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/v1/{project_id}/task/cpi 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目id 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户 token 表3 请求Body参数 参数
-l 否 代表当次请求获取的最大条数。此参数用于获取作业列表。 默认值:100。 --offset -o 否 代表从哪个位置开始。默认为0。此参数用于获取作业列表。 --jobName -j 否 作业名。此参数用于获取作业列表。 --labels -a 否 按标签筛选列表,标签间用
add_hydrogen 否 Boolean 增加氢原子。 缺省值:false 表4 ReceptorDrugFileReq 参数 是否必选 参数类型 描述 source 是 String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值:
用户已开启的自定义属性集合 表6 CpiResultItem 参数 参数类型 描述 smiles String 分子SMILES表达式 props Array of objects 分子ADMET属性值列表 score Number 分子与蛋白质的打分 表7 CustomProp 参数
单击“确定”,引用其他项目中的数据至本项目。 引用的数据和项目将显示在左侧的数据列表中。 图4 引用的数据 引用OBS类型数据时,如果数据在OBS中的存储类型为“归档存储”,则将该数据引用过来后,该数据不能用于创建分析作业、数据库导入数据,并不可下载、归档。 引用外部OBS桶的数据时,在页面左侧
转换后文件格式,支持PDB、SDF、MOL2、SMI。 最小长度:0 最大长度:6 表4 ConvertFile 参数 是否必选 参数类型 描述 source 是 String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET
最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 basic_info DrugJobDto object 作业基本信息。 smiles_list Array of strings 分子表达式列表。 最小长度:1 最大长度:512 数组长度:10
最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 basic_info 是 CreateDrugJobBasicInfo object 作业基本信息。 smiles_list 否 Array of strings 分子表达式列表。 最小长度:1 最大长度:512
最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 basic_info 是 CreateDrugJobBasicInfo object 创建药物作业基本信息。 smiles 否 String 分子SMILES表达式。 最小长度:1 最大长度:512
200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 basic_info DrugJobDto object 作业基本信息。 receptors Array of 表14-14 objects 受体文件列表。 数组长度:1 - 100 ligands Array of 表14-15
最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 receptor 是 RunReceptorPreprocessReq object 受体蛋白文件。 ligand 是 ReceptorDrugFileReq object 配体小分子文件。 表4 RunReceptorPreprocessReq
最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 basic_info 是 CreateDrugJobBasicInfo object 创建药物作业基本信息。 receptors 是 Array of CpiReceptor objects 受体文件列表。 数组长度:1
upstream_job_info String 上游作业信息。 表5 Progress 参数 参数类型 描述 overall Float 整体进度。 estimated_finish_time Long 预计结束时间,毫秒。 表6 DrugFile 参数 参数类型 描述 source String
最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 basic_info DrugJobDto object 作业基本信息。 smiles String 分子SMILES表达式。 最小长度:1 最大长度:512 molecule_file
objects 用户已开启的自定义属性集合 表6 GenerationResultItem 参数 参数类型 描述 smiles String 分子SMILES表达式 props Array of objects 分子ADMET属性值列表 num_fulfilled_weak_constraints
objects 用户已开启的自定义属性集合 表6 PlainMoleculeItem 参数 参数类型 描述 smiles String 分子SMILES表达式 props Array of objects 分子ADMET属性值列表 表7 OptimizationResultItem
序、转录组测序表观遗传学等领域。 该流程以NGS得到的fastq作为输入,通过质控,比对等步骤,输出针对fastq的qc报告,输出STAR比对得到的bam文件。 RNA-Seq流程由fastqc、trimmomatic、star应用构成,各应用说明如表1所示。 表1 应用说明 应用名称
{query-string} 尽管请求URI包含在请求消息头中,但大多数语言或框架都要求您从请求消息中单独传递它,所以在此单独强调。 表1 请求URI 参数 说明 URI-scheme 传输请求的协议,当前所有API均采用HTTPS协议。 Endpoint 承载REST服务端
录组测序表观遗传学等领域。 该流程以NGS得到的fastq作为输入,通过质控,比对,得到比对后的bam文件,及对fastq和bam文件的质控报告。 NGS流程由fastp、bwa-mem、picard-insertsize、bamqc应用构成,各应用说明如表1所示。 表1 应用说明
-to-pdbqt、receptor-pdb-to-pdbqt、qvina-w、docking-summary应用构成,各应用说明如表1所示。 表1 应用说明 应用名称 说明 ligand-smiles-to-3dsdf 将配体的smiles结构式转换为sdf文件。 ligand-3dsdf-to-pdbqt