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否 描述。 --type -t 否 镜像类型，可选APP、NOTEBOOK或OTHER，不填写默认为OTHER。 --chip -c 否 芯片类型，只支持X86和ARM。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 Windows health
镜像类型，只支持APP或者NOTEBOOK。 --description -d 否 镜像描述。当描述中带有空格时，需要添加引号来获取完整的描述信息。 --chip -c 否 镜像芯片类型，只支持ARM或者X86。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。
单击“下一步”，添加流程文件。 单击“流程文件”后面的“添加”，添加流程文件。 如果流程文件上传的是zip包，则可以选择添加“主文件”。主文件必须为.nf，为压缩文件夹中的文件完整路径。例如：main.nf。若不填写，默认为main.nf。 支持上传的文件格式为nf、 zip，大
存放配体3D sdf文件的文件，默认文件名为3d.sdf。 输出参数 dir-out directory 转换后存放配体pdbqt文件的文件夹。 receptor-pdb-to-pdbqt 输入参数 dir-in directory 受体的pdb文件所在的文件夹。 输出参数 dir-out
workflow_file String 流程的文件名 workflow_file_url String 流程的文件名下载地址 main_file String 主文件名 params_file String 用户上传时使用的参数文件名 params Array of NextflowParamsDto
据集，作为该流程的原始输入。数据集总大小约 216MB。 docking summary测试数据 配体文件：小分子化合物SMILES结构式文件。 受体文件：蛋白3D结构PDB文件。 RNA-Seq测试数据及参考基因组数据集 RNA-Seq-Dataset数据集包含RNA-Seq分
summary中保存有汇总的数据文件。 task-1-ligand 3dsdf to pdbqt：将配体的sdf文件转换为pdbqt文件。 task-2-ligand smiles to 3dsdf：将配体的smiles文件转换为3dsdf文件。 task-3-receptor
通过单击操作列“删除”，可删除对应的流程。 下载流程文件 单击流程名称，进入流程详情页面，单击流程文件后的“下载”，可下载该流程文件。 下载流程参数 单击流程名称，进入流程详情页面，单击流程参数后的“下载”，可下载该流程设置的参数文件。 图1 下载流程文件/参数 父主题： Nextflow
命令行工具并完成配置。 获取NGS作业配置文件 编写NGS作业配置文件有两种方式，建议您使用第一种，通过获取已经执行成功的NGS配置文件，并在该配置文件基础上进行修改，得到可以用于批量执行NGS的配置文件。本示例介绍使用方法一获取配置文件的方法。 方式一 使用EIHealth平台
128 表8 AppInfoDto 参数 参数类型 描述 app_id String 应用id app_name String 应用名称 app_version String 应用版本 app_src_project_name String 应用来源项目名称 app_labels
pdbqt：将配体的sdf文件转换为pdbqt文件。 task-2-ligand smiles to 3dsdf：将配体的smiles文件转换为3dsdf文件。 task-3-receptor pdb to pdbqt：将受体的pdb文件转换为pdbqt文件。 task-4-qvina-w：分子对接。
计算配体间的3D结构差异 创建配体文件预览任务 查询配体文件预览任务 删除配体文件预览任务 创建配体相似性图计算任务 查询配体相似性图计算任务 删除配体相似性图计算任务 根据center、size、padding参数生成可渲染的口袋文件内容 根据表面离散点坐标集生成可渲染的文件内容 将传入的蛋白和小分子拼接成复合物结构
content String 文件内容 download_url String 下载链接 allowed_operate Boolean 可操作标记 缺省值：true deletable Boolean 可删除标记 缺省值：true 请求示例 获取数据详情 https://eihealth
a/目录进行归档，a/目录下最深一级的文件 a/xxxx/xxx./.../obj的总长度不能超过987。 执行归档操作时，若包含禁止删除的文件或文件夹，并打开了删除原数据开关，则被设置为禁止删除的文件或文件夹会删除失败，其他文件或文件夹删除正常。 使用obsutil上传数据，必须加full
数据上传下载请参见数据的上传和下载。 对于非挂载目录以外的目录下的文件，重启Notebook后会消失。例如，上传文件至Notebook的根目录下，该文件并不在被挂载的obs路径中，重启Notebook，该文件会消失。 图3 Upload上传数据 父主题： 资产市场
获取Windows版本的命令行工具，得到health.exe文件，health文件无需安装，放置在任一文件夹中即可。 图1 下载命令行工具 使用win键+R，输入cmd打开windows的cmd窗口。进入工具所在的目录，输入health命令，即可使用。 如果cmd窗口显示目录不是health文件所在目录，请使用cd命令切换路径。例如，切换至D盘：
本示例中以Windows系统为例，介绍安装命令行工具的方法。 获取Windows版本的命令行工具，得到health.exe文件，health文件无需安装，放置在任一文件夹中即可。例如，放到C盘Users文件夹中。 图1 下载命令行工具 使用键盘win键+R，输入cmd，并单击“确定”打开windows的cmd窗口。
订阅和已导入的应用不支持再被导入到别的项目。 命令结构 health import app <app-name:version:source_project_name> [flags] 或 health import app <app-id:source_project_name> [flags] 表1
fastq目录，包含待分析的fastq格式的文件。 fastq-extend string fastq文件后缀<extend>，适配不同的后缀。 read-cmd string 读取输入文件时使用的命令，如读取.gz文件使用zcat，文本文件使用cat。 para-str string
最小长度：3 最大长度：32 relative_path 是 String 生成数据库实例的文件相对路径 最小长度：0 最大长度：1024 output_file_type 是 String 生成数据库实例的文件类型。枚举值：csv、txt、vcf 枚举值： txt vcf csv 响应参数
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