否主键、是否可查询、是否唯一、提示和操作信息。单击添加列可新增一列,最多支持100列。单击操作列的图标可以删除列。 列名 列的名称不可以和PostgreSQL 11版本的关键字冲突。 是否主键 主键用于唯一地标识数据表中的信息,可通过设置复合主键将数
基础操作系统类镜像,如Ubuntu、Suse、Centos等。 基础编程语言类镜像,如Java、Python、R语言等。 基础通用类软件镜像,如Tomcat、Mysql、Ngnix等。 获取创建Notebook的镜像 创建Notebook时,平台为您提供了系统镜像和自定义镜像。 系统镜像 工作环境选择PY3版本。
“作业状态更新”中可选“选择已有列”或“新建一列”。 选择“选择已有列”时,需要选择已有列名,已有列名必须为string类型,可以搜索到,并且非主键。 并设置是否“清空作业状态更新列”,状态更新列的值为空的数据才会投递作业。 选择“新建一列”,需要输入新建的列名。 图2 设置作业基本信息
201 表5 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 模板id 请求示例 创建模板,模板名为demo-template,有一列名为colum1,类型为Long,值不可为null,且为主键,可搜索 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud
查询分子生成任务 功能介绍 通过分子生成任务ID查询分子生成任务状态及结果。 URI GET /v1/{project_id}/task/generation/{task_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目id
参数 名称 类型 说明 ligand-smiles-to-3dsdf 输入参数 file-in file 存放配体SMILES列表的文件,第一列为SMILES,第二列为配体名称,以Tab分隔。 输出参数 dir-out directory 转换后存放配体3D sdf文件的文件,默认文件名为3d
过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 health delete database instance 12345678 # 返回结果如下 delete database successfully! 父主题: 数据库管理命令
可参考。 更新单列 health edit database instance xxxx --update -v "`USER_NAME:column1`;`volume1:1`" -n 19; # 返回结果如下 database xxxx update successfully
csv,修改描述为simple database。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/drug/drug-database/{database_id} { "description" : "simple database", "file" :
获取数据库实例列表 health get db instance # 返回结果如下 Database ID Template Source Project Creator Number of Records Created Modified demo-01 xxx template1
/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/databases/{database_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您
/v1/{project_id}/drug/databases/{database_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 database_id 是 String 数据库id。 最小长度:1
删除数据库资源 功能介绍 删除数据库资源 URI DELETE /v1/{project_id}/system/database-resources/{id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。
/v1/{project_id}/drug/databases/{database_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 database_id 是 String 数据库id 最小长度:1
CPI预测 CPI预测基于蛋白质的一级序列和化合物的2D结构进行靶点匹配,精确的预测化合物-蛋白相互作用。 单击“CPI预测”功能卡片,进入配置页面。 配置靶点文件。 支持3种输入方式,分别是输入氨基酸序列、选择文件、输入PDB ID 输入FASTA格式氨基酸序列,输入框最多支持
编辑应用 您可以对已经创建的应用进行编辑,修改对应参数信息。 在应用列表页面,选择需要修改的应用,单击操作列“编辑”。 图1 编辑应用 在编辑应用页面,可以修改相关的参数。相关参数描述可参考新建应用。 如果更改了版本号,相当于新建一个应用。 父主题: 工具管理
查询数据库资源 功能介绍 查询数据库资源 URI GET /v1/{project_id}/system/database-resources 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1
自动作业结束时间 database_id String 自动作业依赖的数据库ID database_column String 自动作业状态更新列 database_column_type String 自动作业状态更新列的类型,不填默认为EXISTED clean_database_column
import file lmx-test-01:/lmx-database/data1.txt 2021-02-01 11:11:27 Import row 2-4 of file lmx-test-01:/lmx-database/data1.txt 下载数据作业执行日志 health